More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3978 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_3978  nucleotidyl transferase  100 
 
 
245 aa  497  1e-140  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5466  Nucleotidyl transferase  45.76 
 
 
241 aa  176  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0205  D-glycero-D-manno-heptose 1-phosphate guanosyltransferase  37.05 
 
 
236 aa  160  2e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0148  nucleotidyl transferase  36.02 
 
 
236 aa  156  4e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3597  Nucleotidyl transferase  37.66 
 
 
242 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2335  putative nucleotidyl transferase  31.28 
 
 
237 aa  111  9e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.512409 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1452  Nucleotidyl transferase  31.58 
 
 
243 aa  102  7e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.748194  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3661  nucleotidyl transferase  30.84 
 
 
223 aa  95.5  6e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0915  nucleotidyl transferase  31.28 
 
 
222 aa  95.5  7e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.177826  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0197  nucleotidyl transferase  30.22 
 
 
223 aa  95.1  8e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0927184  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2073  mannose-1-phosphate guanyltransferase  30.51 
 
 
219 aa  95.1  1e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.403503  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0673  Nucleotidyl transferase  31.22 
 
 
242 aa  94.7  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0109  nucleotidyl transferase family protein  30.51 
 
 
219 aa  94  2e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00238886  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1018  nucleotidyl transferase  31.06 
 
 
228 aa  91.3  1e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.352994  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4026  putative nucleotidyl transferase  31.09 
 
 
241 aa  90.9  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0975  Nucleotidyl transferase  27.59 
 
 
236 aa  90.1  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.395928  normal  0.0477553 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2147  nucleotidyl transferase  28.82 
 
 
221 aa  89.4  5e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0598  nucleotidyl transferase  27.64 
 
 
348 aa  88.6  8e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.534705  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0565  nucleotidyl transferase  29.91 
 
 
222 aa  87  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0541  nucleotidyl transferase  25.22 
 
 
238 aa  87.4  2e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4822  nucleotidyl transferase  34.74 
 
 
326 aa  86.7  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1080  Nucleotidyl transferase  28.57 
 
 
391 aa  87  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.380619 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0920  Nucleotidyl transferase  28.76 
 
 
391 aa  86.3  4e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02245  nucleotidyl transferase  30.67 
 
 
236 aa  86.3  5e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.9499  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0365  Nucleotidyl transferase  28.25 
 
 
355 aa  85.9  6e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0937  nucleotidyl transferase  28.33 
 
 
272 aa  85.9  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2394  nucleotidyl transferase  28.14 
 
 
346 aa  85.5  7e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.503393 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1716  nucleotidyl transferase  27.5 
 
 
240 aa  85.1  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0694785  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3416  nucleotidyl transferase  29.22 
 
 
250 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.307515  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0792  Nucleotidyl transferase  33.86 
 
 
237 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0497  Nucleotidyl transferase  27.78 
 
 
232 aa  84  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.756206  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0599  nucleotidyltransferase family protein  31.56 
 
 
232 aa  84.3  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1064  Nucleotidyl transferase  30.25 
 
 
363 aa  84  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.292184  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4622  nucleotidyl transferase  29.57 
 
 
240 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0978754  normal  0.426238 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1374  mannose-1-phosphate guanyltransferase  30.63 
 
 
364 aa  84  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0744  nucleotidyl transferase  31.13 
 
 
364 aa  84  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.196844 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2020  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  27.04 
 
 
397 aa  83.6  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6040  nucleotidyl transferase  31.56 
 
 
239 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0867  nucleotidyl transferase  31.22 
 
 
222 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0335423  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0387  Nucleotidyl transferase  31.36 
 
 
230 aa  83.2  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1489  nucleotidyl transferase  32.48 
 
 
230 aa  82.8  0.000000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.523541  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1123  nucleotidyl transferase  30.49 
 
 
854 aa  82.8  0.000000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0884  nucleotidyl transferase  35.37 
 
 
249 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000795934  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1584  nucleotidyl transferase  29.17 
 
 
238 aa  82.4  0.000000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
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NC_008577  Shewana3_3204  nucleotidyl transferase  29.96 
 
 
221 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0602858  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2814  nucleotidyl transferase  29.96 
 
 
226 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.164974  normal  0.604361 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3512  nucleotidyl transferase  29 
 
 
228 aa  82.4  0.000000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4057  nucleotidyl transferase  30.25 
 
 
245 aa  82.4  0.000000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5130  nucleotidyl transferase  27.31 
 
 
223 aa  82.4  0.000000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2995  nucleotidyl transferase  42.31 
 
 
785 aa  82  0.000000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2740  nucleotidyl transferase  30.36 
 
 
240 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.518203  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3102  mannose-1-phosphate guanyltransferase  27.73 
 
 
352 aa  81.6  0.000000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0481  nucleotidyl transferase  28.24 
 
 
267 aa  81.3  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.436885 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4080  Nucleotidyl transferase  30.63 
 
 
351 aa  81.6  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1239  Nucleotidyl transferase  28.57 
 
 
347 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2101  nucleotidyl transferase  30.36 
 
 
240 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.539682  n/a   
 
 
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NC_009831  Ssed_0969  nucleotidyl transferase  31.69 
 
 
229 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0165491  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2713  nucleotidyl transferase  30.36 
 
 
240 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0963  nucleotidyl transferase  37.5 
 
 
244 aa  81.3  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.168083  hitchhiker  0.00146596 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0511  putative mannose-1-phosphate guanyltransferase-related protein  27.8 
 
 
241 aa  80.5  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.560778  normal  0.0591515 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0556  nucleotidyltransferase family protein  29.77 
 
 
210 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4179  Nucleotidyl transferase  27.98 
 
 
365 aa  80.9  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.219549  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3958  nucleotidyl transferase  27.24 
 
 
271 aa  80.9  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0238  D,D-heptose 1,7-bisphosphate phosphatase  33.05 
 
 
408 aa  80.5  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.546722 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0402  Nucleotidyl transferase  30 
 
 
234 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.707685 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0704  nucleotidyl transferase family protein  28.51 
 
 
239 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1019  nucleotidyl transferase  41.44 
 
 
229 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.176753  normal  0.0292468 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2341  nucleotidyl transferase  24.46 
 
 
396 aa  80.1  0.00000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00221584  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3308  nucleotidyl transferase  27.24 
 
 
271 aa  80.5  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3110  nucleotidyl transferase  29.82 
 
 
222 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.133152  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0492  nucleotidyl transferase  31.76 
 
 
230 aa  79.7  0.00000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000162703 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4796  nucleotidyl transferase  30.09 
 
 
223 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.814441  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1580  nucleotidyl transferase  26.94 
 
 
352 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.995766  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0359  Nucleotidyl transferase  30.57 
 
 
347 aa  79.3  0.00000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0373  hypothetical protein  39.64 
 
 
220 aa  79.3  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0348  hypothetical protein  39.64 
 
 
220 aa  79.3  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1852  nucleotidyl transferase  29.57 
 
 
370 aa  79.3  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4169  nucleotidyl transferase family protein  35.66 
 
 
784 aa  79  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06180  Nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase family protein  31.75 
 
 
359 aa  79.3  0.00000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0622435  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1357  nucleotidyl transferase  27.68 
 
 
359 aa  79  0.00000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00960312  normal  0.366439 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4491  nucleotidyl transferase family protein  35.66 
 
 
784 aa  79  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5876  nucleotidyl transferase  28.87 
 
 
357 aa  79  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.624445  normal  0.732322 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0737  nucleotidyl transferase  27.56 
 
 
357 aa  79.3  0.00000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.879816 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4287  nucleotidyl transferase family protein  35.66 
 
 
784 aa  79  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.268164 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1321  nucleotidyl transferase  27.68 
 
 
359 aa  79  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.254091  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2765  nucleotidyl transferase  30.61 
 
 
239 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1338  nucleotidyl transferase  27.68 
 
 
359 aa  79  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4007  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  35.66 
 
 
784 aa  79  0.00000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4017  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  35.66 
 
 
784 aa  79  0.00000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.688327  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0493  nucleotidyl transferase  29.06 
 
 
245 aa  79  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.427783  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1456  nucleotidyl transferase  26.85 
 
 
361 aa  79  0.00000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_010577  XfasM23_1646  nucleotidyl transferase  26.67 
 
 
240 aa  79  0.00000000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.233302  n/a   
 
 
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NC_008701  Pisl_0370  nucleotidyl transferase  45.13 
 
 
227 aa  79  0.00000000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.357076 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0910  nucleotidyl transferase  29.39 
 
 
222 aa  78.6  0.00000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00048093  normal  0.372808 
 
 
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NC_004347  SO_3634  nucleotidyltransferase family protein  28.33 
 
 
226 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_008836  BMA10229_A2339  nucleotidyltransferase family protein  28.09 
 
 
239 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.329535  n/a   
 
 
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NC_007577  PMT9312_0154  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  28.57 
 
 
392 aa  78.2  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009802  CCC13826_2301  nucleotidyl transferase  24.77 
 
 
348 aa  77.8  0.0000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008816  A9601_01691  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  28.57 
 
 
392 aa  77.8  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009091  P9301_01711  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  28.57 
 
 
392 aa  77.8  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.602072  n/a   
 
 
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