More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4547 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_4547  camphor resistance protein CrcB  100 
 
 
132 aa  255  1e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73644  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0975  camphor resistance protein CrcB  59.69 
 
 
131 aa  158  3e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00880668 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0236  camphor resistance protein CrcB  57.6 
 
 
129 aa  140  8e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.966722  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3612  CrcB protein  51.97 
 
 
142 aa  117  3.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0121733  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4479  CrcB protein  50.41 
 
 
143 aa  117  6e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29462  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3454  hypothetical protein  50 
 
 
136 aa  116  9e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.767422  normal  0.0839513 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2689  crcB protein  48.09 
 
 
142 aa  114  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129795  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2948  hypothetical protein  49.61 
 
 
270 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.448115  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2690  camphor resistance protein CrcB  53.78 
 
 
131 aa  106  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.190372  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  46.55 
 
 
123 aa  101  3e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2648  CrcB protein  47.15 
 
 
140 aa  100  5e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0838344  normal  0.517536 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0817  camphor resistance protein CrcB  48.28 
 
 
133 aa  99.8  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0885  CrcB protein  47.62 
 
 
138 aa  99.8  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.780931 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0767  camphor resistance protein CrcB  48.28 
 
 
133 aa  99  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  45.6 
 
 
124 aa  97.4  6e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  44.8 
 
 
124 aa  96.7  9e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  44 
 
 
124 aa  96.7  9e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  44 
 
 
124 aa  96.7  9e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  44 
 
 
124 aa  96.7  9e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  44.8 
 
 
124 aa  96.7  9e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  44 
 
 
124 aa  96.7  9e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  44.8 
 
 
124 aa  96.7  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  44.8 
 
 
124 aa  96.7  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  44.44 
 
 
124 aa  96.3  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2949  camphor resistance protein CrcB  47.93 
 
 
131 aa  95.9  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.478651  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1258  camphor resistance protein CrcB  45.24 
 
 
124 aa  95.5  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.415853  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  43.65 
 
 
124 aa  95.1  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  46.34 
 
 
140 aa  94.7  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2599  camphor resistance protein CrcB  39.82 
 
 
126 aa  93.6  8e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2021  camphor resistance protein CrcB  41.6 
 
 
124 aa  93.2  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000176643  hitchhiker  0.000131067 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1775  camphor resistance protein CrcB  44.8 
 
 
124 aa  93.2  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00911899  hitchhiker  0.00720449 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0818  camphor resistance protein CrcB  46.46 
 
 
137 aa  91.7  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.682767  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1221  camphor resistance protein CrcB  46.55 
 
 
128 aa  91.7  3e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112093  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0768  camphor resistance protein CrcB  46.46 
 
 
144 aa  91.7  3e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2130  camphor resistance protein CrcB  42.4 
 
 
124 aa  91.3  4e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104865  normal  0.0132896 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2480  camphor resistance protein CrcB  40.8 
 
 
124 aa  90.9  5e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000701119  hitchhiker  0.00000263281 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1528  camphor resistance protein CrcB  49.51 
 
 
133 aa  90.5  6e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2457  CrcB protein  44.92 
 
 
127 aa  90.5  7e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000828061  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2285  camphor resistance CrcB protein  45.61 
 
 
125 aa  90.1  9e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0188123  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3455  hypothetical protein  56.48 
 
 
134 aa  90.1  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0794685 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0202  camphor resistance protein CrcB  46.73 
 
 
132 aa  89.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0802663 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1798  camphor resistance protein CrcB  42.4 
 
 
124 aa  89  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00100672  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1746  camphor resistance protein CrcB  40.8 
 
 
124 aa  88.6  3e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00274275  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1029  CrcB protein  40 
 
 
124 aa  87.8  4e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0154206  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2423  CrcB protein  47.71 
 
 
127 aa  88.2  4e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.541327  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  41.6 
 
 
124 aa  87.8  5e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3016  camphor resistance protein CrcB  44.44 
 
 
124 aa  87.4  6e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120468  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1914  CrcB protein  44.26 
 
 
129 aa  85.9  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  45.22 
 
 
128 aa  84.7  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  42.98 
 
 
121 aa  84.7  4e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00367  camphor resistance protein CrcB  42.11 
 
 
127 aa  84  6e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0704  putative camphor resistance protein CrcB  36.75 
 
 
122 aa  83.6  9e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2493  camphor resistance protein CrcB  47.06 
 
 
124 aa  83.2  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00123017  normal  0.128362 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2396  CrcB protein  40.34 
 
 
124 aa  82  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0835  camphor resistance protein CrcB  42.06 
 
 
129 aa  82.8  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.320485  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0574  camphor resistance protein CrcB  39.17 
 
 
134 aa  80.9  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  42.86 
 
 
126 aa  80.9  0.000000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0550  camphor resistance protein CrcB  39.17 
 
 
134 aa  80.5  0.000000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1973  crcB protein domain-containing protein  46.81 
 
 
228 aa  79.7  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0423  CrcB protein  40 
 
 
123 aa  79.7  0.00000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  39.02 
 
 
130 aa  79.7  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0767  crcB protein  43.36 
 
 
132 aa  79.7  0.00000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0701738  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02112  camphor resistance protein CrcB  40.34 
 
 
127 aa  79.7  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000584991  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2453  camphor resistance protein CrcB  39.47 
 
 
126 aa  79.3  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2102  camphor resistance protein CrcB  39.09 
 
 
124 aa  79  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  44.35 
 
 
125 aa  79.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3430  camphor resistance protein CrcB  43.1 
 
 
124 aa  79.3  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002071  CrbC-like protein  39.47 
 
 
127 aa  79.3  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2259  camphor resistance protein  45.36 
 
 
125 aa  78.2  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.913857  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0954  camphor resistance protein CrcB  40.83 
 
 
125 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2843  camphor resistance protein CrcB  44.12 
 
 
130 aa  78.2  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0545  crcB protein  38.46 
 
 
122 aa  78.2  0.00000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0472858  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0624  hypothetical protein  39.32 
 
 
122 aa  77.8  0.00000000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  43.48 
 
 
125 aa  77.4  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1023  camphor resistance protein CrcB  40.95 
 
 
124 aa  77.4  0.00000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1915  camphor resistance CrcB protein  46.09 
 
 
134 aa  77.4  0.00000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3465  CrcB protein  42.11 
 
 
122 aa  76.6  0.00000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2546  crcB protein  42.31 
 
 
131 aa  77  0.00000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.926417  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1553  CrcB protein  39.5 
 
 
123 aa  76.3  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  35.34 
 
 
134 aa  76.3  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1038  CrcB family protein  41.03 
 
 
124 aa  76.3  0.0000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1284  camphor resistance protein CrcB  34.75 
 
 
128 aa  75.5  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0693229  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0950  CrcB protein  37.61 
 
 
128 aa  75.9  0.0000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.238115  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0012  camphor resistance protein CrcB  42.02 
 
 
129 aa  75.1  0.0000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0217  camphor resistance protein CrcB  40.18 
 
 
134 aa  75.5  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0819  camphor resistance protein CrcB  46.88 
 
 
121 aa  75.1  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1395  camphor resistance protein CrcB  36.8 
 
 
122 aa  75.1  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.283613  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3600  camphor resistance protein CrcB  42.97 
 
 
137 aa  73.9  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0581659 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2981  camphor resistance protein CrcB  35.96 
 
 
126 aa  73.9  0.0000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2230  camphor resistance protein CrcB  40 
 
 
124 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00947563  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13500  crcB protein  40.16 
 
 
131 aa  74.3  0.0000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2756  camphor resistance protein CrcB  42.37 
 
 
133 aa  73.6  0.0000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1433  CrcB protein  39.5 
 
 
132 aa  73.6  0.0000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.867471  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0313  camphor resistance protein CrcB  37.3 
 
 
122 aa  73.2  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1744  camphor resistance protein CrcB  40.8 
 
 
124 aa  73.2  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.377174  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0590  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 
122 aa  73.2  0.000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2422  hypothetical protein  43.33 
 
 
134 aa  73.2  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.595974  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0390  camphor resistance protein CrcB  40.8 
 
 
124 aa  73.2  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3649  camphor resistance protein CrcB  38.26 
 
 
162 aa  72.4  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109393  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0524  camphor resistance protein CrcB  35.2 
 
 
122 aa  71.6  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.184364  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>