More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3939 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3939  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 		 367 aa  720    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.407918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1908  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.97 
 
 		 407 aa  104  3e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2011  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.45 
 
 		 361 aa  95.9  9e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0454  secretion protein HlyD  26.73 
 
 		 373 aa  94  3e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.63564  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2100  RND family efflux transporter MFP subunit  27.88 
 
 		 379 aa  94.4  3e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0493506  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1621  secretion protein HlyD  25.83 
 
 		 407 aa  92.8  9e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0986  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.04 
 
 		 405 aa  92  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.831389 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1695  secretion protein HlyD  30.41 
 
 		 360 aa  91.7  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4563  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.65 
 
 		 426 aa  91.3  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0558  secretion protein HlyD  26.98 
 
 		 360 aa  90.1  5e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.177986  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0431  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.27 
 
 		 368 aa  90.1  6e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2872  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.39 
 
 		 387 aa  89.7  8e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1385  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.1 
 
 		 380 aa  89  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0605754  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4285  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.47 
 
 		 458 aa  88.6  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3265  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.52 
 
 		 404 aa  88.2  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1985  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.11 
 
 		 429 aa  87.4  4e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0913  hypothetical protein  23.58 
 
 		 338 aa  87  5e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0467  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.9 
 
 		 360 aa  87  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0321  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.75 
 
 		 386 aa  86.7  5e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4307  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.21 
 
 		 458 aa  87  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0882  hypothetical protein  23.85 
 
 		 338 aa  86.3  8e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0747  secretion protein HlyD  24.42 
 
 		 357 aa  86.3  8e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.554021  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4226  RND family efflux transporter MFP subunit  27.41 
 
 		 426 aa  85.1  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.499264  normal  0.926991 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4041  hypothetical protein  30.2 
 
 		 366 aa  84.7  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0513022 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2074  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.78 
 
 		 353 aa  84.3  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.104068  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2533  RND family efflux transporter MFP subunit  30.81 
 
 		 343 aa  84.3  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.66716  normal  0.672833 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24 
 
 		 377 aa  84  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1161  RND family efflux transporter MFP subunit  26.52 
 
 		 404 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0203325  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4150  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.83 
 
 		 397 aa  82.8  0.000000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00923789  hitchhiker  0.000000297953 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15871  membrane fusion protein  24.26 
 
 		 357 aa  82  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0764  RND family efflux transporter MFP subunit  26.49 
 
 		 385 aa  82  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4154  secretion protein HlyD  23.21 
 
 		 458 aa  81.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2973  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.62 
 
 		 448 aa  80.9  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0308  secretion protein HlyD  24.31 
 
 		 421 aa  80.5  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.742688 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0487  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.65 
 
 		 360 aa  80.5  0.00000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0200  secretion protein HlyD  27.08 
 
 		 365 aa  80.1  0.00000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0480  RND family efflux transporter MFP subunit  29.32 
 
 		 363 aa  79.3  0.00000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1999  RND family efflux transporter MFP subunit  25.33 
 
 		 390 aa  78.6  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00132105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2046  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.51 
 
 		 442 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1916  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.55 
 
 		 388 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.631291  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1182  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.27 
 
 		 421 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.272919 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2949  RND family efflux transporter MFP subunit  23.41 
 
 		 376 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0703  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.02 
 
 		 355 aa  78.2  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1045  RND family efflux transporter MFP subunit  25 
 
 		 397 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2316  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.22 
 
 		 379 aa  77  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.144925 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3628  secretion protein HlyD  25.96 
 
 		 361 aa  76.6  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0539  RND family efflux transporter MFP subunit  23.03 
 
 		 350 aa  76.6  0.0000000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0739  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.08 
 
 		 362 aa  76.3  0.0000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.941037  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0671  secretion protein HlyD  24.79 
 
 		 432 aa  76.3  0.0000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2663  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.4 
 
 		 352 aa  76.3  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6340  secretion protein HlyD  24.19 
 
 		 369 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.900675  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1739  RND family efflux transporter MFP subunit  24.19 
 
 		 369 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.357806  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2543  secretion protein HlyD  26.85 
 
 		 471 aa  75.9  0.0000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5559  secretion protein HlyD  26.54 
 
 		 366 aa  75.5  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1209  RND family efflux transporter MFP subunit  25.9 
 
 		 381 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.421019  normal  0.31825 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2559  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.29 
 
 		 349 aa  75.5  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.99545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3561  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.53 
 
 		 420 aa  75.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.306068  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4180  RND family efflux transporter MFP subunit  27.16 
 
 		 366 aa  75.1  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.249201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6521  RND family efflux transporter MFP subunit  26.04 
 
 		 410 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.745567  normal  0.0817001 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2408  secretion protein HlyD  25.55 
 
 		 404 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000198894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0157  hypothetical protein  23.75 
 
 		 366 aa  74.3  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1752  RND family efflux transporter MFP subunit  24.1 
 
 		 369 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3467  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.62 
 
 		 376 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00013135  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1713  multidrug resistance efflux pump-like protein  26.54 
 
 		 392 aa  74.3  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.254154  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1983  RND family efflux transporter MFP subunit  24.03 
 
 		 416 aa  73.9  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3686  RND family efflux transporter MFP subunit  24.93 
 
 		 440 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.98045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3834  RND family efflux transporter MFP subunit  25.54 
 
 		 383 aa  73.9  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3851  RND family efflux transporter MFP subunit  25.54 
 
 		 383 aa  73.9  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1919  RND family efflux transporter MFP subunit  25.54 
 
 		 383 aa  73.9  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1921  RND family efflux transporter MFP subunit  26.25 
 
 		 340 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00271277  normal  0.413551 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1636  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.02 
 
 		 383 aa  73.6  0.000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.372421  normal  0.934491 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2977  RND family efflux transporter MFP subunit  32.62 
 
 		 401 aa  73.6  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.540318  normal  0.494242 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1403  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.95 
 
 		 417 aa  73.6  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.424837  normal  0.123182 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0816  RND family efflux transporter MFP subunit  27.74 
 
 		 385 aa  73.6  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0883  RND family efflux transporter MFP subunit  30.66 
 
 		 363 aa  73.6  0.000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1241  RND family efflux transporter MFP subunit  26.95 
 
 		 417 aa  73.6  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.975545 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2586  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.06 
 
 		 388 aa  73.2  0.000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000121955  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1079  secretion protein HlyD  25.92 
 
 		 366 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.984606 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0753  secretion protein HlyD  24.78 
 
 		 370 aa  73.2  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2020  secretion protein HlyD family protein  24.28 
 
 		 357 aa  73.2  0.000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.519564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0901  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.5 
 
 		 351 aa  72.8  0.000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.470272  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2367  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.92 
 
 		 360 aa  72.8  0.000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2000  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.92 
 
 		 360 aa  72.8  0.000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.461729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4295  RND family efflux transporter MFP subunit  22.86 
 
 		 466 aa  72.8  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.073476  normal  0.845427 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4005  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.14 
 
 		 387 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0949  RND family efflux transporter MFP subunit  24.93 
 
 		 390 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1281  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.4 
 
 		 357 aa  71.6  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.036609  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1673  secretion protein HlyD  26.56 
 
 		 396 aa  72  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.801945 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3548  RND family efflux transporter MFP subunit  24.46 
 
 		 442 aa  71.6  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.489121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0635  macrolide-specific efflux protein macA  23.8 
 
 		 390 aa  71.2  0.00000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0167041  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5035  HlyD family secretion protein  24.8 
 
 		 396 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.611497 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2552  secretion protein HlyD  25.07 
 
 		 451 aa  70.9  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.603084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1502  secretion protein HlyD  24.07 
 
 		 478 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.184777  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6991  RND family efflux transporter MFP subunit  24.07 
 
 		 472 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.231557 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16800  putative efflux transmembrane protein  25.45 
 
 		 367 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0868415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6327  RND family efflux transporter MFP subunit  24.07 
 
 		 478 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0452278  normal  0.980568 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0709  macrolide-specific efflux protein macA  23.19 
 
 		 390 aa  70.5  0.00000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0247  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.53 
 
 		 380 aa  70.9  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0916  efflux transporter  26.67 
 
 		 396 aa  70.9  0.00000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.987196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1462  RND efflux membrane fusion protein precursor  25.15 
 
 		 367 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>