153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4623 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_4623  hypothetical protein  100 
 
 		 334 aa  674    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2416  hypothetical protein  28.53 
 
 		 359 aa  137  3.0000000000000003e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.186903  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0363  paraquat-inducible protein B  28.01 
 
 		 572 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.364646  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2635  hypothetical protein  27.19 
 
 		 328 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3376  hypothetical protein  26.8 
 
 		 559 aa  119  6e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.166606  normal  0.0325483 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1960  hypothetical protein  26.33 
 
 		 327 aa  119  9e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0139154  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0668  hypothetical protein  27.38 
 
 		 330 aa  113  5e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2893  Mammalian cell entry related domain protein  27.42 
 
 		 548 aa  105  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.3428  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2447  hypothetical protein  26.17 
 
 		 323 aa  102  9e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.106785  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0579  hypothetical protein  28.28 
 
 		 546 aa  101  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.30623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3499  hypothetical protein  30.61 
 
 		 324 aa  100  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1983  hypothetical protein  26.72 
 
 		 343 aa  97.4  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.042136  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1713  hypothetical protein  28.45 
 
 		 356 aa  97.4  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000187754 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3242  Mammalian cell entry related domain protein  26.73 
 
 		 555 aa  96.7  5e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3138  hypothetical protein  24.93 
 
 		 322 aa  96.3  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.448864  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2679  hypothetical protein  27.61 
 
 		 546 aa  95.9  8e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.331347  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1230  Mammalian cell entry related domain protein  30.26 
 
 		 322 aa  95.9  8e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.16167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3015  hypothetical protein  26.25 
 
 		 329 aa  94.4  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.231252  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2000  Mammalian cell entry related domain protein  27.83 
 
 		 558 aa  94  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.939676  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1015  hypothetical protein  27.16 
 
 		 321 aa  93.2  5e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0403  hypothetical protein  25.17 
 
 		 545 aa  91.3  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2221  Mammalian cell entry related domain protein  26.82 
 
 		 556 aa  91.3  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000538523 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0257  hypothetical protein  25.41 
 
 		 543 aa  91.7  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0530  Mammalian cell entry related domain protein  27.36 
 
 		 547 aa  90.9  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44090  PqiB family protein  26.97 
 
 		 537 aa  90.9  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.760607  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0040  Mammalian cell entry related domain protein  26.21 
 
 		 327 aa  89.7  7e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0517  Mammalian cell entry related domain protein  27.04 
 
 		 547 aa  89  9e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1496  Mammalian cell entry related domain protein  27.18 
 
 		 335 aa  89.4  9e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.024979  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1056  Mammalian cell entry related domain protein  24.33 
 
 		 322 aa  89  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5802  hypothetical protein  26.21 
 
 		 531 aa  88.2  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00328946  hitchhiker  0.0014272 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1320  Mammalian cell entry related domain protein  24.37 
 
 		 337 aa  87.8  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5278  hypothetical protein  24.92 
 
 		 531 aa  86.3  7e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3535  hypothetical protein  26.91 
 
 		 531 aa  85.9  9e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.128458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2580  hypothetical protein  25.57 
 
 		 551 aa  85.9  9e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.732971 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0601  hypothetical protein  25.25 
 
 		 547 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.184325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2535  hypothetical protein  24.83 
 
 		 544 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0466  Mammalian cell entry related domain protein  29.41 
 
 		 337 aa  84  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2127  putative paraquat-inducible transmembrane protein, PqiB  26.18 
 
 		 539 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460028  normal  0.102127 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0602  hypothetical protein  23.36 
 
 		 539 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.483664  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0626  hypothetical protein  23.36 
 
 		 539 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.735429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0040  paraquat-inducible protein  24.58 
 
 		 569 aa  82  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00684202  normal  0.214843 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2831  hypothetical protein  24.44 
 
 		 551 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2751  paraquat-inducible ABC-type transporter, periplasmic component  24.38 
 
 		 326 aa  81.6  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1268  paraquat-inducible protein B  24.1 
 
 		 551 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1072  hypothetical protein  23.33 
 
 		 309 aa  81.3  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2674  hypothetical protein  24.42 
 
 		 539 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.531712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0709  Mammalian cell entry related domain protein  24.33 
 
 		 552 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.381837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0328  Mammalian cell entry related domain protein  23.51 
 
 		 552 aa  80.1  0.00000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2378  paraquat-inducible protein B  24.01 
 
 		 553 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.154964  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2577  hypothetical protein  24.43 
 
 		 546 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0122207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3382  paraquat-inducible protein  24.01 
 
 		 551 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0292  paraquat-inducible protein B  24.01 
 
 		 551 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1154  paraquat-inducible protein B  24.01 
 
 		 551 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3340  paraquat-inducible protein B  24.01 
 
 		 551 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.440052  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3374  mce family protein  24.01 
 
 		 551 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2561  mce family protein  24.01 
 
 		 551 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3288  hypothetical protein  24.18 
 
 		 546 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4000  putative paraquat-inducible protein  24.33 
 
 		 552 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.113556  normal  0.829107 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3139  hypothetical protein  24.1 
 
 		 546 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.667877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2074  hypothetical protein  29.64 
 
 		 550 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0955309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2722  paraquat-inducible protein B  27.34 
 
 		 550 aa  77  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0227  hypothetical protein  24.04 
 
 		 539 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0711  hypothetical protein  24.04 
 
 		 539 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0678  hypothetical protein  24.04 
 
 		 539 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0419217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4088  paraquat-inducible protein B  24 
 
 		 508 aa  76.6  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.141129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0651  hypothetical protein  22.67 
 
 		 534 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.1317  normal  0.879007 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3799  hypothetical protein  23.68 
 
 		 539 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.660029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5506  hypothetical protein  23.83 
 
 		 533 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.286213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3509  fibronectin, type III  24.39 
 
 		 537 aa  75.5  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.736082  normal  0.990532 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2114  Mammalian cell entry related domain protein  24.5 
 
 		 539 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2008  hypothetical protein  25.38 
 
 		 547 aa  72.8  0.000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2562  hypothetical protein  29.89 
 
 		 558 aa  72.4  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0758211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1352  paraquat-inducible protein B  26.78 
 
 		 547 aa  71.2  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273869  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1683  paraquat-inducible protein B  26.24 
 
 		 548 aa  70.9  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2549  paraquat-inducible protein B  24.81 
 
 		 550 aa  70.1  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0824615  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1990  paraquat-inducible protein B  24.81 
 
 		 550 aa  70.1  0.00000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2638  paraquat-inducible protein B  24.81 
 
 		 550 aa  70.1  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2067  paraquat-inducible protein B  24.42 
 
 		 546 aa  69.3  0.00000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.883854  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1323  Mammalian cell entry related domain protein  22.3 
 
 		 561 aa  69.3  0.00000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.404082  normal  0.550075 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5822  hypothetical protein  25.81 
 
 		 431 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.324893  normal  0.303543 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1105  paraquat-inducible protein B  23.57 
 
 		 546 aa  68.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.486337  normal  0.0294366 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1022  paraquat-inducible protein B  23.57 
 
 		 546 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00119913  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1445  Mammalian cell entry related domain protein  27.68 
 
 		 547 aa  69.3  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.578149  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1173  paraquat-inducible protein B  23.57 
 
 		 546 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.371767  normal  0.608659 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1920  hypothetical protein  28.77 
 
 		 554 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.976156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1463  paraquat-inducible protein B  24.09 
 
 		 545 aa  68.6  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0560595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1127  paraquat-inducible protein B  23.57 
 
 		 546 aa  68.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0201216  normal  0.953621 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1139  paraquat-inducible protein B  23.57 
 
 		 546 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0102675  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1794  paraquat-inducible protein B  23.64 
 
 		 555 aa  68.6  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3045  PqiB family protein  23.93 
 
 		 559 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.114944  normal  0.0226159 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1652  paraquat-inducible protein B  24.16 
 
 		 548 aa  68.2  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1865  hypothetical protein  27.13 
 
 		 554 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0867784 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2113  hypothetical protein  27.13 
 
 		 554 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.696493  normal  0.025726 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00955  paraquat-inducible protein B  23.19 
 
 		 546 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000262354  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2692  Mammalian cell entry related domain protein  23.19 
 
 		 546 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000610454  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3179  PqiB family protein  23.61 
 
 		 559 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.360667  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00962  hypothetical protein  23.19 
 
 		 546 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000379419  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1060  paraquat-inducible protein B  23.19 
 
 		 546 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012177  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1066  paraquat-inducible protein B  23.19 
 
 		 546 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000823988  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2645  paraquat-inducible protein B  23.19 
 
 		 546 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000298494  hitchhiker  0.00000476211 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>