150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_00081 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009976  P9211_00081  transcription antitermination protein NusB  100 
 
 		 211 aa  412  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000149068 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00091  transcription antitermination protein NusB  53.55 
 
 		 211 aa  228  4e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00081  transcription antitermination protein NusB  58.05 
 
 		 208 aa  220  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1336  transcription antitermination protein NusB  58.05 
 
 		 208 aa  220  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00081  transcription antitermination protein NusB  52.71 
 
 		 208 aa  215  2.9999999999999998e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.339041  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00081  transcription antitermination protein NusB  50.74 
 
 		 208 aa  214  9e-55  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00081  transcription antitermination protein NusB  50.25 
 
 		 205 aa  207  7e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.874807  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0009  transcription antitermination protein NusB  48.77 
 
 		 208 aa  205  3e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0010  transcription antitermination protein NusB  50.72 
 
 		 211 aa  202  4e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.728804  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0010  transcription antitermination protein NusB  50.72 
 
 		 211 aa  201  9.999999999999999e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5041  transcription antitermination protein NusB  37.75 
 
 		 212 aa  129  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.264759 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2471  transcription antitermination protein NusB  39.6 
 
 		 213 aa  128  6e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.526539  hitchhiker  0.00000000554853 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1478  transcription antitermination protein NusB  36.82 
 
 		 235 aa  126  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.705133 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1452  transcription antitermination protein NusB  36.82 
 
 		 211 aa  125  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0737  transcription antitermination protein NusB  32.21 
 
 		 207 aa  108  6e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.783199 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0276  transcription antitermination protein NusB  33.98 
 
 		 211 aa  105  6e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4342  transcription antitermination protein NusB  31.34 
 
 		 209 aa  105  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1589  NusB antitermination factor  30.62 
 
 		 213 aa  97.8  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1449  transcription antitermination factor NusB  36.96 
 
 		 156 aa  60.8  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.393092  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0834  NusB antitermination factor  37.08 
 
 		 145 aa  60.5  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000205834  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2727  NusB antitermination factor  35.37 
 
 		 143 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2942  NusB antitermination factor  35.11 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000122519  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2738  NusB antitermination factor  32.89 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0276393  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2922  NusB antitermination factor  32.89 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.179752  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2830  NusB antitermination factor  32.89 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0145632  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1032  NusB antitermination factor  37.35 
 
 		 127 aa  57  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0722  transcription termination factor  25.87 
 
 		 325 aa  55.8  0.0000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1702  NusB antitermination factor  37.8 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.285646 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12640  NusB antitermination factor  36.26 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0537288 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1279  NusB antitermination factor  38.75 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0274165  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2598  NusB antitermination factor  32.63 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.292091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2515  NusB antitermination factor  33.65 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.797905  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1457  NusB antitermination factor  36.47 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0617192  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1534  transcription antitermination protein NusB  32.88 
 
 		 140 aa  53.5  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.276167  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1708  NusB antitermination factor  35.44 
 
 		 147 aa  53.5  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12686 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1215  NusB antitermination factor  32.95 
 
 		 142 aa  53.5  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1061  transcription antitermination factor NusB  33.78 
 
 		 143 aa  52.4  0.000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000379385  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1278  N utilization substance protein B  39.06 
 
 		 143 aa  52  0.000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.279513  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1714  NusB antitermination factor  34.62 
 
 		 145 aa  52  0.000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2325  transcription antitermination protein NusB  30.77 
 
 		 133 aa  52  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000736737  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3504  NusB antitermination factor  32.5 
 
 		 148 aa  52  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000202631  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1693  transcription antitermination protein NusB  28.57 
 
 		 144 aa  51.6  0.000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1905  NusB antitermination factor  35.94 
 
 		 145 aa  51.6  0.000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1020  NusB antitermination factor  35.06 
 
 		 138 aa  51.6  0.000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000376334  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1043  NusB antitermination factor  38.81 
 
 		 144 aa  51.6  0.000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310425  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0847  transcription antitermination protein NusB  27.27 
 
 		 141 aa  51.6  0.000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1424  NusB antitermination factor  32.32 
 
 		 147 aa  51.6  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.132746  normal  0.0757739 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1089  NusB antitermination factor  37.5 
 
 		 143 aa  51.6  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.441067  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0522  NusB antitermination factor  30.95 
 
 		 154 aa  51.2  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.518761  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1185  transcription antitermination protein NusB  39.39 
 
 		 138 aa  51.2  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0066267  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4292  transcription antitermination protein NusB  27.5 
 
 		 130 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0942  transcription antitermination protein NusB  27.5 
 
 		 130 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0063504 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08000  transcription antitermination factor NusB  28.75 
 
 		 183 aa  50.4  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000357479 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1713  transcription antitermination protein NusB  34.57 
 
 		 144 aa  50.8  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2875  transcription antitermination protein NusB  24.79 
 
 		 130 aa  50.8  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0967797  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2006  NusB antitermination factor  35.8 
 
 		 136 aa  50.1  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000909018 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4255  transcription antitermination protein NusB  27.5 
 
 		 130 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4086  transcription antitermination protein NusB  27.5 
 
 		 130 aa  50.1  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0398427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3924  transcription antitermination protein NusB  27.5 
 
 		 130 aa  50.1  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3935  transcription antitermination protein NusB  27.5 
 
 		 130 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0242683  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4406  transcription antitermination protein NusB  27.5 
 
 		 130 aa  50.1  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05250  transcription antitermination factor NusB  29 
 
 		 162 aa  50.1  0.00003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.615049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4034  transcription antitermination protein NusB  27.5 
 
 		 130 aa  49.7  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1059  transcription antitermination protein NusB  29.89 
 
 		 142 aa  49.7  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2539  NusB antitermination factor  32.63 
 
 		 195 aa  50.1  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4312  transcription antitermination protein NusB  27.5 
 
 		 130 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4202  transcription antitermination protein NusB  27.5 
 
 		 130 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000627912 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1521  NusB antitermination factor  36.84 
 
 		 145 aa  49.3  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000719098  normal  0.286205 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0096  transcription antitermination protein NusB  30.68 
 
 		 141 aa  49.3  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3020  NusB antitermination factor  33.33 
 
 		 145 aa  49.3  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.532849  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1001  NusB antitermination factor  28.45 
 
 		 134 aa  49.3  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000103946  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3205  NusB antitermination factor  32 
 
 		 135 aa  48.9  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.073957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1304  NusB antitermination factor  30.39 
 
 		 145 aa  48.9  0.00005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.592114  normal  0.0232631 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1295  NusB antitermination factor  31.17 
 
 		 143 aa  48.9  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0457508  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1839  NusB antitermination factor  32.61 
 
 		 138 aa  48.9  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.156187  normal  0.178844 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1333  transcription antitermination protein NusB  35.62 
 
 		 131 aa  48.5  0.00006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2394  NusB antitermination factor  35 
 
 		 145 aa  48.9  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1069  NusB antitermination factor  32.56 
 
 		 143 aa  48.5  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269454  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15520  transcription antitermination factor NusB  32.29 
 
 		 153 aa  48.5  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.332818  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1230  NusB antitermination factor  33.33 
 
 		 145 aa  48.5  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000275849 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2075  NusB antitermination factor  31.17 
 
 		 154 aa  48.5  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.248305  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0083  transcription termination factor  31.82 
 
 		 190 aa  48.5  0.00007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3091  NusB antitermination factor  33.33 
 
 		 165 aa  48.5  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10765 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5248  NusB antitermination factor  32.26 
 
 		 139 aa  48.1  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0750  transcription termination factor  27.2 
 
 		 133 aa  47.4  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.906803  hitchhiker  0.00118755 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1616  NusB antitermination factor  34.43 
 
 		 137 aa  48.1  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.686883  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2269  NusB antitermination factor  31.91 
 
 		 136 aa  48.1  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.190221  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1860  NusB antitermination factor  33.33 
 
 		 153 aa  48.1  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1053  transcription antitermination protein NusB  28.74 
 
 		 142 aa  47.8  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2438  transcription antitermination factor NusB  29.2 
 
 		 154 aa  47  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.841246  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3751  transcription antitermination protein NusB  38.6 
 
 		 164 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.110762 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2372  NusB antitermination factor  28.17 
 
 		 152 aa  46.6  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1002  NusB antitermination factor  23.85 
 
 		 151 aa  47  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0470  NusB antitermination factor  35.59 
 
 		 167 aa  47  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.246877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2359  transcription antitermination protein NusB  38.98 
 
 		 162 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.600142  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2032  NusB antitermination factor  31.52 
 
 		 153 aa  46.2  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0272583 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0058  NusB antitermination factor  31.17 
 
 		 154 aa  46.6  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233824  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2406  transcription antitermination protein NusB  38.98 
 
 		 162 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.798177  normal  0.0506261 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2652  transcription antitermination protein NusB  33.33 
 
 		 163 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2400  transcription antitermination protein NusB  38.98 
 
 		 162 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.199761 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>