More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4574 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_1810  sodium/hydrogen exchanger  54.22 
 
 		 771 aa  762    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4574  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 764 aa  1499    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.520226 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4597  sodium/hydrogen exchanger  42.67 
 
 		 777 aa  511  1e-143  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72940  putative sodium/proton antiporter  32.77 
 
 		 585 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5404  sodium/hydrogen exchanger  33.73 
 
 		 586 aa  266  1e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115045 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5355  sodium/hydrogen exchanger  34.14 
 
 		 586 aa  265  3e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.547992 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5133  sodium/hydrogen exchanger  33.94 
 
 		 586 aa  264  4e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.322747 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5263  sodium/hydrogen exchanger  33.73 
 
 		 586 aa  263  6.999999999999999e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.680967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3551  sodium/hydrogen exchanger  27.88 
 
 		 741 aa  263  6.999999999999999e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.994377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0953  CPA2 family Na(+)/H(+) antiporter  33.87 
 
 		 585 aa  263  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.238119  normal  0.80164 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6330  putative sodium/proton antiporter  32.71 
 
 		 585 aa  261  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0716  sodium/hydrogen exchanger  34 
 
 		 585 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.355706  normal  0.655046 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5648  Sodium/hydrogen exchanger  34.06 
 
 		 587 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00653645 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0821  Na+/H+ antiporter  27.23 
 
 		 741 aa  254  4.0000000000000004e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0612935  normal  0.436267 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5068  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.87 
 
 		 587 aa  252  2e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5519  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.67 
 
 		 587 aa  249  2e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3034  sodium/hydrogen exchanger  34.02 
 
 		 585 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0555922  hitchhiker  0.00545855 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2576  sodium/hydrogen exchanger  26.19 
 
 		 757 aa  246  1.9999999999999999e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3333  sodium/hydrogen exchanger  27.87 
 
 		 747 aa  243  1e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.7052  hitchhiker  0.00474985 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5016  sodium/hydrogen exchanger  27.56 
 
 		 745 aa  241  2.9999999999999997e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1130  sodium/hydrogen exchanger  28.42 
 
 		 586 aa  232  2e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.496723 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1614  sodium/hydrogen exchanger  34.1 
 
 		 710 aa  210  1e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.051901  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1390  sodium/hydrogen exchanger  35.19 
 
 		 782 aa  201  3.9999999999999996e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3086  Sodium/hydrogen exchanger  25.66 
 
 		 773 aa  175  2.9999999999999996e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.982722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2967  sodium/hydrogen exchanger  32.03 
 
 		 762 aa  157  8e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.619834 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0754  sodium/hydrogen exchanger  31.12 
 
 		 598 aa  143  9.999999999999999e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.835162  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1987  sodium/hydrogen exchanger  30.25 
 
 		 667 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0275155 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4016  sodium/hydrogen exchanger  29.64 
 
 		 775 aa  139  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00920037  hitchhiker  0.000000797462 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1509  sodium/hydrogen exchanger  28.07 
 
 		 567 aa  139  2e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1461  sodium/hydrogen exchanger  31.25 
 
 		 636 aa  139  2e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.297602  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0257  sodium/hydrogen exchanger  30.43 
 
 		 674 aa  139  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0120325  normal  0.149917 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4527  sodium/hydrogen exchanger  25.93 
 
 		 671 aa  139  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.436513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0855  sodium/hydrogen exchanger  28.79 
 
 		 674 aa  138  4e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0221534  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1119  sodium/hydrogen exchanger  31.48 
 
 		 741 aa  138  5e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1076  sodium/hydrogen exchanger  30.31 
 
 		 665 aa  137  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.886506 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1047  sodium/hydrogen exchanger  30.31 
 
 		 665 aa  137  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0023  sodium/hydrogen exchanger  25.93 
 
 		 673 aa  137  7.000000000000001e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486087 
 
 
-
 
NC_002936  DET1627  sodium/hydrogen exchanger family protein  28.34 
 
 		 567 aa  136  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.510205  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1188  hypothetical protein  28.29 
 
 		 682 aa  135  3e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0275042 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72800  putative potassium efflux transporter  29.63 
 
 		 567 aa  135  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1420  sodium/hydrogen exchanger  29.77 
 
 		 771 aa  134  5e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1372  sodium/hydrogen exchanger  28.34 
 
 		 567 aa  134  6e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1963  sodium/hydrogen exchanger  31.23 
 
 		 684 aa  134  6e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000770592  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3140  potassium efflux system protein  29.6 
 
 		 566 aa  134  9e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.138229  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1204  sodium/hydrogen exchanger family protein  24.6 
 
 		 697 aa  133  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0446  sodium/hydrogen exchanger  28.1 
 
 		 441 aa  133  1.0000000000000001e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000379549 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1281  sodium/hydrogen exchanger  30.81 
 
 		 572 aa  132  2.0000000000000002e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.330977  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1631  sodium/hydrogen exchanger  29.01 
 
 		 665 aa  132  3e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0806  sodium/hydrogen exchanger  27.37 
 
 		 666 aa  131  4.0000000000000003e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6319  putative potassium efflux transporter  29.44 
 
 		 568 aa  131  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.168195  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1651  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  29.29 
 
 		 671 aa  131  5.0000000000000004e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.899858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0711  sodium/hydrogen exchanger  27.72 
 
 		 581 aa  131  5.0000000000000004e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1345  cation:proton antiporter  30.57 
 
 		 572 aa  130  9.000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.267602  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2797  potassium efflux system protein  29.82 
 
 		 648 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.488143 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0258  sodium/hydrogen exchanger  28.64 
 
 		 573 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0181  sodium/hydrogen exchanger  31.61 
 
 		 665 aa  128  5e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0543  sodium/hydrogen exchanger  28.43 
 
 		 631 aa  128  5e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.015433 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01936  cation:proton antiporter  30.98 
 
 		 569 aa  127  7e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1647  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  28.87 
 
 		 648 aa  127  8.000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0658  potassium efflux system protein  29.72 
 
 		 555 aa  126  1e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3417  potassium efflux system protein  30.39 
 
 		 652 aa  125  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00166015  normal  0.19535 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0292  sodium/hydrogen exchanger  28.4 
 
 		 606 aa  125  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1301  sodium/hydrogen exchanger  30.81 
 
 		 693 aa  124  5e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0602  sodium/hydrogen exchanger  28.5 
 
 		 667 aa  124  7e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.616152  normal  0.0415752 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0261  sodium/hydrogen exchanger family protein  29.53 
 
 		 588 aa  123  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6115  Sodium/hydrogen exchanger  28.92 
 
 		 668 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1468  potassium efflux system protein  28.02 
 
 		 648 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2884  potassium efflux system protein  28.02 
 
 		 648 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  normal  0.0157932 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4116  putative glutathione-regulated potassium efflux system protein  28.5 
 
 		 666 aa  124  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1463  potassium efflux system protein  28.02 
 
 		 648 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0505  sodium/hydrogen exchanger  29.9 
 
 		 584 aa  123  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2623  potassium efflux system protein  29.58 
 
 		 648 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669117 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2690  potassium efflux system protein  29.58 
 
 		 648 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000490638 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3938  sodium/hydrogen exchanger  24.88 
 
 		 652 aa  123  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1991  sodium/hydrogen exchanger  25.63 
 
 		 666 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000714201 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0323  sodium/hydrogen exchanger  28.4 
 
 		 606 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.569683 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1499  potassium efflux system protein  28.02 
 
 		 648 aa  122  3e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1736  potassium efflux system protein  28.43 
 
 		 556 aa  121  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2956  sodium/hydrogen exchanger  28.28 
 
 		 654 aa  121  4.9999999999999996e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.356807  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3853  sodium/hydrogen exchanger  30.43 
 
 		 583 aa  120  9e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0988  sodium/hydrogen exchanger  27.75 
 
 		 676 aa  120  9e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4482  sodium/hydrogen exchanger  29.1 
 
 		 388 aa  120  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4238  sodium/hydrogen exchanger  30.36 
 
 		 656 aa  120  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3434  sodium/hydrogen exchanger  29.53 
 
 		 577 aa  119  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.106813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1159  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  27.91 
 
 		 648 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1611  sodium/hydrogen exchanger  30.28 
 
 		 660 aa  119  1.9999999999999998e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4884  sodium/hydrogen exchanger family protein  29.58 
 
 		 407 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1325  potassium efflux system family protein  31.46 
 
 		 619 aa  119  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.113614  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0332  sodium/hydrogen exchanger  28.61 
 
 		 667 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4572  sodium/hydrogen exchanger  29.31 
 
 		 407 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1105  Sodium/hydrogen exchanger  30.13 
 
 		 672 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107002  normal  0.0477197 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1285  potassium efflux system family protein  31.46 
 
 		 619 aa  119  1.9999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.433895  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2614  potassium efflux system protein  28.32 
 
 		 649 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4492  Na+/H+ antiporter  29.58 
 
 		 407 aa  119  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4863  sodium/hydrogen exchanger family protein  29.58 
 
 		 407 aa  118  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1760  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.33 
 
 		 654 aa  118  3.9999999999999997e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.303253  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2617  potassium efflux system protein  28.21 
 
 		 649 aa  118  3.9999999999999997e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1853  sodium/hydrogen exchanger  30.52 
 
 		 688 aa  118  3.9999999999999997e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000204486  normal  0.40293 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2703  sodium/hydrogen exchanger  28.84 
 
 		 670 aa  118  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.135864 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1293  potassium efflux system protein  26.99 
 
 		 650 aa  118  3.9999999999999997e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>