More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4320 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_4320  phenylacetate--CoA ligase  100 
 
 
444 aa  918  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0042  Phenylacetate--CoA ligase  71 
 
 
441 aa  637  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0038  phenylacetate-CoA ligase  71.23 
 
 
441 aa  637  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.455543  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0041  phenylacetate--CoA ligase  72.02 
 
 
446 aa  639  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0054  Phenylacetate--CoA ligase  70.55 
 
 
441 aa  634  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0070  phenylacetate--CoA ligase  69.61 
 
 
445 aa  598  1e-170  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0669  phenylacetate-CoA ligase  58.75 
 
 
433 aa  537  1e-151  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.73594  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1858  Phenylacetate--CoA ligase  58.16 
 
 
435 aa  531  1e-150  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00363139  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2192  phenylacetate-CoA ligase  57.78 
 
 
434 aa  532  1e-150  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.724395  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1825  phenylacetate-CoA ligase  57.41 
 
 
435 aa  531  1e-150  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1519  phenylacetate--CoA ligase  60.43 
 
 
435 aa  529  1e-149  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00322387 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2133  phenylacetate--CoA ligase  57.68 
 
 
434 aa  530  1e-149  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00349267  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2035  Phenylacetate--CoA ligase  57.31 
 
 
434 aa  528  1e-149  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.65841e-12 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1569  coenzyme F390 synthetase  58.02 
 
 
433 aa  530  1e-149  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.645557  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0442  Phenylacetate--CoA ligase  59.06 
 
 
434 aa  528  1e-149  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.372138 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0797  Phenylacetate--CoA ligase  59.1 
 
 
433 aa  525  1e-148  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1968  phenylacetate-CoA ligase  59.81 
 
 
433 aa  523  1e-147  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1737  phenylacetate-CoA ligase  56.84 
 
 
435 aa  524  1e-147  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102545  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2084  phenylacetate-CoA ligase  59.2 
 
 
433 aa  523  1e-147  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.268641  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1504  Phenylacetate--CoA ligase  57.55 
 
 
433 aa  521  1e-146  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2323  phenylacetate--CoA ligase  57.21 
 
 
433 aa  514  1e-145  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0075  Phenylacetate--CoA ligase  58.61 
 
 
433 aa  516  1e-145  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  58.06 
 
 
432 aa  512  1e-144  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1669  phenylacetate--CoA ligase  56.03 
 
 
433 aa  514  1e-144  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0066  phenylacetate--CoA ligase  58.71 
 
 
432 aa  508  1e-143  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.922632  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1683  phenylacetate--CoA ligase  56.26 
 
 
433 aa  508  1e-143  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0073  Phenylacetate--CoA ligase  58.13 
 
 
433 aa  511  1e-143  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0559  Phenylacetate--CoA ligase  57.08 
 
 
434 aa  507  1e-142  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.589341  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2884  phenylacetate--CoA ligase  56.22 
 
 
434 aa  501  1e-141  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00316572  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0815  phenylacetate--CoA ligase  55.45 
 
 
439 aa  503  1e-141  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.180698  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1742  phenylacetate--CoA ligase  56.12 
 
 
432 aa  498  1e-140  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.287077 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0615  phenylacetate-CoA ligase  54.55 
 
 
433 aa  498  1e-140  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.893262  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1139  Phenylacetate--CoA ligase  55.9 
 
 
435 aa  499  1e-140  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  3.76262e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0861  phenylacetate-CoA ligase  56.22 
 
 
432 aa  499  1e-140  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354506  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0166  Phenylacetate--CoA ligase  57.99 
 
 
432 aa  497  1e-139  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0169  phenylacetate--CoA ligase  55.98 
 
 
432 aa  497  1e-139  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.419801  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1218  phenylacetate-CoA ligase  55.4 
 
 
436 aa  496  1e-139  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1574  phenylacetate--CoA ligase  57.11 
 
 
441 aa  494  1e-138  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.888855  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1590  phenylacetate--CoA ligase  55.4 
 
 
432 aa  491  1e-138  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1385  Phenylacetate--CoA ligase  54.92 
 
 
434 aa  493  1e-138  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00741433 
 
 
-
 
NC_002936  DET1015  phenylacetate-CoA ligase  55.04 
 
 
439 aa  491  1e-137  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0902  phenylacetate-CoA ligase  54.46 
 
 
439 aa  487  1e-136  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1237  phenylacetate--CoA ligase  55.71 
 
 
444 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3190  phenylacetate--CoA ligase  52.03 
 
 
432 aa  478  1e-134  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0586807  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_886  acyl-CoA synthetase (AMP-forming) / AMP-acid ligase  53.76 
 
 
439 aa  479  1e-134  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1422  Phenylacetate--CoA ligase  55.81 
 
 
444 aa  481  1e-134  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.393229  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1507  Phenylacetate--CoA ligase  53.5 
 
 
433 aa  478  1e-133  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4008  phenylacetate--CoA ligase  55.01 
 
 
444 aa  472  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1729  phenylacetate-CoA ligase  53.11 
 
 
433 aa  474  1e-132  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1976  phenylacetate-CoA ligase  52.74 
 
 
437 aa  472  1e-132  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0698  phenylacetate--CoA ligase  53.83 
 
 
446 aa  474  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70972  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2124  phenylacetate--CoA ligase  52.39 
 
 
434 aa  473  1e-132  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1573  phenylacetate--CoA ligase  53.21 
 
 
431 aa  470  1e-131  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2184  phenylacetate-CoA ligase  51.05 
 
 
433 aa  469  1e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2043  phenylacetate-CoA ligase  51.29 
 
 
433 aa  471  1e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.58285e-15 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3083  phenylacetate--CoA ligase  53.96 
 
 
423 aa  471  1e-131  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  52.96 
 
 
438 aa  466  1e-130  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0260  phenylacetate--CoA ligase  52.25 
 
 
434 aa  464  1e-129  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.108553  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4801  phenylacetate-CoA ligase  54.07 
 
 
436 aa  461  1e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12484  normal  0.238866 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0440  phenylacetate-CoA ligase  53.66 
 
 
436 aa  463  1e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.908613 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1578  Phenylacetate--CoA ligase  51.77 
 
 
436 aa  462  1e-129  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.198004 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1754  phenylacetate--CoA ligase  50.83 
 
 
435 aa  463  1e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0384873  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0042  Phenylacetate--CoA ligase  50.96 
 
 
432 aa  461  1e-128  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.125903 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1818  phenylacetate-CoA ligase  51.84 
 
 
433 aa  459  1e-128  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0683  phenylacetate-CoA ligase  53.57 
 
 
444 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0211  phenylacetate-CoA ligase  50.83 
 
 
434 aa  456  1e-127  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.40287  normal  0.756152 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0790  phenylacetate--CoA ligase  49.07 
 
 
433 aa  456  1e-127  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.740022  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3096  phenylacetate-CoA ligase  55.11 
 
 
439 aa  455  1e-127  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0154139  hitchhiker  0.00102169 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2278  phenylacetate-CoA ligase  52.14 
 
 
430 aa  457  1e-127  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.129528  hitchhiker  2.41897e-05 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1910  Phenylacetate--CoA ligase  50.71 
 
 
436 aa  458  1e-127  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  1.90319e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1160  phenylacetate--CoA ligase  48.83 
 
 
433 aa  453  1e-126  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0709  phenylacetate--CoA ligase  51.18 
 
 
433 aa  448  1e-125  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0797552 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0339  phenylacetate-CoA ligase  51.08 
 
 
433 aa  450  1e-125  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0633  phenylacetate--CoA ligase  51.8 
 
 
432 aa  450  1e-125  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.683184  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1515  phenylacetate-CoA ligase  48.6 
 
 
433 aa  449  1e-125  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.049443  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0656  phenylacetate-CoA ligase  52.87 
 
 
434 aa  444  1e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0749  phenylacetate--CoA ligase  51.3 
 
 
433 aa  442  1e-123  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0461279  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1756  phenylacetate--CoA ligase  51.2 
 
 
432 aa  441  1e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3824  phenylacetate-CoA ligase  54.44 
 
 
436 aa  444  1e-123  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0827131  normal  0.36821 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1165  phenylacetate--CoA ligase  46.39 
 
 
433 aa  443  1e-123  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2870  phenylacetate-CoA ligase  52.12 
 
 
443 aa  440  1e-122  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1923  phenylacetate-CoA ligase  50.34 
 
 
443 aa  439  1e-122  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0702505  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3741  phenylacetate-CoA ligase  52.74 
 
 
448 aa  440  1e-122  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.1455  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2967  phenylacetate-CoA ligase  52.09 
 
 
439 aa  439  1e-122  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5526  phenylacetate-CoA ligase  54.23 
 
 
449 aa  438  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0759485  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0227  phenylacetate-CoA ligase  52 
 
 
433 aa  436  1e-121  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2870  phenylacetate-CoA ligase  51.37 
 
 
442 aa  436  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3367  phenylacetate-CoA ligase  52.61 
 
 
443 aa  436  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322757  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0901  phenylacetate-CoA ligase  52.37 
 
 
445 aa  435  1e-121  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3626  phenylacetate-CoA ligase  51.55 
 
 
432 aa  435  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0611072  normal  0.539384 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0207  phenylacetate-CoA ligase  48.82 
 
 
434 aa  435  1e-121  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0511  phenylacetate-CoA ligase  51.79 
 
 
432 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.948349  normal  0.684224 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2566  phenylacetate-CoA ligase  51.79 
 
 
432 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2855  phenylacetate-CoA ligase  51.55 
 
 
432 aa  433  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.343301  normal  0.707193 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0570  phenylacetate-CoA ligase  52.49 
 
 
434 aa  433  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.419756  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1624  phenylacetate--CoA ligase  49.76 
 
 
433 aa  434  1e-120  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.962242 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0539  phenylacetate-CoA ligase  51.79 
 
 
432 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.743587  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1625  phenylacetate--CoA ligase  49.64 
 
 
429 aa  429  1e-119  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.314491  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0469  phenylacetate-CoA ligase  51.07 
 
 
432 aa  429  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.119457  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1829  phenylacetate-CoA ligase  52.66 
 
 
444 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.914606  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>