More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4453 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_4453  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
233 aa  466  9.999999999999999e-131  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1278  ArsR family transcriptional regulator  56.68 
 
 
231 aa  256  2e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  0.180316 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0425  ArsR family transcriptional regulator  59.53 
 
 
230 aa  248  8e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1571  ArsR family transcriptional regulator  59.53 
 
 
224 aa  247  1e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.543844  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1758  ArsR family transcriptional regulator  59.53 
 
 
224 aa  247  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.99053  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2862  ArsR family transcriptional regulator  59.53 
 
 
224 aa  247  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0382  ArsR family transcriptional regulator  59.53 
 
 
224 aa  247  1e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1222  ArsR family transcriptional regulator  59.07 
 
 
224 aa  246  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1961  transcriptional regulator, ArsR family  53.49 
 
 
222 aa  244  9.999999999999999e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.172252  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2905  ArsR family transcriptional regulator  55.81 
 
 
224 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.562518  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3128  ArsR family transcriptional regulator  49.76 
 
 
223 aa  236  2e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.141213  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1102  ArsR family transcriptional regulator  54.13 
 
 
228 aa  236  2e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.780057  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3240  regulatory protein, ArsR  56.28 
 
 
221 aa  236  3e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.135637  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2736  ArsR family transcriptional regulator  53.24 
 
 
227 aa  233  1.0000000000000001e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.635873  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3468  rhodanese domain-containing protein  56.28 
 
 
221 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.572814  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2941  ArsR family transcriptional regulator  53.39 
 
 
222 aa  232  3e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0623  ArsR family transcriptional regulator  51.42 
 
 
223 aa  227  1e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00128738 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3257  rhodanese domain-containing protein  54.21 
 
 
221 aa  224  1e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0639581  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0756  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 
221 aa  222  4.9999999999999996e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4328  ArsR family transcriptional regulator  52.58 
 
 
235 aa  218  5e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0812017  normal  0.0670515 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4097  ArsR family transcriptional regulator  52.58 
 
 
235 aa  218  5e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.896356  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4173  ArsR family transcriptional regulator  52.58 
 
 
235 aa  218  5e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.801909  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0075  rhodanese domain-containing protein  49.3 
 
 
218 aa  216  2.9999999999999998e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3283  ArsR family transcriptional regulator  49.76 
 
 
226 aa  210  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11691  transcriptional regulator  50 
 
 
218 aa  205  4e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.393301 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3258  rhodanese domain-containing protein  49.3 
 
 
226 aa  203  2e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0646  rhodanese domain-containing protein  48.8 
 
 
218 aa  203  2e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1715  transcriptional regulator, ArsR family  49.07 
 
 
221 aa  196  2.0000000000000003e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0183  transcriptional regulator, ArsR family  46.92 
 
 
227 aa  194  1e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3468  transcriptional activator domain-containing protein  48.82 
 
 
223 aa  184  1.0000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2204  transcriptional regulator, ArsR family  43.87 
 
 
221 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.345359  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2126  ArsR family transcriptional regulator  43.87 
 
 
221 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.436052  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2739  ArsR family transcriptional regulator  43.6 
 
 
220 aa  179  4e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0533498  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3937  ArsR family transcriptional regulator  45.12 
 
 
219 aa  179  4e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.364905 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2180  ArsR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
218 aa  179  4e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1363  ArsR family transcriptional regulator  42.79 
 
 
227 aa  177  2e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3427  ArsR family transcriptional regulator  42.16 
 
 
234 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.299912  normal  0.0245638 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0462  ArsR family transcriptional regulator  43.26 
 
 
253 aa  172  5e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0092  rhodanese-like protein  41.99 
 
 
184 aa  168  6e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000022207  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0756  transcriptional regulator, ArsR family  42.45 
 
 
222 aa  168  6e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.213263  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10329  ArsR family transcriptional regulator  41.74 
 
 
226 aa  167  1e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0912  transcription regulator ArsR  37.19 
 
 
219 aa  160  1e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2101  ArsR family transcriptional regulator  40.32 
 
 
189 aa  156  3e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2179  ArsR family transcriptional regulator  68.81 
 
 
124 aa  154  9e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2038  rhodanese domain-containing protein  68.81 
 
 
124 aa  154  9e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1172  transcriptional regulator, ArsR family  38.36 
 
 
232 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0356  rhodanese domain-containing protein  61.11 
 
 
114 aa  138  6e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0237  Rhodanese domain protein  37.82 
 
 
128 aa  77.4  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5691  beta-lactamase domain-containing protein  36.21 
 
 
459 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5312  beta-lactamase-like protein  36.21 
 
 
459 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0418  Rhodanese domain protein  38.1 
 
 
112 aa  70.9  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5401  beta-lactamase domain-containing protein  36.21 
 
 
459 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.854326  normal  0.319128 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0060  transcription regulator ArsR  47.5 
 
 
227 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0008  rhodanese-like protein  35.35 
 
 
380 aa  68.9  0.00000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.612514 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1543  transcription regulator protein  45.45 
 
 
121 aa  68.6  0.00000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0436972 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  39.25 
 
 
133 aa  68.2  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2147  Rhodanese domain protein  35.9 
 
 
138 aa  67.8  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2523  rhodanese-related sulfurtransferase  37.14 
 
 
170 aa  68.2  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000271872  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3059  rhodanese domain-containing protein  39.08 
 
 
177 aa  68.2  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.865399  normal  0.233409 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0488  ArsR family transcriptional regulator  44.87 
 
 
134 aa  67  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0183  transcriptional regulator  37.66 
 
 
118 aa  67  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2592  regulatory protein ArsR  41.67 
 
 
123 aa  67.4  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.351829  normal  0.108396 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1544  transcriptional regulator, ArsR family  40.26 
 
 
109 aa  66.6  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.411749  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  32.54 
 
 
141 aa  66.6  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1130  rhodanese-related sulfurtransferase  32.58 
 
 
146 aa  66.6  0.0000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  32.54 
 
 
141 aa  66.6  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1000  putative sulfurtransferase  32.58 
 
 
124 aa  66.2  0.0000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.308152  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2309  regulatory protein ArsR  43.42 
 
 
114 aa  65.9  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.374797 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3259  ArsR family transcriptional regulator  38.95 
 
 
138 aa  65.5  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364539  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2014  transcriptional regulator, ArsR family  44.32 
 
 
121 aa  65.1  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.413816  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1706  transcriptional regulator, ArsR family  44.32 
 
 
121 aa  65.5  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.09956  normal  0.924299 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2503  rhodanese-related sulfurtransferase  39.81 
 
 
112 aa  65.1  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.314097 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2776  ArsR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
110 aa  63.9  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2627  ArsR family transcriptional regulator  44.58 
 
 
102 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.8267  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4023  beta-lactamase domain-containing protein  34.48 
 
 
459 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139103  normal  0.561085 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1830  beta-lactamase domain-containing protein  34.48 
 
 
459 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.772754  normal  0.208991 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0454  ArsR family transcriptional regulator  40.26 
 
 
92 aa  63.9  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2267  transcriptional regulator, ArsR family  35.11 
 
 
118 aa  63.2  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000484642 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1557  transcriptional regulator, ArsR family  40.51 
 
 
105 aa  63.2  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0128912  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4017  transcriptional regulator, ArsR family  43.24 
 
 
111 aa  62.8  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.980499  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5864  hypothetical protein  35.51 
 
 
139 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.352414  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67750  rhodanese-like domain-containing protein  35.51 
 
 
139 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0121316  normal  0.782302 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6792  ArsR family transcriptional regulator  48 
 
 
108 aa  62.8  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.439051  normal  0.0283932 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2641  transcriptional regulator, ArsR family  35.56 
 
 
113 aa  62.4  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.257894  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0327  regulatory protein ArsR  38.1 
 
 
165 aa  62.4  0.000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.395704  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3836  rhodanese domain-containing protein  43.21 
 
 
98 aa  62.4  0.000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1557  rhodanese domain-containing protein  37.78 
 
 
150 aa  62  0.000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.031347  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0987  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
98 aa  62.4  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.528724  normal  0.92086 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0757  transcriptional regulator, ArsR family  41.18 
 
 
129 aa  62  0.000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.164852 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0610  ArsR family transcriptional regulator  35.05 
 
 
98 aa  62  0.000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2535  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
100 aa  62  0.000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2395  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
109 aa  61.6  0.000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0206  Rhodanese domain protein  39.8 
 
 
98 aa  61.6  0.000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3285  transcriptional regulator ArsR family  43.42 
 
 
105 aa  61.6  0.000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1505  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.74 
 
 
581 aa  61.6  0.000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.184185  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3165  rhodanese domain-containing protein  38.14 
 
 
138 aa  61.2  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0985  beta-lactamase domain-containing protein  34.86 
 
 
459 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1906  transcriptional regulator, ArsR family  35.23 
 
 
106 aa  61.6  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.161865  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  41.94 
 
 
132 aa  61.6  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6932  beta-lactamase domain protein  31.58 
 
 
470 aa  61.6  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>