20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4520 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_4520  hypothetical protein  100 
 
 		 541 aa  1107    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0874605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7052  hypothetical protein  33.33 
 
 		 373 aa  138  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1706  hypothetical protein  29.94 
 
 		 370 aa  116  8.999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0057  hypothetical protein  30.23 
 
 		 482 aa  114  6e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.185735  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0622  hypothetical protein  27.74 
 
 		 371 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0956  hypothetical protein  28.16 
 
 		 594 aa  111  3e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.194018  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3124  hypothetical protein  28.16 
 
 		 361 aa  110  9.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.507339  hitchhiker  0.000432102 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2312  hypothetical protein  24.79 
 
 		 398 aa  104  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.243961  normal  0.498174 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3336  hypothetical protein  27.39 
 
 		 396 aa  99  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.255984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0908  hypothetical protein  25.96 
 
 		 379 aa  95.1  3e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0413158  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0234  hypothetical protein  25.4 
 
 		 326 aa  83.2  0.00000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1491  hypothetical protein  23.81 
 
 		 370 aa  72.4  0.00000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4615  hypothetical protein  24.7 
 
 		 363 aa  72.8  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1790  hypothetical protein  25 
 
 		 384 aa  72  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0526  hypothetical protein  25.07 
 
 		 368 aa  71.6  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2835  hypothetical protein  26.04 
 
 		 361 aa  71.2  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0995862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2768  hypothetical protein  26.04 
 
 		 361 aa  68.9  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.580688  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1697  hypothetical protein  30.14 
 
 		 360 aa  68.2  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.874269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3258  hypothetical protein  23.32 
 
 		 930 aa  63.2  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.339134  normal  0.438308 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07098  hypothetical protein  37.08 
 
 		 357 aa  51.2  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>