More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4170 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_4170  FeS assembly protein SufD  100 
 
 		 445 aa  907    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0168  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  40.09 
 
 		 453 aa  280  3e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1697  FeS assembly protein SufD  38.76 
 
 		 434 aa  280  3e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1005  FeS assembly protein SufD  37.06 
 
 		 435 aa  258  1e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.868893 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0472  FeS assembly protein SufD  36.94 
 
 		 450 aa  236  6e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.337092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0781  FeS assembly protein SufD  32.34 
 
 		 444 aa  225  1e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0590112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0489  SufBD protein  34.45 
 
 		 417 aa  223  7e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.31169 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5393  FeS assembly protein SufD  36.39 
 
 		 420 aa  211  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4271  FeS assembly protein SufD  33.71 
 
 		 447 aa  206  6e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.707837  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2391  FeS assembly protein SufD  30.43 
 
 		 455 aa  206  6e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2488  FeS assembly protein SufD  31.44 
 
 		 446 aa  206  7e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0698  FeS assembly protein SufD  32.87 
 
 		 440 aa  200  3e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0845  FeS assembly protein SufD  33.57 
 
 		 437 aa  186  8e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.431893  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5779  FeS assembly protein SufD  30.91 
 
 		 439 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0895  FeS assembly protein SufD  33.1 
 
 		 437 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1235  FeS assembly protein SufD  32.03 
 
 		 445 aa  184  3e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.722398  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0891  FeS assembly protein SufD  32.95 
 
 		 439 aa  183  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0727  FeS assembly protein SufD  32.78 
 
 		 441 aa  182  1e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0537  FeS assembly protein SufD  32.32 
 
 		 445 aa  181  2e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0905  FeS assembly protein SufD  34.55 
 
 		 437 aa  180  4e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.915641 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0654  hypothetical protein  29.98 
 
 		 428 aa  179  5.999999999999999e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1862  FeS assembly protein SufD  32.4 
 
 		 442 aa  179  9e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2024  FeS assembly protein SufD  29.98 
 
 		 444 aa  178  1e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.554026  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0638  hypothetical protein  29.57 
 
 		 428 aa  174  1.9999999999999998e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0959  FeS assembly protein SufD  29.4 
 
 		 404 aa  172  6.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0242  hypothetical protein  28.88 
 
 		 439 aa  172  1e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0174  FeS assembly protein SufD  30.09 
 
 		 441 aa  168  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000908978 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3443  FeS assembly protein SufD  31.83 
 
 		 451 aa  166  8e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.656128  hitchhiker  0.0000000788125 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0305  FeS assembly protein SufD  27.84 
 
 		 405 aa  166  9e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0845651 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1194  FeS assembly protein SufD  31.48 
 
 		 426 aa  166  1.0000000000000001e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0412715  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1850  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  32.67 
 
 		 441 aa  166  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0513191  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4357  FeS assembly protein SufD  28.94 
 
 		 453 aa  165  1.0000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.352914 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3578  FeS assembly protein SufD  28.77 
 
 		 430 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2182  FeS assembly protein SufD  31.27 
 
 		 430 aa  164  3e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00372384  hitchhiker  0.000585375 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1513  FeS assembly protein SufD  27.87 
 
 		 426 aa  163  4.0000000000000004e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0377  FeS assembly protein SufB  30.19 
 
 		 475 aa  163  5.0000000000000005e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.358098  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0709  FeS assembly protein SufD  28.18 
 
 		 405 aa  163  6e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1446  SufD  27.87 
 
 		 426 aa  163  6e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2591  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  32.42 
 
 		 441 aa  162  8.000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1506  FeS assembly protein SufD  29.6 
 
 		 475 aa  161  2e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.187123  normal  0.203513 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3153  FeS assembly protein SufD  28.18 
 
 		 428 aa  160  4e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2447  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  30.31 
 
 		 448 aa  160  5e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0918237  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0426  FeS assembly protein SufD  31.09 
 
 		 454 aa  160  5e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1416  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  28.38 
 
 		 439 aa  160  6e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.199083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2331  FeS assembly protein SufB  30.19 
 
 		 467 aa  159  7e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.291789  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2508  FeS assembly protein SufD  30.39 
 
 		 392 aa  159  7e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.62478  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0860  FeS assembly protein SufD  27.88 
 
 		 435 aa  158  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0844  FeS assembly protein SufD  27.88 
 
 		 435 aa  158  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0175  FeS assembly protein SufB  26.87 
 
 		 476 aa  159  1e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0990  FeS assembly protein SufD  31.4 
 
 		 434 aa  158  2e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0116  FeS assembly protein SufD  27.53 
 
 		 430 aa  158  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2922  FeS assembly protein SufD  27.31 
 
 		 437 aa  157  3e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4691  iron-regulated ABC transporter  27.29 
 
 		 430 aa  157  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4804  FeS assembly protein SufD  27.53 
 
 		 430 aa  157  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5122  FeS assembly protein SufD  27.53 
 
 		 430 aa  157  4e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.273896  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0497  FeS assembly protein SufD  27.84 
 
 		 435 aa  157  5.0000000000000005e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4850  hypothetical protein  27.29 
 
 		 430 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4706  iron-regulated ABC transporter  27.29 
 
 		 430 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5216  hypothetical protein  27.29 
 
 		 430 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2919  FeS assembly protein SufB  26.17 
 
 		 476 aa  157  5.0000000000000005e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3038  FeS assembly protein SufD  28.37 
 
 		 436 aa  156  8e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0292386 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3282  FeS assembly protein SufD  31.24 
 
 		 467 aa  155  9e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.534903  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1237  FeS assembly protein SufD  27.56 
 
 		 433 aa  155  9e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5119  hypothetical protein  28.24 
 
 		 430 aa  155  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2264  FeS assembly protein SufD  33.54 
 
 		 407 aa  155  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.125188 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5124  FeS assembly protein SufD  27.06 
 
 		 430 aa  155  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.233215  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2065  FeS assembly protein SufD  33.43 
 
 		 440 aa  155  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5087  FeS assembly protein SufD  27.29 
 
 		 430 aa  155  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3231  FeS assembly protein SufB  26.59 
 
 		 475 aa  154  2e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2431  FeS assembly protein SufB  26.87 
 
 		 476 aa  154  2.9999999999999998e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2749  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  29.7 
 
 		 448 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0636938  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1502  SufBD protein  29.79 
 
 		 406 aa  154  4e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04460  FeS assembly protein SufD  27.03 
 
 		 437 aa  153  5e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.934772  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0266  FeS assembly protein SufB  27.19 
 
 		 470 aa  153  5.9999999999999996e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0582539  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2384  FeS assembly protein SufD  33.9 
 
 		 393 aa  151  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.426973  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1136  FeS assembly protein SufD  39.09 
 
 		 407 aa  151  2e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0309349 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0581  FeS assembly protein SufD  28.81 
 
 		 434 aa  150  3e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.19168  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1180  FeS assembly protein SufD  27.38 
 
 		 438 aa  150  4e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16140  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  31.94 
 
 		 389 aa  150  5e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1737  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  30.34 
 
 		 442 aa  150  5e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1840  FeS assembly protein SufB  29.46 
 
 		 474 aa  150  6e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1639  FeS assembly protein SufB  31.03 
 
 		 470 aa  149  7e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.280246  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1897  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  30.69 
 
 		 423 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00143509  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01650  component of SufBCD complex  30.69 
 
 		 423 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000917299  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1762  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  30.69 
 
 		 423 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0210181  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2395  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  30.02 
 
 		 423 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.087197  hitchhiker  0.000115041 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1950  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  30.69 
 
 		 423 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0520002  hitchhiker  0.00000220398 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2571  FeS assembly protein SufD  27.01 
 
 		 447 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.993498  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2551  FeS assembly protein SufD  29.06 
 
 		 401 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01640  hypothetical protein  30.69 
 
 		 423 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000779694  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1501  FeS assembly protein SufB  25.17 
 
 		 476 aa  148  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1515  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  30.69 
 
 		 423 aa  147  3e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.252227  hitchhiker  0.00000429728 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2326  FeS assembly protein SufD  27.42 
 
 		 441 aa  147  3e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.254342  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1763  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  30.71 
 
 		 423 aa  147  3e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.182167  hitchhiker  0.0000315224 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0174  SufBD protein  28.87 
 
 		 404 aa  147  4.0000000000000006e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1846  FeS assembly protein SufD  27.18 
 
 		 413 aa  147  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000255437 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1906  FeS assembly protein SufB  28.62 
 
 		 479 aa  145  1e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1799  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  30.73 
 
 		 423 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.024835  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2086  FeS assembly protein SufD  29.25 
 
 		 381 aa  145  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.826381 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1744  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  32.12 
 
 		 441 aa  145  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000189062  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>