139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4322 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3228  glycoside hydrolase family protein  59.89 
 
 		 563 aa  701    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00674596  normal  0.0120766 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4322  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 581 aa  1187    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03855  xylosidase; arabinosidase  48.65 
 
 		 556 aa  509  1e-143  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1655  translation initiation factor IF-1  46.68 
 
 		 566 aa  490  1e-137  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0976225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0598  Alpha-L-arabinofuranosidase  44.11 
 
 		 577 aa  454  1.0000000000000001e-126  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.628109 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1423  Xylan 1,4-beta-xylosidase  40.41 
 
 		 558 aa  407  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.423704 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3880  glycoside hydrolase family protein  36.08 
 
 		 571 aa  380  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2518  glycoside hydrolase family protein  40.56 
 
 		 516 aa  377  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3438  glycoside hydrolase family 43  38.95 
 
 		 519 aa  372  1e-101  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.990127  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2318  alpha-N-arabinofuranosidase  42.62 
 
 		 512 aa  349  7e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.249416 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3048  Alpha-N-arabinofuranosidase  40.22 
 
 		 515 aa  336  7e-91  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0608814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3011  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.08 
 
 		 538 aa  301  2e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0842  Alpha-L-arabinofuranosidase  34.75 
 
 		 546 aa  281  2e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.122484  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1400  glycoside hydrolase family 43  35.67 
 
 		 517 aa  279  1e-73  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.587173  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3599  glycoside hydrolase family 43  36.85 
 
 		 497 aa  275  2.0000000000000002e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20520  beta-xylosidase  43.34 
 
 		 542 aa  269  1e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129044  normal  0.254652 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0875  glycoside hydrolase family protein  32.73 
 
 		 636 aa  262  1e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000412559  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3569  glycoside hydrolase family 43  36.5 
 
 		 484 aa  256  6e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0058203  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0289  xylan 1,4-beta-xylosidase  34.19 
 
 		 532 aa  249  1e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000021727  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2699  glycoside hydrolase family 43  34.76 
 
 		 496 aa  247  3e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.276179  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2028  glycoside hydrolase family protein  31.39 
 
 		 498 aa  247  4.9999999999999997e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1143  Alpha-L-arabinofuranosidase  33.09 
 
 		 523 aa  242  2e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1616  alpha-L-arabinofuranosidase  33.27 
 
 		 550 aa  238  2e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3545  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.44 
 
 		 547 aa  238  2e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0270111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1710  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.81 
 
 		 541 aa  238  3e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.783601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3398  glycoside hydrolase family protein  31.9 
 
 		 514 aa  238  3e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740676  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0191  glycoside hydrolase family protein  32.61 
 
 		 512 aa  237  4e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0936  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.26 
 
 		 546 aa  226  7e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.789253 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3334  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.67 
 
 		 536 aa  223  9.999999999999999e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.783434  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2329  Xylan 1,4-beta-xylosidase  33.81 
 
 		 537 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2090  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.45 
 
 		 537 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00759162  normal  0.572245 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0457  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.64 
 
 		 539 aa  220  5e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0354643 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07864  conserved hypothetical protein  33.27 
 
 		 540 aa  220  6e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0157749  normal  0.535242 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2409  hypothetical protein  33.09 
 
 		 541 aa  217  4e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0431  glycoside hydrolase family protein  42.95 
 
 		 451 aa  216  8e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2459  Xylan 1,4-beta-xylosidase  43.56 
 
 		 488 aa  214  4.9999999999999996e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2504  Xylan 1,4-beta-xylosidase  29.2 
 
 		 558 aa  213  7.999999999999999e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21180  beta-xylosidase  35.24 
 
 		 526 aa  212  1e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.851115  normal  0.166078 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4681  glycoside hydrolase family protein  32.78 
 
 		 492 aa  211  4e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.026787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2532  glycoside hydrolase family 43  38.64 
 
 		 586 aa  194  3e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0430  glycoside hydrolase family 43  34.31 
 
 		 497 aa  194  4e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.710686 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1878  beta-xylosidase  30.45 
 
 		 539 aa  192  1e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0935  glycoside hydrolase family 43  30.71 
 
 		 522 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0700  glycoside hydrolase family 43  30.9 
 
 		 522 aa  184  3e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06751  glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G06110)  32.31 
 
 		 591 aa  180  5.999999999999999e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.326162 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4289  glycoside hydrolase family protein  30.69 
 
 		 572 aa  178  2e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.786059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2996  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.91 
 
 		 559 aa  173  1e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0848  Beta-xylosidase  26.45 
 
 		 552 aa  170  5e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.168219  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3718  glycoside hydrolase family protein  32.41 
 
 		 504 aa  162  1e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.456589  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08477  xylosidase : arabinofuranosidase (AFU_orthologue; AFUA_2G13190)  29.54 
 
 		 546 aa  162  2e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3351  glycoside hydrolase family 43  31.39 
 
 		 522 aa  162  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29240  beta-xylosidase  29.46 
 
 		 527 aa  161  3e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3042  twin-arginine translocation pathway signal  29.19 
 
 		 537 aa  159  1e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.351967  normal  0.568346 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2914  glycoside hydrolase family protein  31.25 
 
 		 547 aa  154  5e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0501  glycoside hydrolase family 43  30.22 
 
 		 525 aa  154  5e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1291  Beta-xylosidase  32.18 
 
 		 553 aa  153  7e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1879  beta-xylosidase  29.69 
 
 		 590 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3522  glycoside hydrolase family protein  29.35 
 
 		 534 aa  143  7e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.653851  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3531  glycoside hydrolase family 43  32.84 
 
 		 511 aa  143  8e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185955 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2632  glycoside hydrolase family protein  29.29 
 
 		 543 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0211688  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0182  glycoside hydrolase family 43  28.94 
 
 		 1338 aa  140  4.999999999999999e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3811  glycoside hydrolase family 43  24.87 
 
 		 535 aa  139  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4788  Xylan 1,4-beta-xylosidase  32.65 
 
 		 562 aa  136  9e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.771274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4021  glycoside hydrolase family protein  32.59 
 
 		 537 aa  135  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.701147 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3622  Xylan 1,4-beta-xylosidase  24.7 
 
 		 540 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.573352  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1500  glycoside hydrolase family 43  30.06 
 
 		 551 aa  131  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5511  glycoside hydrolase family 43  28.54 
 
 		 536 aa  131  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4249  glycoside hydrolase family protein  26.28 
 
 		 532 aa  129  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3237  glycoside hydrolase family protein  30.03 
 
 		 1195 aa  127  6e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414155 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1233  Carbohydrate binding family 6  29.28 
 
 		 746 aa  126  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.555313  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1150  glycoside hydrolase family 43  30.05 
 
 		 560 aa  125  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3875  glycoside hydrolase family protein  25.05 
 
 		 518 aa  119  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1435  glycoside hydrolase family 43  28.5 
 
 		 545 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1251  glycoside hydrolase family protein  28.19 
 
 		 665 aa  116  1.0000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2413  glycoside hydrolase family protein  29.17 
 
 		 521 aa  113  7.000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.333908  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2108  glycoside hydrolase family 43  27.21 
 
 		 650 aa  113  8.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000141623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2041  polyfunctional acetylxylan esterase/b-xylosidase/a-L-arabinofuranosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 43 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  26.2 
 
 		 1585 aa  109  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2114  glycoside hydrolase family 43  26.88 
 
 		 518 aa  99.4  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.554254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03261  xylosidase  30.74 
 
 		 365 aa  98.2  3e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.687612  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1420  glycoside hydrolase family 43  27.11 
 
 		 530 aa  97.8  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.394008  normal  0.931127 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2044  beta-xylosidase/alpha-L-arabinofuranosidase- like protein  28.48 
 
 		 1474 aa  98.2  4e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1257  glycoside hydrolase family 43  23.78 
 
 		 500 aa  98.2  4e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3302  glycoside hydrolase family 43  27.69 
 
 		 532 aa  97.4  6e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00567592  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01043  conserved hypothetical protein  44.14 
 
 		 343 aa  89.7  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3360  glycoside hydrolase family 43  24.35 
 
 		 522 aa  89.4  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0779432 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1280  glycoside hydrolase family 43  25.71 
 
 		 691 aa  88.6  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286369  hitchhiker  0.00183728 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3618  glycoside hydrolase family protein  22.41 
 
 		 508 aa  86.7  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000797588  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0650  glycoside hydrolase family 43  23.88 
 
 		 495 aa  86.7  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0713148  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1068  glycoside hydrolase family 43  25.05 
 
 		 797 aa  84  0.000000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000256501  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2639  glycoside hydrolase family 43  26.47 
 
 		 472 aa  78.2  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  0.0143862 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07275  xylosidase/glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00930)  23.18 
 
 		 503 aa  77.4  0.0000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000188631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1661  endo-1,4-beta-xylanase/Beta-xylosidase  27.16 
 
 		 901 aa  75.9  0.000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6044  glycoside hydrolase family 43  24.15 
 
 		 501 aa  75.9  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.845022  normal  0.0554344 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1524  glycoside hydrolase family 43  26.47 
 
 		 524 aa  72  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2723  glycoside hydrolase family protein  28.93 
 
 		 345 aa  71.2  0.00000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.469303  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1729  glycoside hydrolase family 43  23.82 
 
 		 472 aa  67  0.0000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.101805  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2971  glycoside hydrolase family 43  24.66 
 
 		 855 aa  66.2  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0529993 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2022  glycoside hydrolase family 43  24.74 
 
 		 334 aa  65.1  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6730  glycoside hydrolase family 43  24.22 
 
 		 323 aa  60.8  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  normal  0.920031 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0737  glycoside hydrolase family protein  24.32 
 
 		 345 aa  60.8  0.00000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612706  normal  0.340405 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>