22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3947 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_3947  methyltransferase type 11  100 
 
 
204 aa  419  1e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.285036  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1031  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
224 aa  61.6  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2737  hypothetical protein  31.03 
 
 
305 aa  59.3  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.447788  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2401  methyltransferase type 11  33.79 
 
 
208 aa  58.9  0.00000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0632  hypothetical protein  32.03 
 
 
267 aa  55.1  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2194  TPR repeat-containing protein  34.75 
 
 
1451 aa  53.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.496906  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2058  TPR repeat-containing protein  34.75 
 
 
1454 aa  53.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1981  methyltransferase type 11  31.86 
 
 
269 aa  48.1  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3663  hypothetical protein  31.48 
 
 
262 aa  47.4  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0028  glycosyl transferase group 1  43.28 
 
 
710 aa  45.8  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0780  glycosyl transferase, group 1  37.5 
 
 
711 aa  45.8  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3974  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
284 aa  45.4  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0052  hypothetical protein  31.17 
 
 
172 aa  45.1  0.0008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000148856  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  44.9 
 
 
236 aa  44.7  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  39.44 
 
 
237 aa  43.9  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8173  Methyltransferase type 11  29.36 
 
 
254 aa  43.5  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.781909  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2218  Methyltransferase type 11  30.39 
 
 
254 aa  43.9  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0929  hypothetical protein  31.58 
 
 
172 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1121  methyltransferase type 11  40.98 
 
 
293 aa  42.4  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536452  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1919  hypothetical protein  41.86 
 
 
241 aa  42  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.596935  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  44.23 
 
 
255 aa  41.2  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0636  Methyltransferase type 11  29.91 
 
 
228 aa  41.2  0.01  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0381586  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>