More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3996 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_3996  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  100 
 
 
308 aa  623  1e-177  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.206121  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1277  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  66.32 
 
 
296 aa  394  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4056  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.59 
 
 
296 aa  388  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.340468 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0555  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  65.86 
 
 
296 aa  390  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1079  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.9 
 
 
296 aa  385  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.857116  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4290  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  64.93 
 
 
294 aa  385  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4018  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.87 
 
 
305 aa  385  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.520137 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3933  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.27 
 
 
296 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.527502  normal  0.192647 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0625  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.6 
 
 
290 aa  381  1e-105  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.150141 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2319  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  64.83 
 
 
293 aa  383  1e-105  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.103885 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3810  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.07 
 
 
292 aa  381  1e-105  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1395  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.98 
 
 
296 aa  381  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0539  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  65.17 
 
 
294 aa  380  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.911631  normal  0.057049 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2101  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  65.61 
 
 
294 aa  379  1e-104  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.338319  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15940  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.67 
 
 
293 aa  379  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68200  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.45 
 
 
293 aa  378  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0399407 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03667  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  64.31 
 
 
293 aa  377  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4187  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  64.31 
 
 
293 aa  377  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4300  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  64.31 
 
 
293 aa  377  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.671584  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0696  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  64.48 
 
 
294 aa  376  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.53714  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1238  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.72 
 
 
296 aa  375  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4134  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  65.37 
 
 
293 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.886764  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2677  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.46 
 
 
292 aa  374  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.475432  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4006  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  64.31 
 
 
293 aa  377  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2858  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.11 
 
 
289 aa  376  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0450568  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4153  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  64.31 
 
 
293 aa  377  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6247  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.36 
 
 
298 aa  374  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0385422  normal  0.992107 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4214  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  64.31 
 
 
293 aa  377  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2893  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  66.09 
 
 
294 aa  377  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.413887 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0123  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  64.21 
 
 
291 aa  374  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5902  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.1 
 
 
293 aa  375  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4132  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  64.31 
 
 
293 aa  377  1e-103  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2263  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.71 
 
 
305 aa  377  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3295  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  66.09 
 
 
294 aa  377  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00238421  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0166  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.6 
 
 
293 aa  377  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.455037  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03616  hypothetical protein  64.31 
 
 
293 aa  377  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0924  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, long form  62.98 
 
 
293 aa  372  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.390731 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1214  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  59.58 
 
 
296 aa  372  1e-102  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.942362  decreased coverage  0.00289209 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4445  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  64.71 
 
 
294 aa  372  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1494  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.72 
 
 
287 aa  372  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1299  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.11 
 
 
291 aa  374  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1565  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  64.31 
 
 
292 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.995779 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3238  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.63 
 
 
301 aa  372  1e-102  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6649  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.36 
 
 
298 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5222  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.96 
 
 
293 aa  374  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.350144  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3016  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  59.38 
 
 
289 aa  370  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00414881  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2558  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.46 
 
 
295 aa  370  1e-101  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0517  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.48 
 
 
293 aa  369  1e-101  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1983  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.37 
 
 
287 aa  369  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.967411  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0838  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.98 
 
 
293 aa  368  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.22071  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4028  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.48 
 
 
310 aa  368  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2131  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.42 
 
 
297 aa  368  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4472  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.75 
 
 
292 aa  369  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0455332  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3386  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.99 
 
 
298 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.718729  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0187  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.48 
 
 
293 aa  369  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2240  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60 
 
 
305 aa  368  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.572666 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0879  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60 
 
 
297 aa  366  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0478  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.41 
 
 
293 aa  365  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.543511  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2597  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.34 
 
 
297 aa  365  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1194  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  59.86 
 
 
292 aa  366  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0714  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.21 
 
 
295 aa  366  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0545  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, long form  64.08 
 
 
291 aa  366  1e-100  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.771831 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3970  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.03 
 
 
297 aa  366  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00629806  normal  0.592005 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2652  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.28 
 
 
291 aa  364  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3075  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.13 
 
 
293 aa  365  1e-100  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.589168  normal  0.11788 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1574  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.54 
 
 
292 aa  364  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.446194 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2733  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  59.52 
 
 
292 aa  364  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3556  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  64.21 
 
 
294 aa  365  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.305082  normal  0.867096 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4290  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.35 
 
 
290 aa  367  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.314543 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2458  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.9 
 
 
291 aa  365  1e-100  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4130  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.67 
 
 
294 aa  365  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000069205 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1406  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.11 
 
 
290 aa  364  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0680028  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2181  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  59.72 
 
 
289 aa  367  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112189  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2318  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.69 
 
 
297 aa  365  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.233006 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01945  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  59.31 
 
 
292 aa  363  1e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4427  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.67 
 
 
294 aa  364  1e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2032  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.14 
 
 
312 aa  364  1e-99  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5841  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  64.24 
 
 
286 aa  363  1e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.572504 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4164  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.76 
 
 
291 aa  363  1e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.375509  normal  0.0599581 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1470  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  59.86 
 
 
312 aa  363  2e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.759037  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1181  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.11 
 
 
289 aa  363  2e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.25108  normal  0.28241 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0390  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  59.66 
 
 
297 aa  363  2e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0331  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.9 
 
 
291 aa  363  2e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.284071  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0752  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.38 
 
 
297 aa  363  2e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1059  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.03 
 
 
291 aa  363  3e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0639  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.34 
 
 
294 aa  363  3e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.477683 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1283  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.46 
 
 
295 aa  362  4e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0702  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.35 
 
 
307 aa  362  4e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00504967  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0872  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  59.31 
 
 
297 aa  362  4e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1603  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  58.97 
 
 
292 aa  362  4e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.982513  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4021  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.98 
 
 
289 aa  362  5.0000000000000005e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.401685  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0621  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  59.86 
 
 
293 aa  362  5.0000000000000005e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.252794 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4022  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.11 
 
 
286 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1786  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  59.36 
 
 
292 aa  362  5.0000000000000005e-99  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2130  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.84 
 
 
293 aa  362  6e-99  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_007952  Bxe_B1715  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60 
 
 
297 aa  362  6e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.703429 
 
 
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NC_009052  Sbal_2889  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.7 
 
 
286 aa  361  7.0000000000000005e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.4055  n/a   
 
 
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NC_010508  Bcenmc03_0843  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  59.31 
 
 
297 aa  361  7.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0237145 
 
 
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NC_012850  Rleg_1270  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.75 
 
 
289 aa  361  7.0000000000000005e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.106852  normal  0.0645307 
 
 
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NC_013132  Cpin_0181  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.75 
 
 
289 aa  361  7.0000000000000005e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
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