More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3973 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_2296  glycosyl transferase family protein  57.19 
 
 
632 aa  651    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.870587  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3973  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
1275 aa  2588    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1492  glycosyl transferase family 2  57.79 
 
 
958 aa  653    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0396  glycosyl transferase family protein  53.51 
 
 
625 aa  623  1e-177  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0878  glycosyl transferase family protein  53.51 
 
 
625 aa  623  1e-177  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3926  glycosyl transferase family protein  54.39 
 
 
1509 aa  622  1e-176  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.554209  normal  0.869546 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0849  glycosyl transferase family protein  54.5 
 
 
625 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.33844 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1074  glycosyl transferase, group 2 family protein  53.38 
 
 
1561 aa  595  1e-168  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.755532  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1503  glycosyl transferase family 2  53.35 
 
 
733 aa  590  1e-167  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0883  glycosyl transferase family 2  52.81 
 
 
723 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0852  glycosyl transferase family protein  49.74 
 
 
765 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00968  putative glycosyltransferase family 2 protein  51.5 
 
 
731 aa  571  1e-161  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0288  glycosyl transferase family protein  53.52 
 
 
709 aa  560  1e-158  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0772  glycosyl transferase family protein  53.52 
 
 
709 aa  560  1e-158  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0906  glycosyl transferase family 2  46.98 
 
 
1152 aa  536  1e-151  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1253  glycosyl transferase family 2  46.37 
 
 
1067 aa  536  1e-150  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0933  glycosyl transferase family 2  46.82 
 
 
1152 aa  535  1e-150  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1576  glycosyl transferase family 2  44.73 
 
 
746 aa  518  1.0000000000000001e-145  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2408  glycosyl transferase family 2  44.13 
 
 
1334 aa  513  1e-143  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1840  glycosyl transferase family 2  50.62 
 
 
710 aa  497  1e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0202284  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1948  glycosyl transferase family 2  49.06 
 
 
721 aa  488  1e-136  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2225  glycosyl transferase family 2  50.09 
 
 
717 aa  483  1e-134  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.432582 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1949  glycosyl transferase family protein  49.64 
 
 
717 aa  479  1e-133  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603088  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0354  glycosyl transferase family protein  43.83 
 
 
658 aa  477  1e-133  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1729  glycosyl transferase family protein  50.38 
 
 
728 aa  476  1e-132  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.95068 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  45.07 
 
 
1486 aa  458  1e-127  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0315  glycosyl transferase family protein  50.27 
 
 
775 aa  459  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.177291 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1360  glycosyl transferase, group 1  43.87 
 
 
1991 aa  455  1.0000000000000001e-126  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.976549  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0725  glycosyl transferase family protein  43.74 
 
 
734 aa  456  1.0000000000000001e-126  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.492928  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4005  glycosyl transferase family 2  40.69 
 
 
790 aa  433  1e-120  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.318857  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0192  glycosyl transferase family protein  43.29 
 
 
996 aa  425  1e-117  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1971  glycosyl transferase family 2  43.84 
 
 
1084 aa  421  1e-116  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15980  Glycosyl transferase, family 2  41.33 
 
 
1182 aa  414  1e-114  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.967945  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2999  glycosyl transferase family 2  43.07 
 
 
988 aa  414  1e-114  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0236  hypothetical protein  39.65 
 
 
783 aa  401  9.999999999999999e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000717832  normal  0.75423 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2042  glycosyl transferase family 2  39.36 
 
 
832 aa  397  1e-109  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.635088  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4777  glycosyl transferase family 2  39.6 
 
 
742 aa  396  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4260  glycosyl transferase family protein  39.1 
 
 
742 aa  394  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109167  normal  0.249298 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1525  glycosyl transferase family 2  40.6 
 
 
857 aa  393  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0767  glycosyl transferase family 2  48.86 
 
 
602 aa  390  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4626  glycosyl transferase family 2  38.77 
 
 
742 aa  387  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.18553  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0542  glycosyl transferase family protein  42.83 
 
 
983 aa  387  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.211097  normal  0.295918 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2052  glycosyl transferase family 2  41.05 
 
 
794 aa  382  1e-104  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.039975  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2921  glycosyl transferase family protein  39.7 
 
 
880 aa  374  1e-102  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0620  glycosyl transferase, group 2 family protein  46.55 
 
 
610 aa  369  1e-100  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2009  glycosyl transferase  33.01 
 
 
810 aa  359  1.9999999999999998e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1815  glycosyl transferase family 2  39.11 
 
 
958 aa  337  9e-91  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.613695  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3207  glycosyl transferase family protein  42.61 
 
 
576 aa  319  2e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0775  glycosyl transferase family 2  35.7 
 
 
617 aa  297  1e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  34.4 
 
 
1644 aa  295  4e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  34.4 
 
 
1644 aa  295  4e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4407  glycosyl transferase family protein  42.69 
 
 
1359 aa  293  1e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0769  glycosyl transferase family 2  36.1 
 
 
732 aa  292  3e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.034944 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0929  glycosyl transferase family protein  40.94 
 
 
796 aa  289  2e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.283533 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1479  methyltransferase type 11  32.9 
 
 
2046 aa  285  3.0000000000000004e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.604446 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0845  glycosyl transferase family protein  35.41 
 
 
725 aa  283  2e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00935412  normal  0.295818 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0804  glycosyl transferase family 2  35.9 
 
 
725 aa  282  3e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.16838 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3223  glycosyl transferase family protein  39.2 
 
 
729 aa  277  9e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1401  glycosyl transferase family protein  37.96 
 
 
808 aa  275  3e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2836  glycosyl transferase family protein  37.21 
 
 
1759 aa  273  2e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0244809 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1792  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.37 
 
 
809 aa  270  2e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0102114 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1526  glycosyl transferase group 1  39.9 
 
 
388 aa  268  2.9999999999999995e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0589  glycosyl transferase family protein  34.08 
 
 
684 aa  266  2e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.271762  normal  0.0559054 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0631  glycosyltransferase-like protein  36.73 
 
 
392 aa  263  2e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00219158 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0564  glycosyl transferase family 2  35.25 
 
 
670 aa  258  5e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.501276 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0729  glycosyl transferase family protein  33.72 
 
 
586 aa  258  6e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.155064  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1842  glycosyl transferase family 2  38.51 
 
 
531 aa  255  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3489  glycosyl transferase family protein  39.9 
 
 
635 aa  253  1e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.0475235 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0563  glycosyl transferase family 2  37.53 
 
 
555 aa  251  5e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.158623 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1495  glycosyltransferase protein  37.67 
 
 
632 aa  251  8e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403758  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4882  glycosyl transferase family protein  38.96 
 
 
526 aa  248  4e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.763618  normal  0.0207356 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6326  glycosyl transferase group 1  35.38 
 
 
787 aa  247  9.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0588  glycosyl transferase family protein  39.13 
 
 
551 aa  246  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231059  normal  0.109318 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0600  glycosyl transferase family 2  34.27 
 
 
684 aa  245  5e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.149205 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1062  glycosyl transferase family protein  36.97 
 
 
783 aa  244  6e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0599  glycosyl transferase family 2  38.7 
 
 
551 aa  242  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.144427 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1841  glycosyl transferase family 2  36.59 
 
 
652 aa  242  4e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.333459  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4883  glycosyl transferase family protein  38.1 
 
 
653 aa  238  6e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.830469  normal  0.0228705 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2613  glycosyl transferase family protein  35.07 
 
 
556 aa  234  7.000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3720  glycosyl transferase family protein  34.99 
 
 
1193 aa  234  1e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3488  glycosyl transferase family protein  36.81 
 
 
539 aa  231  7e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0548  glycosyl transferase family protein  36.26 
 
 
784 aa  229  2e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1508  glycosyl transferase family protein  33.56 
 
 
1198 aa  219  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2719  glycosyl transferase family 2  43.35 
 
 
662 aa  218  4e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0422  glycosyl transferase family protein  32.02 
 
 
1297 aa  213  1e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1555  glycosyl transferase family 2  32.27 
 
 
1188 aa  214  1e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50300  hypothetical protein  30.39 
 
 
1694 aa  213  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0552832  decreased coverage  0.000853187 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1043  glycosyl transferase family 2  31.83 
 
 
1009 aa  211  5e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0124689  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1946  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.8 
 
 
1191 aa  205  4e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.678208  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2886  glycosyl transferase family 2  29.78 
 
 
1213 aa  205  6e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.242978  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3469  glycosyl transferase family protein  31.05 
 
 
1190 aa  204  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.65715  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3348  glycosyl transferase family protein  27.73 
 
 
1074 aa  202  1.9999999999999998e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0861977  normal  0.0615574 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1529  glycosyl transferase family 2  30.35 
 
 
748 aa  202  3e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1517  glycosyl transferase family protein  32.24 
 
 
974 aa  198  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206981  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3468  glycosyl transferase family protein  31.89 
 
 
968 aa  194  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1947  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.19 
 
 
968 aa  192  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2650  glycosyl transferase family protein  31.35 
 
 
1177 aa  189  3e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1918  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.76 
 
 
1173 aa  189  4e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1482  glycosyl transferase family protein  33.49 
 
 
1162 aa  185  6e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.345967  normal  0.675162 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06183  O-antigen biosynthesis protein  31.37 
 
 
1165 aa  182  2.9999999999999997e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00444077  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>