48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4220 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1586  hypothetical protein  39.19 
 
 		 1136 aa  668    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.707632  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6606  hypothetical protein  38.73 
 
 		 1094 aa  699    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00814353 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2456  hypothetical protein  38.47 
 
 		 1076 aa  660    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5665  hypothetical protein  38.7 
 
 		 1100 aa  692    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.24035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4220  hypothetical protein  100 
 
 		 1169 aa  2353    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.117681  normal  0.559819 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0694  hypothetical protein  34.64 
 
 		 1113 aa  649    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.514428  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0587  hypothetical protein  34.57 
 
 		 1117 aa  624  1e-177  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.720861  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1070  hypothetical protein  34.48 
 
 		 1095 aa  623  1e-177  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.243584 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0526  hypothetical protein  34.48 
 
 		 1117 aa  617  1e-175  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06430  cellobiose phosphorylase  35.89 
 
 		 1145 aa  577  1.0000000000000001e-163  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3576  hypothetical protein  43.41 
 
 		 1195 aa  355  2.9999999999999997e-96  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.61557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2133  glycosyltransferase 36  24.64 
 
 		 2881 aa  91.7  7e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.150749 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0623  glycosyltransferase 36  24.72 
 
 		 2929 aa  77  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1304  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  25.69 
 
 		 2859 aa  75.9  0.000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4245  glycosyltransferase 36  22.68 
 
 		 2860 aa  75.1  0.000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.342744 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1183  glycosyltransferase 36  23.35 
 
 		 2905 aa  73.9  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2046  putative carbohydrate binding:glycosyltransferase 36:glycosyltransferase 36 associated  24.32 
 
 		 2932 aa  73.6  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0091  glycosyltransferase 36  27.65 
 
 		 849 aa  73.2  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00140222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2577  putative carbohydrate binding  22.56 
 
 		 2823 aa  72.4  0.00000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3285  glycosyltransferase 36  21.93 
 
 		 2880 aa  70.9  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3489  hypothetical protein  22.2 
 
 		 2761 aa  58.9  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.731415 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3296  glycosyltransferase 36  23.01 
 
 		 2747 aa  58.2  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0111  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  24.07 
 
 		 2732 aa  58.2  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.888748  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2737  glycosyltransferase 36  25.4 
 
 		 2864 aa  58.2  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3155  glycosyltransferase 36  32.33 
 
 		 2870 aa  56.6  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2993  glycosyltransferase 36  23.61 
 
 		 1303 aa  56.6  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4026  glycosyltransferase 36  22.76 
 
 		 2748 aa  55.5  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.301518 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0108  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  23.65 
 
 		 2864 aa  54.7  0.000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.602283  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0124  glycosyltransferase 36  27.73 
 
 		 2888 aa  53.9  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3888  glycosyltransferase 36  22.6 
 
 		 2875 aa  53.5  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1675  glycosyltransferase 36  20.73 
 
 		 2786 aa  52.8  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2188  glycosyltransferase 36  23.21 
 
 		 2916 aa  52.4  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4370  beta (1-->2) glucan biosynthesis protein  22.96 
 
 		 2833 aa  52.4  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2531  glycosyltransferase 36  22.33 
 
 		 2845 aa  52  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3613  glycosyltransferase  22.45 
 
 		 2769 aa  50.8  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3139  glycosyltransferase 36  23.75 
 
 		 2842 aa  51.2  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1517  putative cyclic beta 1-2 glucan synthetase  22.86 
 
 		 2901 aa  50.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302513  normal  0.43916 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3648  glycosyltransferase 36 associated  24.62 
 
 		 624 aa  49.7  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4173  glycosyltransferase 36  21.8 
 
 		 2839 aa  48.9  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1711  glycosyltransferase 36  24.58 
 
 		 2874 aa  48.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3379  putative carbohydrate binding  27.27 
 
 		 2758 aa  48.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3184  glycosyltransferase 36  27.27 
 
 		 2748 aa  48.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1221  glycosyltransferase 36  20.39 
 
 		 2922 aa  47.8  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3093  glycosyltransferase 36  23.52 
 
 		 2731 aa  47.8  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0980  putative carbohydrate binding  26.56 
 
 		 2887 aa  47.4  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3667  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  23.14 
 
 		 2793 aa  47.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2354  glycosyltransferase 36  21.73 
 
 		 796 aa  45.4  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4755  putative carbohydrate binding  24.21 
 
 		 2779 aa  45.1  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>