More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4208 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_4208  ABC transporter related  100 
 
 		 259 aa  523  1e-147  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.216792  normal  0.888078 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0588  ABC transporter related  55.04 
 
 		 239 aa  288  4e-77  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0166343  hitchhiker  0.0000000000281481 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0534  ATPase component ABC-type transport system  59.41 
 
 		 240 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.32942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0868  ABC transporter related  57.98 
 
 		 254 aa  284  9e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1661  ABC transporter, ATPase subunit  59.17 
 
 		 242 aa  283  2.0000000000000002e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.138216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2167  ABC transporter related  58.97 
 
 		 247 aa  282  3.0000000000000004e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1196  ABC transporter related protein  56.12 
 
 		 243 aa  281  5.000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1602  ABC transporter related  55.65 
 
 		 242 aa  276  2e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.752612 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0141  ABC transporter related  54.39 
 
 		 240 aa  276  3e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.911941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2070  ABC transporter related  58.12 
 
 		 245 aa  275  4e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0552622  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2798  ABC transporter related protein  53.97 
 
 		 277 aa  275  4e-73  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17500  ABC transporter related  54.01 
 
 		 239 aa  275  5e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0533908  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0973  ABC transporter related  55.97 
 
 		 247 aa  275  5e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.059424  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3669  ABC transporter, ATP-binding protein  56.41 
 
 		 245 aa  274  9e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4049  ABC transporter related  55.7 
 
 		 243 aa  273  2.0000000000000002e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000937515 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12363  ABC transporter, ATP-binding protein  52.94 
 
 		 246 aa  272  3e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1421  hypothetical protein  55.04 
 
 		 243 aa  273  3e-72  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.872796 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3668  ABC transporter related  54.29 
 
 		 261 aa  273  3e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0047  ABC transporter related  52.51 
 
 		 258 aa  272  4.0000000000000004e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.132774 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0428  ABC transporter related  53.97 
 
 		 241 aa  272  4.0000000000000004e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.02513 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1770  ATPase  54.43 
 
 		 240 aa  272  4.0000000000000004e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.464592  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2229  ABC transporter related  55 
 
 		 241 aa  271  5.000000000000001e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0587  ABC transporter related  52.92 
 
 		 256 aa  271  9e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.410332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0169  ABC transporter related  51.15 
 
 		 279 aa  270  1e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0174  ABC transporter, ATPase subunit  56.52 
 
 		 332 aa  270  1e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.645822 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0063  ABC transporter related  52.12 
 
 		 258 aa  270  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0304  ABC transporter-related protein  52.67 
 
 		 263 aa  271  1e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0050  ABC transporter related  53.94 
 
 		 316 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.161692  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0752  ABC transporter related protein  55.74 
 
 		 247 aa  270  2e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.306795  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0122  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.22 
 
 		 336 aa  270  2e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.069577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1282  ABC transporter-related protein  56.96 
 
 		 246 aa  270  2e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000182009 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4957  ABC transporter related  54.74 
 
 		 256 aa  270  2e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0727  ABC transporter related  55.83 
 
 		 241 aa  270  2e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1145  ABC transporter related  54.37 
 
 		 282 aa  270  2e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0734842  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3376  ABC transporter related  54.04 
 
 		 243 aa  270  2e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.681925  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2125  ABC transporter related  57.14 
 
 		 241 aa  269  2.9999999999999997e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0158  ABC transporter related  55.6 
 
 		 321 aa  269  2.9999999999999997e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.44909 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0152  ABC transporter, ATP-binding protein  54.94 
 
 		 254 aa  268  4e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0336404  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0176  ABC transporter related  56.09 
 
 		 333 aa  269  4e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.102512  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0157  ABC transporter, ATP-binding protein  54.94 
 
 		 277 aa  268  5e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0065  ABC transporter related  55.19 
 
 		 310 aa  268  5e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127578  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4542  ABC transporter, ATP-binding protein  52.77 
 
 		 246 aa  268  8.999999999999999e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.979233  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2117  ABC transporter related  52.72 
 
 		 244 aa  267  1e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2108  ABC transporter, ATP-binding protein  50.84 
 
 		 241 aa  266  2e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0285  ABC transporter related  51.68 
 
 		 246 aa  266  2e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4226  ABC transporter-related protein  52.63 
 
 		 268 aa  267  2e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.219808 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3684  ABC transporter related  55.7 
 
 		 244 aa  266  2e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1888  ABC transporter, ATP-binding protein  54.39 
 
 		 246 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.986838  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0356  ABC transporter related  52.71 
 
 		 266 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0416  ABC transporter related  51.95 
 
 		 317 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5470  ABC transporter related  56.65 
 
 		 283 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.279643  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1517  ABC transporter related protein  49.62 
 
 		 260 aa  265  4e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.651098 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2428  ABC transporter related  53.12 
 
 		 289 aa  265  5e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.047746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4150  ABC transporter related  56.07 
 
 		 244 aa  265  5.999999999999999e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0106  ABC transporter related  52.99 
 
 		 253 aa  265  5.999999999999999e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.995719 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2723  ABC transporter related  55.27 
 
 		 290 aa  265  8e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.569692  normal  0.148561 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0656  ABC transporter related  55.22 
 
 		 314 aa  265  8e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.30871 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4486  ABC transporter related  52.47 
 
 		 268 aa  265  8e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.152694 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2500  ABC transporter related  52.73 
 
 		 289 aa  265  8e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0376779  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3335  ABC transporter related  52.3 
 
 		 250 aa  264  8.999999999999999e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1506  ABC transporter related  53.59 
 
 		 241 aa  264  8.999999999999999e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0341851  hitchhiker  0.00249161 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0595  ABC transporter related protein  55.23 
 
 		 249 aa  264  1e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.63679  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1911  ABC transporter related  54.09 
 
 		 255 aa  264  1e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0898  hypothetical protein  52.08 
 
 		 241 aa  263  2e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0867  hypothetical protein  52.08 
 
 		 241 aa  263  2e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0264  ABC transporter related  52.12 
 
 		 262 aa  263  2e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0291  ABC transporter related  52.12 
 
 		 262 aa  263  2e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.342823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2973  ABC transporter related  53.62 
 
 		 246 aa  263  3e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000014361  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0926  putative ABC transporter, ATPase subunit  50 
 
 		 265 aa  263  3e-69  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.617438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1638  ABC transporter-like  53.94 
 
 		 242 aa  263  3e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0878817  normal  0.874871 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0085  ABC transporter related  52.36 
 
 		 268 aa  262  3e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.329192  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1616  ABC transporter related  53.73 
 
 		 255 aa  262  3e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2183  ABC transporter related  54.33 
 
 		 282 aa  263  3e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0392022  normal  0.686559 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2891  ABC transporter ATP-binding protein  49.58 
 
 		 241 aa  263  3e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.724805  normal  0.0929005 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0490  ABC transporter related  53.75 
 
 		 243 aa  262  4e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.858965  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0177  ABC transporter related  54.78 
 
 		 317 aa  262  4e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.32716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1621  ABC transporter related  54.31 
 
 		 247 aa  262  4.999999999999999e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.724922  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0409  ABC transporter ATP-binding protein  53.63 
 
 		 262 aa  261  6e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0648772 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0777  ABC transporter related  53.47 
 
 		 264 aa  261  6e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1368  ABC transporter, ATP-binding protein  53.02 
 
 		 264 aa  261  6e-69  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.569741  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02228  ABC transporter ATP-binding protein  56.72 
 
 		 239 aa  261  6.999999999999999e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.622323  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2741  ABC transporter related protein  53.09 
 
 		 245 aa  261  6.999999999999999e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0628  ABC transporter, ATP-binding protein  53.59 
 
 		 251 aa  261  8.999999999999999e-69  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.263801 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2546  ABC transporter related  54.74 
 
 		 244 aa  261  8.999999999999999e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.651086  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3667  ABC transporter related  53.36 
 
 		 243 aa  261  1e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00165948  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0955  ABC transporter related  55.7 
 
 		 239 aa  260  1e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.236183 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1939  hypothetical protein  56.96 
 
 		 241 aa  261  1e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0687  ABC transporter related  53.36 
 
 		 243 aa  261  1e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000839172  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0717  ABC transporter related  53.36 
 
 		 243 aa  261  1e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.759015  normal  0.46231 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1488  ABC transporter related  52.7 
 
 		 265 aa  260  1e-68  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.123846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4239  ABC transporter related  52.26 
 
 		 243 aa  261  1e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000891993 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0708  ABC transporter related  53.36 
 
 		 243 aa  261  1e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.658002  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03663  hypothetical protein  51.07 
 
 		 241 aa  260  2e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0337  ABC transporter related  54.78 
 
 		 263 aa  260  2e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0323374  normal  0.155837 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0674  ABC transporter related  53.36 
 
 		 243 aa  260  2e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.120094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3348  ABC transporter related  53.36 
 
 		 243 aa  260  2e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00159492  normal  0.142579 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0673  ABC transporter related  53.36 
 
 		 243 aa  260  2e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.207873  normal  0.0972351 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2272  ABC transporter related  52.59 
 
 		 244 aa  260  2e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.638981  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4389  ABC transporter-like protein protein  55 
 
 		 242 aa  259  3e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0871  ABC transporter related  51.68 
 
 		 241 aa  259  3e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0818606  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>