More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4407 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_4407  cysteine synthase A  100 
 
 
328 aa  657    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.119856 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2067  cysteine synthase A  79.81 
 
 
327 aa  518  1e-146  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.197318 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  65.16 
 
 
311 aa  395  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3549  cysteine synthase A  64.5 
 
 
322 aa  377  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1022  cysteine synthase A  65.48 
 
 
310 aa  369  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0422971  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0364  cysteine synthase  66.78 
 
 
322 aa  371  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2233  cysteine synthase A  63.31 
 
 
308 aa  369  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2487  cysteine synthase A  61.76 
 
 
309 aa  365  1e-100  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.074698 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1280  cysteine synthase  61.29 
 
 
309 aa  366  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0485567  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2677  cysteine synthase A  61.29 
 
 
309 aa  365  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.601381  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2364  cysteine synthase  64.38 
 
 
310 aa  367  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.174971  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1149  cysteine synthase A  63.55 
 
 
311 aa  363  2e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000025777  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3416  cysteine synthase  61.04 
 
 
311 aa  363  2e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4128  cysteine synthase  64.05 
 
 
310 aa  363  3e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2581  cysteine synthase A  60.65 
 
 
309 aa  363  3e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2853  cysteine synthase A  63.73 
 
 
311 aa  362  6e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000434249  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4605  cysteine synthase A  66.78 
 
 
320 aa  361  9e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2759  cysteine synthase A  63.4 
 
 
311 aa  361  1e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4340  cysteine synthase A  66.12 
 
 
320 aa  358  5e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.238175  normal  0.899822 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2003  cysteine synthase A  62.01 
 
 
308 aa  357  9.999999999999999e-98  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3653  cysteine synthase A  64.38 
 
 
319 aa  357  9.999999999999999e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.528018  hitchhiker  1.6930700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0452  cysteine synthase  61.78 
 
 
319 aa  356  2.9999999999999997e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.118838 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1971  cysteine synthase  62.7 
 
 
308 aa  356  2.9999999999999997e-97  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000186941  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3363  cysteine synthase A  62.78 
 
 
324 aa  355  5.999999999999999e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.589605  normal  0.886902 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0559  cysteine synthase A  65.69 
 
 
332 aa  353  2e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.770107  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0213  cysteine synthase  63.19 
 
 
329 aa  353  2e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0914276  normal  0.144885 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2176  cysteine synthase A  62.14 
 
 
309 aa  353  2.9999999999999997e-96  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.265161  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3794  cysteine synthase  60.13 
 
 
339 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2647  cysteine synthase A  64.94 
 
 
310 aa  352  4e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.100926  normal  0.593402 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2623  cysteine synthase A  55.31 
 
 
329 aa  352  4e-96  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3859  cysteine synthase A  64.94 
 
 
309 aa  352  5.9999999999999994e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000825635  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0075  cysteine synthase A  63.73 
 
 
328 aa  351  8e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3067  cysteine synthase  59.74 
 
 
316 aa  351  8.999999999999999e-96  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4466  cysteine synthase A  62.14 
 
 
327 aa  351  1e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00243818 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3186  cysteine synthase A  60.32 
 
 
310 aa  351  1e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000213805  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2000  cysteine synthase A  61.04 
 
 
317 aa  351  1e-95  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.982832  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1551  cysteine synthase K/M/A  59.05 
 
 
317 aa  350  2e-95  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0154  cysteine synthase K/M/A  57.47 
 
 
307 aa  350  2e-95  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054726  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1558  cysteine synthase  62.9 
 
 
309 aa  350  3e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5186  cysteine synthase A  61.81 
 
 
327 aa  348  5e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129775  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0420  cysteine synthase A  60.98 
 
 
311 aa  348  7e-95  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.858609  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2422  cysteine synthase  61.81 
 
 
308 aa  348  9e-95  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0516344 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2668  cysteine synthase  64.05 
 
 
311 aa  348  9e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2021  cysteine synthase A  64.63 
 
 
309 aa  347  1e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0166882  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4757  cysteine synthase A  60.13 
 
 
328 aa  346  2e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.157844 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2681  cysteine synthase A  62.66 
 
 
308 aa  347  2e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0782138 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12358  cysteine synthase A cysK1  62.34 
 
 
310 aa  347  2e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0937  cysteine synthase A  62.75 
 
 
326 aa  345  6e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.251918 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0973  cysteine synthase A  62.75 
 
 
326 aa  345  6e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0856961  normal  0.0511521 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1983  cysteine synthase A  59.55 
 
 
309 aa  345  7e-94  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.722669  normal  0.957709 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1671  cysteine synthase A  59.49 
 
 
311 aa  345  7e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.422965  normal  0.494898 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0913  cysteine synthase A  62.42 
 
 
325 aa  344  1e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.282212 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2609  cysteine synthase A  60.45 
 
 
311 aa  344  1e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1506  cysteine synthase A  64.08 
 
 
309 aa  344  1e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000603625  normal  0.533317 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1615  cysteine synthase A  60.66 
 
 
308 aa  344  1e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0234  cysteine synthase K/M/A  61.04 
 
 
314 aa  343  2e-93  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0011  cysteine synthase A  60.39 
 
 
310 aa  344  2e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.857978  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0477  cysteine synthase  65.36 
 
 
332 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0921  cysteine synthase A  57.46 
 
 
317 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3334  cysteine synthase A  66.02 
 
 
309 aa  343  2.9999999999999997e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.229416  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24430  cysteine synthase  57.88 
 
 
311 aa  342  5e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.653671  normal  0.574826 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1541  cysteine synthase A  57.49 
 
 
330 aa  342  5.999999999999999e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2657  cysteine synthase A  64.08 
 
 
309 aa  342  5.999999999999999e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.249918  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2427  cysteine synthase  63.07 
 
 
309 aa  341  1e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00952791  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2853  cysteine synthase A  59.03 
 
 
320 aa  341  1e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0343  cysteine synthase A  65.36 
 
 
332 aa  339  2.9999999999999998e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.516891  normal  0.476462 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1390  cysteine synthase  59.49 
 
 
311 aa  339  4e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.173456  normal  0.100727 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2871  cysteine synthase A  58.31 
 
 
318 aa  338  5e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0178  cysteine synthase A  62.54 
 
 
331 aa  338  5.9999999999999996e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0241  cysteine synthase  59.09 
 
 
315 aa  338  8e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4360  cysteine synthase  62.46 
 
 
322 aa  338  8e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3782  cysteine synthase  58.47 
 
 
320 aa  338  8e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00462193  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1015  cysteine synthase A  64.17 
 
 
328 aa  338  9e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1893  cysteine synthase A  63.52 
 
 
327 aa  337  1.9999999999999998e-91  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.480284  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2096  cysteine synthase  59.42 
 
 
323 aa  334  9e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.553585  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5019  cysteine synthase  58.2 
 
 
320 aa  334  1e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0961303  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0556  cysteine synthases  58.15 
 
 
323 aa  333  2e-90  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.523099  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2560  cysteine synthase A  61.44 
 
 
310 aa  333  3e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2014  cysteine synthase A  58.77 
 
 
309 aa  332  5e-90  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0113  normal  0.0387372 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1219  cysteine synthase A  59.87 
 
 
309 aa  332  6e-90  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.913066  normal  0.187801 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0964  cysteine synthase  57.98 
 
 
320 aa  331  9e-90  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274794  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1385  cysteine synthase  54.49 
 
 
311 aa  331  1e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.9014  normal  0.484311 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1258  cysteine synthase K/M/A  62.66 
 
 
327 aa  331  1e-89  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.198511  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4307  cysteine synthase  59.48 
 
 
309 aa  331  1e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.782932  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2195  cysteine synthase A  56.27 
 
 
311 aa  330  2e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000876073 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0433  cysteine synthase K/M/A  55.19 
 
 
307 aa  330  2e-89  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.818582  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0178  cysteine synthase A  58.06 
 
 
316 aa  329  3e-89  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0627608  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3400  cysteine synthase  57.42 
 
 
313 aa  329  4e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2508  cysteine synthase  59.74 
 
 
320 aa  329  4e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000293117  normal  0.173804 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1718  cysteine synthase A  59.03 
 
 
308 aa  328  7e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370956  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0413  cysteine synthase  59.28 
 
 
309 aa  328  7e-89  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1235  cysteine synthase  59.16 
 
 
320 aa  328  9e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.779914  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5034  cysteine synthase A  57.61 
 
 
320 aa  327  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1336  cysteine synthase A  58.58 
 
 
311 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1301  cysteine synthase A  57.33 
 
 
309 aa  325  8.000000000000001e-88  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.568697 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  55.05 
 
 
312 aa  325  8.000000000000001e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0030  cysteine synthase A  55.99 
 
 
311 aa  325  8.000000000000001e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_953  cysteine synthase  57.65 
 
 
320 aa  324  1e-87  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000343054  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1773  cysteine synthases  57.28 
 
 
325 aa  324  1e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2446  cysteine synthase  54.66 
 
 
311 aa  324  2e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00671922  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>