220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4591 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_4591  hypothetical protein  100 
 
 
446 aa  893    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.89176  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1190  protein of unknown function DUF147  32.52 
 
 
456 aa  193  4e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2555  hypothetical protein  34.06 
 
 
277 aa  154  4e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.338009  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1293  protein of unknown function DUF147  33.56 
 
 
294 aa  153  5e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.964954  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1394  protein of unknown function DUF147  33.56 
 
 
294 aa  153  5e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0782856  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1308  hypothetical protein  34.26 
 
 
294 aa  146  6e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.832333  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1616  putative PAS/PAC sensor protein  42.07 
 
 
559 aa  135  1.9999999999999998e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.477909  normal  0.117342 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1317  protein of unknown function DUF147  44.83 
 
 
649 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.521946  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1053  hypothetical protein  47.45 
 
 
197 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.593896  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1579  hypothetical protein  28.22 
 
 
291 aa  126  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0723  hypothetical protein  36.57 
 
 
310 aa  125  1e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0286471 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0788  hypothetical protein  34.82 
 
 
310 aa  125  1e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0310  hypothetical protein  47.22 
 
 
288 aa  124  3e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1195  hypothetical protein  36.11 
 
 
310 aa  124  4e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1780  hypothetical protein  46.38 
 
 
443 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1210  putative PAS/PAC sensor protein  38.51 
 
 
540 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0526078  normal  0.0174457 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0099  hypothetical protein  35.65 
 
 
310 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.892669  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0489  hypothetical protein  39.39 
 
 
268 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1389  hypothetical protein  38.31 
 
 
293 aa  117  3e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0634969  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0839  hypothetical protein  41.92 
 
 
270 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.286364  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0301  protein of unknown function DUF147  32.84 
 
 
268 aa  111  3e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0317825  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2466  protein of unknown function DUF147  34.18 
 
 
270 aa  109  8.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0504  protein of unknown function DUF147  34.69 
 
 
270 aa  107  4e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.294711  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1944  protein of unknown function DUF147  39.13 
 
 
265 aa  106  8e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0381023  normal  0.0659541 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3381  hypothetical protein  43.22 
 
 
195 aa  103  4e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.270651 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1442  protein of unknown function DUF147  32.84 
 
 
269 aa  103  9e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2246  protein of unknown function DUF147  37.76 
 
 
269 aa  102  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.217243 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0075  protein of unknown function DUF147  33.33 
 
 
265 aa  93.2  9e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.104264  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1577  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  38.13 
 
 
157 aa  68.6  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.354162  normal  0.179796 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1503  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  34.01 
 
 
149 aa  68.9  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.19999  hitchhiker  0.00280102 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2395  phosphoenolpyruvate-dependent sugar phosphotransferase system EIIA 2  30.89 
 
 
235 aa  60.8  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2757  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  28.67 
 
 
153 aa  60.8  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.139063  normal  0.0278933 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1079  DNA-binding protein/PTS system, IIA component  30.09 
 
 
201 aa  60.1  0.00000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1726  fusion of IIA, IIB and IIC component of mannitol/fructose-specific phosphotransferase system mannitol/fructose-specific  32.09 
 
 
661 aa  59.7  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0724  PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  29.51 
 
 
158 aa  58.2  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1573  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  28.91 
 
 
153 aa  57.8  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0372  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  35.16 
 
 
156 aa  57.8  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.207714 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1936  phosphotransferase system enzyme IIA, regulates nitrogen metabolism  29.77 
 
 
153 aa  57.4  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2726  PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  31.29 
 
 
155 aa  57  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.237355  normal  0.13992 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2503  PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  31.29 
 
 
155 aa  57  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.499236  normal  0.398779 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0855  PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  30.34 
 
 
154 aa  56.6  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.767445  normal  0.971447 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0836  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  29.17 
 
 
154 aa  55.8  0.000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2431  PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  32.06 
 
 
155 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.296466  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2970  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  36.21 
 
 
156 aa  55.1  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.28184  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2667  sodium/hydrogen exchanger  29.53 
 
 
767 aa  55.1  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1773  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  30.08 
 
 
149 aa  54.7  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0893248  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1746  Osmosensitive K channel His kinase sensor  24.62 
 
 
553 aa  54.7  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0300  PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  32.67 
 
 
164 aa  53.9  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.684561  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0425  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  32.77 
 
 
149 aa  53.5  0.000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0194997 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0014  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  27.43 
 
 
154 aa  53.5  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000106322 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2067  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  36.27 
 
 
153 aa  53.5  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0225  PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  36.04 
 
 
156 aa  53.5  0.000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.357247 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1599  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  29.92 
 
 
149 aa  53.1  0.000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0148  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  27.7 
 
 
149 aa  52.8  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0179648  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57960  nitrogen regulatory IIA protein  24.49 
 
 
154 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0614  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  30.08 
 
 
153 aa  52.4  0.00001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03833  fused predicted PTS enzymes: Hpr component/enzyme I component/enzyme IIA component  27.88 
 
 
833 aa  52  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4038  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  27.88 
 
 
833 aa  52  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0359  PTS system, fructose-specific IIABC components  27.01 
 
 
650 aa  52.4  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0406  putative nitrogen regulatory IIA (enzyme IIA-Ntr) (phosphotransferase enzyme II, A component) transcription regulator protein  29.7 
 
 
151 aa  52  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.275457 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4182  multi-phosphoryl transfer protein 2  27.88 
 
 
833 aa  52  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4487  multi-phosphoryl transfer protein 2  27.88 
 
 
833 aa  52  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0577  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  25 
 
 
148 aa  52  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000200384  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5408  multi-phosphoryl transfer protein 2  27.88 
 
 
833 aa  52  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1150  PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  33.06 
 
 
155 aa  52  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.391401  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0261  PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  29.7 
 
 
151 aa  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03782  hypothetical protein  27.88 
 
 
833 aa  52  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0288  PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  29.7 
 
 
151 aa  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.958173  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2758  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  29.63 
 
 
156 aa  51.6  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4434  multi-phosphoryl transfer protein 2  27.88 
 
 
833 aa  52  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4068  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  27.88 
 
 
833 aa  52  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4961  PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  32.77 
 
 
156 aa  51.6  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2795  phosphoenolpyruvate-dependent sugar phosphotransferase system, EIIA 2  33.33 
 
 
161 aa  51.2  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4262  sodium/hydrogen exchanger  32.73 
 
 
741 aa  51.2  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.387435  normal  0.153793 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4395  multi-phosphoryl transfer protein 2  27.88 
 
 
833 aa  50.8  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.963786 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0824  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  28 
 
 
149 aa  50.8  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12770  PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein  28.97 
 
 
154 aa  50.4  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3180  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.32 
 
 
150 aa  50.4  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0640  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  22.86 
 
 
150 aa  50.1  0.00008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.229714  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3793  PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  36.19 
 
 
157 aa  50.1  0.00008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0564  PTS system, IIA component  32.74 
 
 
165 aa  49.7  0.00009  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.130036  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1968  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  33.33 
 
 
153 aa  50.1  0.00009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00203229  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4516  multiphosphoryl transfer protein 2  26.92 
 
 
829 aa  50.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000995524 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4442  multiphosphoryl transfer protein 2  26.92 
 
 
829 aa  50.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.557149 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0950  PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  29.66 
 
 
154 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.740321  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0472  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  35.64 
 
 
156 aa  49.7  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0237  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  28 
 
 
154 aa  49.7  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2191  PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  32.5 
 
 
155 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.127262  normal  0.65398 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0111  PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  27.5 
 
 
153 aa  49.3  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0957  PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  29.66 
 
 
154 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0460537  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0989  PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  29.66 
 
 
154 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2109  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  27.21 
 
 
175 aa  48.9  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000418392  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4318  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  36.46 
 
 
152 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.243139  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1512  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  34.12 
 
 
623 aa  48.9  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350477  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5037  nitrogen regulatory IIA protein  23.13 
 
 
154 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.274157  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3090  nitrogen regulatory IIA protein  26.09 
 
 
147 aa  48.5  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.233626  normal  0.137697 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4296  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  36.46 
 
 
152 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0327558  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2394  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  25.87 
 
 
618 aa  48.1  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.123557  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4545  PTS system, nitrogen regulatory IIA component  27.03 
 
 
150 aa  47.8  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0160  PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  34.29 
 
 
153 aa  47.8  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>