More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3964 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3964  ABC transporter related  100 
 
 		 416 aa  836    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4048  ABC transporter-like  39.39 
 
 		 438 aa  260  3e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.192199  normal  0.366163 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0717  ABC transporter related  40.35 
 
 		 464 aa  255  9e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0319  ABC transporter related  39.29 
 
 		 455 aa  255  1.0000000000000001e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.746089  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0767  ABC transporter related  41.1 
 
 		 406 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.281524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0918  ABC transporter  40.23 
 
 		 405 aa  250  3e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.441705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3643  ABC transporter related  39.47 
 
 		 443 aa  250  3e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000162695  decreased coverage  0.0000834131 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3976  ABC polysaccharide/polyol phosphate export pump, ATPase subunit  39.78 
 
 		 435 aa  249  8e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71940  ABC subunit of A-band LPS efflux transporter  40.77 
 
 		 421 aa  246  4e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6240  ABC subunit of A-band LPS efflux transporter  40.48 
 
 		 421 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1474  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  39.74 
 
 		 469 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.509315  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4089  ABC transporter related  41.44 
 
 		 870 aa  244  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.591422  normal  0.870036 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2313  ABC transporter related  38.19 
 
 		 450 aa  243  3e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0239499 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3136  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  39.74 
 
 		 465 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.28076  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3159  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  39.74 
 
 		 469 aa  243  5e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3099  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  39.74 
 
 		 465 aa  243  5e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.56935  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1985  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  39.23 
 
 		 465 aa  242  9e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0805636  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1847  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  39.23 
 
 		 465 aa  242  9e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0556444  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2758  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  39.23 
 
 		 465 aa  242  9e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00103163  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1779  lipopolysaccharide ABC export system, ATP-binding protein  39.26 
 
 		 405 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0028065 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0928  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  39.23 
 
 		 471 aa  242  1e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3460  ABC transporter ATP-binding protein  37.25 
 
 		 440 aa  240  4e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.100585  normal  0.102308 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0564  ABC transporter related  39.12 
 
 		 406 aa  239  5e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1244  ATPase  42.57 
 
 		 432 aa  239  5e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000485389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0545  ABC transporter related  42.32 
 
 		 816 aa  239  8e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.4863 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0886  ABC transporter related  33.92 
 
 		 493 aa  238  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3813  ABC transporter related  34.97 
 
 		 711 aa  237  2e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.396147  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4318  ABC transporter related  43.73 
 
 		 456 aa  237  3e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.976448 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03166  ABC transporter, ATP binding protein  39.25 
 
 		 437 aa  236  6e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0651  ABC polysaccharide efflux pump, ATPase subunit  40.37 
 
 		 472 aa  236  7e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.601465  normal  0.274396 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1075  O-antigen ABC transporter, ATP-binding protein, putative  37.06 
 
 		 454 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.164394  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4003  ABC transporter related  36.55 
 
 		 457 aa  229  7e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.584674  normal  0.718876 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0028  ABC transporter related  37.03 
 
 		 472 aa  227  2e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1228  ABC transporter, ATPase subunit  44.33 
 
 		 416 aa  226  5.0000000000000005e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2398  ABC transporter related  37.25 
 
 		 488 aa  225  1e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.113996  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1731  ABC transporter-related protein  35.19 
 
 		 410 aa  224  2e-57  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3694  ABC transporter related  42.9 
 
 		 429 aa  224  2e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5685  ABC transporter-like  37.9 
 
 		 416 aa  224  3e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0795174  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3925  ABC transporter related  50.22 
 
 		 449 aa  223  7e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.466767 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3032  ABC transporter related  36.64 
 
 		 478 aa  222  8e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1387  ABC transporter related  39.77 
 
 		 402 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.928113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2200  ABC transporter related  49.3 
 
 		 498 aa  218  1e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.206971  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3798  ABC O-antigen/lipopolysaccharide exporter, ATPase subunit  37 
 
 		 448 aa  219  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3117  ABC transporter related  37.13 
 
 		 436 aa  218  2e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4136  ABC transporter related  48.86 
 
 		 468 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000582944 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3133  ABC transporter related  37.39 
 
 		 423 aa  212  1e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15970  ABC transporter, ATP binding component  37.87 
 
 		 447 aa  212  1e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0451  ABC transporter related  47.57 
 
 		 422 aa  211  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2515  ABC transporter related  47.44 
 
 		 424 aa  210  3e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.780644 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4204  ABC transporter related  36.97 
 
 		 424 aa  210  4e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.257703 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0264  ABC transporter, ATP-binding protein  48.33 
 
 		 390 aa  210  5e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0255  teichoic acid translocation ATP-binding protein  48.33 
 
 		 390 aa  209  6e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0267  ABC transporter, ATP-binding protein  47.06 
 
 		 393 aa  209  8e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0258  teichoic acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.06 
 
 		 393 aa  209  8e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.591721  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0494  ABC transporter  35.14 
 
 		 394 aa  209  9e-53  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.491328  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2757  ABC transporter related  41.24 
 
 		 408 aa  207  2e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3088  ABC transporter related  36.48 
 
 		 428 aa  206  6e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.204093  normal  0.388179 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0407  ABC transporter related  47.78 
 
 		 439 aa  206  9e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.565594 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1675  ABC transporter related  48.76 
 
 		 420 aa  204  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2409  ABC transporter related protein  41.71 
 
 		 415 aa  204  2e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0371  putative ABC-2 type transport system ATP-binding protein  32.69 
 
 		 410 aa  204  2e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1102  ABC transporter related  35.8 
 
 		 431 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1760  ABC transporter related  39.58 
 
 		 415 aa  204  3e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.959569 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0858  ABC transporter related  45.14 
 
 		 407 aa  203  4e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.166623  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0053  ABC transporter related  46.04 
 
 		 244 aa  202  8e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2759  ABC transporter related  36.51 
 
 		 428 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.237153  hitchhiker  0.00117132 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2895  ATPase  46.19 
 
 		 369 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0848  polysaccharide ABC transporter, ATPase component  43.44 
 
 		 418 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.105464  normal  0.234564 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1587  ABC transporter related  38.41 
 
 		 427 aa  201  3e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1362  ABC transporter related  44.55 
 
 		 472 aa  200  3.9999999999999996e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0452028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0816  ABC transporter related  44.19 
 
 		 254 aa  200  5e-50  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.067607  normal  0.131733 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4904  ABC transporter-like protein protein  43.53 
 
 		 418 aa  200  5e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2770  ABC transporter related  39.58 
 
 		 418 aa  199  6e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.906203 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1505  ABC transporter, ATP-binding protein  45.37 
 
 		 422 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.334414  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1725  ABC transporter related  45.97 
 
 		 420 aa  197  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.047923 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3355  ABC transporter related  47.26 
 
 		 429 aa  197  3e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4620  ABC transporter related  45.05 
 
 		 411 aa  197  3e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.065306 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2170  putative ABC transporter  31.96 
 
 		 431 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0209  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  43.81 
 
 		 397 aa  197  4.0000000000000005e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0939  ABC transporter related  45.41 
 
 		 254 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00388911 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0325  ABC transporter related  47.47 
 
 		 422 aa  196  5.000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.123997  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0276  ABC transporter related  37.5 
 
 		 392 aa  196  8.000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0594  ABC transporter related  50.51 
 
 		 260 aa  195  1e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4940  ABC transporter related  45.77 
 
 		 429 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.18828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3354  ABC transporter related  49 
 
 		 411 aa  194  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2571  ABC transporter related protein  43.52 
 
 		 419 aa  194  3e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00120547  normal  0.533864 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0851  ATPase  47.21 
 
 		 433 aa  193  4e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0650  ABC transporter related  34.55 
 
 		 409 aa  193  4e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2702  ABC transporter related  47.03 
 
 		 427 aa  193  5e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0066609 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2772  ABC transporter related  41.33 
 
 		 419 aa  193  6e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.357847  normal  0.420365 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1747  ABC transporter related  47.29 
 
 		 400 aa  191  1e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2421  ABC transporter related  47.47 
 
 		 241 aa  192  1e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.115818 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2267  O-antigen export system ATP-binding protein RfbB  40.98 
 
 		 246 aa  192  1e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2026  ABC transporter related  42.29 
 
 		 420 aa  192  1e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.476742  hitchhiker  0.0046378 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2107  ABC transporter related  46.53 
 
 		 437 aa  191  1e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2181  ABC transporter, ATPase subunit  46.83 
 
 		 396 aa  191  2e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.623057  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4590  ABC transporter related  32.69 
 
 		 416 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.10294  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1033  ABC transporter related  45.09 
 
 		 427 aa  191  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0625  carbohydrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  46.5 
 
 		 417 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2802  ABC transporter related protein  41.37 
 
 		 439 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>