53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4355 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_4355  hypothetical protein  100 
 
 		 341 aa  689    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0678013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5265  hypothetical protein  45.99 
 
 		 348 aa  286  2.9999999999999996e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00288645  unclonable  0.000020149 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3050  hypothetical protein  46.8 
 
 		 345 aa  285  7e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.818716 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0281  hypothetical protein  43.15 
 
 		 328 aa  235  8e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0218  hypothetical protein  36.95 
 
 		 331 aa  231  2e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.270651 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2490  hypothetical protein  36.65 
 
 		 346 aa  226  6e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1776  hypothetical protein  41.25 
 
 		 326 aa  224  2e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.208666  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf137  hypothetical protein  34.12 
 
 		 346 aa  206  3e-52  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0341957  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1420  Domain of unknown function DUF1814  37.21 
 
 		 338 aa  205  1e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0890  hypothetical protein  36.52 
 
 		 337 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000838663  hitchhiker  0.00000000010514 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1625  hypothetical protein  38.69 
 
 		 339 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0394  hypothetical protein  34.59 
 
 		 342 aa  197  3e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.176763  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1821  hypothetical protein  35.22 
 
 		 327 aa  195  1e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0434  hypothetical protein  38.46 
 
 		 339 aa  194  2e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.421274  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2334  hypothetical protein  38.17 
 
 		 359 aa  183  4.0000000000000006e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.937968  normal  0.0991632 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1847  hypothetical protein  36.31 
 
 		 361 aa  181  1e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.283474 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0784  hypothetical protein  35.85 
 
 		 368 aa  172  5e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.278006 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7702  hypothetical protein  36.15 
 
 		 347 aa  171  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.119439 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4292  hypothetical protein  37.2 
 
 		 344 aa  170  3e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0754  hypothetical protein  31.02 
 
 		 332 aa  167  2e-40  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3510  hypothetical protein  32.56 
 
 		 338 aa  149  9e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0233034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1225  hypothetical protein  32.56 
 
 		 338 aa  149  9e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3046  hypothetical protein  31.41 
 
 		 338 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.137225  normal  0.0781322 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3057  protein of unknown function DUF1814  31.41 
 
 		 338 aa  132  9e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.142804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1328  hypothetical protein  31.03 
 
 		 348 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0000000261253  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0052  hypothetical protein  28.32 
 
 		 355 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.962002  unclonable  0.0000116494 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3786  hypothetical protein  29.43 
 
 		 335 aa  90.5  4e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0848  hypothetical protein  26.88 
 
 		 332 aa  74.3  0.000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000264923 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1960  hypothetical protein  35.24 
 
 		 327 aa  66.6  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0509543  normal  0.220534 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0294  hypothetical protein  27.24 
 
 		 329 aa  61.2  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2171  hypothetical protein  28.17 
 
 		 314 aa  55.8  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.690317  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5493  hypothetical protein  46.15 
 
 		 326 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.595144  normal  0.225489 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0814  hypothetical protein  41.67 
 
 		 399 aa  55.1  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2690  hypothetical protein  31.71 
 
 		 187 aa  50.8  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.710388 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1569  hypothetical protein  41.03 
 
 		 321 aa  50.8  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.110325  normal  0.0638438 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0715  hypothetical protein  41.67 
 
 		 277 aa  50.1  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0102185 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5328  hypothetical protein  39.13 
 
 		 83 aa  48.9  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.495145 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1879  hypothetical protein  39.71 
 
 		 246 aa  48.9  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.671388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4457  hypothetical protein  47.06 
 
 		 313 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4161  hypothetical protein  47.06 
 
 		 313 aa  48.5  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.162977 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3349  hypothetical protein  46.3 
 
 		 274 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06811  hypothetical protein  45.1 
 
 		 313 aa  47.4  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0200  hypothetical protein  31.82 
 
 		 315 aa  47.8  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3302  hypothetical protein  41.43 
 
 		 348 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.52051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4908  Domain of unknown function DUF1814  37.31 
 
 		 267 aa  47.4  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2408  hypothetical protein  44.44 
 
 		 308 aa  47.4  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4997  hypothetical protein  43.64 
 
 		 247 aa  47  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0261  hypothetical protein  39.29 
 
 		 271 aa  46.6  0.0006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4391  hypothetical protein  38.1 
 
 		 78 aa  44.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0514  hypothetical protein  44.44 
 
 		 256 aa  44.3  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.583693  normal  0.38508 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0717  hypothetical protein  42.42 
 
 		 299 aa  44.7  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0716673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3417  hypothetical protein  43.14 
 
 		 315 aa  43.9  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0970  hypothetical protein  43.4 
 
 		 285 aa  42.7  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>