116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4214 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_4214  urease accessory protein UreF  100 
 
 		 247 aa  483  1e-135  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.612683 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4833  urease accessory protein UreF  28.95 
 
 		 228 aa  100  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3660  urease accessory protein UreF  24.55 
 
 		 232 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.098957  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2316  urease accessory protein UreF  24.89 
 
 		 229 aa  89.4  5e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.495239  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2359  urease accessory protein UreF  24.89 
 
 		 229 aa  89.4  5e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1814  urease accessory protein UreF  26.89 
 
 		 240 aa  85.9  5e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0245  urease accessory protein UreF  30.97 
 
 		 225 aa  82.8  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1873  urease accessory protein UreF  24.22 
 
 		 229 aa  81.6  0.00000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.674114  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0722  Urease accessory protein UreF  24.56 
 
 		 240 aa  80.9  0.00000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0327  urease accessory protein  23.98 
 
 		 237 aa  80.1  0.00000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1476  Urease accessory protein UreF  29.39 
 
 		 228 aa  79.3  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0566307  normal  0.716543 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0685  urease accessory protein UreF  25.65 
 
 		 228 aa  76.3  0.0000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1702  Urease accessory protein UreF  34.58 
 
 		 225 aa  75.1  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000278425 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1303  urease accessory protein UreF  28.21 
 
 		 240 aa  72  0.000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03460  urease accessory protein UreF  27.03 
 
 		 238 aa  71.2  0.00000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0394  Urease accessory protein UreF  26.64 
 
 		 227 aa  70.5  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1465  Urease accessory protein UreF  28.21 
 
 		 240 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0475  urease accessory protein UreF  24.46 
 
 		 235 aa  70.1  0.00000000003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3558  urease accessory protein  24.57 
 
 		 228 aa  69.7  0.00000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.45506  normal  0.0231315 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1135  urease accessory protein UreF  24.57 
 
 		 228 aa  69.7  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1081  urease accessory protein UreF  24.57 
 
 		 228 aa  69.3  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1360  urease accessory protein UreF, putative  27.62 
 
 		 243 aa  63.9  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.87156  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7006  urease accessory protein UreF  27.44 
 
 		 240 aa  63.9  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.891807 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5118  Urease accessory protein UreF  26.69 
 
 		 240 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1191  urease accessory protein UreF  26.5 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.424033  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2456  urease accessory protein UreF  31.11 
 
 		 245 aa  63.5  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0958  urease accessory protein UreF  26.76 
 
 		 230 aa  62  0.000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2769  Urease accessory protein UreF  25.57 
 
 		 225 aa  62  0.000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4444  urease accessory protein UreF  29.31 
 
 		 225 aa  61.6  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.8214 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3690  urease accessory protein UreF  29.63 
 
 		 241 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0972  urease accessory protein UreF  29.25 
 
 		 232 aa  60.8  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1494  urease accessory protein UreF  30.4 
 
 		 236 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.36478  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4635  urease accessory protein UreF  25.68 
 
 		 229 aa  57.8  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00483851  normal  0.066113 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1348  urease accessory protein UreF  27.54 
 
 		 233 aa  58.2  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3941  Urease accessory protein UreF  31.78 
 
 		 259 aa  58.2  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.552118  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0562  urease accessory protein UreF  29.15 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3469  urease accessory protein  28.21 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3532  urease accessory protein UreF  30.05 
 
 		 251 aa  57  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510813  normal  0.516432 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4416  Urease accessory protein UreF  25.22 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4452  urease accessory protein UreF  29.65 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3407  urease accessory protein UreF  27.83 
 
 		 225 aa  57  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.195199  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0751  urease accessory protein UreF  24.12 
 
 		 232 aa  57  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3696  putative urease accessory protein UreF  30.43 
 
 		 226 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.378168 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2303  urease accessory protein UreF  29.96 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4910  urease accessory protein UreF  28.76 
 
 		 224 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1765  urease accessory protein UreF  30.84 
 
 		 227 aa  54.7  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.858852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0061  Urease accessory protein UreF  30.21 
 
 		 239 aa  54.7  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2716  urease accessory protein UreF  28.96 
 
 		 229 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0885  urease accessory protein UreF  24.54 
 
 		 199 aa  54.3  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3106  Urease accessory protein UreF  30.73 
 
 		 253 aa  53.9  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2420  urease accessory protein UreF  26.13 
 
 		 224 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0454768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1070  urease accessory protein UreF  25.33 
 
 		 250 aa  54.3  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2841  urease accessory protein UreF  26.58 
 
 		 224 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1868  urease accessory protein UreF  28.57 
 
 		 237 aa  53.1  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.113809  normal  0.0733507 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0223  urease accessory protein UreF  25.94 
 
 		 221 aa  53.1  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1681  urease accessory protein UreF  26.29 
 
 		 231 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.591777  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2848  urease accessory protein UreF  26.13 
 
 		 224 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2996  urease accessory protein UreF  25.21 
 
 		 232 aa  52.8  0.000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2186  urease accessory protein UreF  29.52 
 
 		 226 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2555  urease accessory protein UreF  29.52 
 
 		 226 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4247  Urease accessory protein UreF  27.36 
 
 		 223 aa  52  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2412  urease accessory protein UreF  27.27 
 
 		 243 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3137  urease accessory protein  29.52 
 
 		 236 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1243  urease accessory protein UreF  26.85 
 
 		 226 aa  51.2  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0721  urease accessory protein UreF  29.52 
 
 		 236 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3078  urease accessory protein UreF  29.52 
 
 		 236 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3114  urease accessory protein UreF  29.52 
 
 		 236 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.720901  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2059  urease accessory protein UreF  29.52 
 
 		 236 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.917688  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0337  urease accessory protein UreF, putative  27.03 
 
 		 228 aa  50.1  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2932  urease accessory protein UreF  27.03 
 
 		 224 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.617644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2267  Urease accessory protein UreF  26.36 
 
 		 227 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0777  urease accessory protein UreF  27.56 
 
 		 226 aa  49.7  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1029  urease accessory protein UreF  26.99 
 
 		 231 aa  49.7  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.185094 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0788  urease accessory protein UreF  27.11 
 
 		 226 aa  49.3  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4159  urease accessory protein UreF  29.95 
 
 		 309 aa  49.3  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.896165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4179  Urease accessory protein UreF  28.18 
 
 		 240 aa  49.3  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4004  urease accessory protein UreF  28 
 
 		 226 aa  48.9  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.471956 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3351  urease accessory protein UreF  28.63 
 
 		 214 aa  48.9  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.742339  normal  0.590794 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2878  urease accessory protein UreF  26.27 
 
 		 224 aa  48.9  0.00008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2686  urease accessory protein UreF  29.11 
 
 		 223 aa  48.9  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.885864  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0419  urease accessory protein UreF  29.18 
 
 		 226 aa  48.5  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.885315  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0898  urease accessory protein UreF  29.18 
 
 		 226 aa  48.5  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.4737  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0926  Urease accessory protein UreF  27.43 
 
 		 226 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1553  Urease accessory protein UreF  25.55 
 
 		 266 aa  47.4  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1092  Urease accessory protein UreF  30.52 
 
 		 239 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.827823  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0664  urease accessory protein  32.64 
 
 		 237 aa  47.4  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1947  urease accessory protein UreF  29.86 
 
 		 210 aa  47.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0218708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0868  urease accessory protein UreF  28.76 
 
 		 226 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.947799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2064  Urease accessory protein UreF  29.47 
 
 		 233 aa  47  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000168254  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0303  urease accessory protein UreF  29.38 
 
 		 210 aa  47  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0381  urease accessory protein UreF  27.52 
 
 		 214 aa  46.6  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2492  urease accessory protein UreF  27.9 
 
 		 226 aa  46.6  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1425  urease accessory protein UreF  27.19 
 
 		 228 aa  45.8  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3014  urease accessory protein UreF  26.17 
 
 		 244 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.347135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3497  urease accessory protein UreF  28.57 
 
 		 288 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.977341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0963  urease accessory protein UreF  28.4 
 
 		 230 aa  45.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0374203 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2991  urease accessory protein UreF  27.75 
 
 		 231 aa  45.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.901747  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0991  urease accessory protein UreF  29.58 
 
 		 210 aa  44.7  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3203  Urease accessory protein UreF  25.76 
 
 		 224 aa  45.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1325  UreF  24.78 
 
 		 224 aa  45.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>