More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3894 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3894  hypothetical protein  100 
 
 		 274 aa  551  1e-156  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.077508  normal  0.524503 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1626  hypothetical protein  59.62 
 
 		 287 aa  290  2e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298645  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1510  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase, putative  57.84 
 
 		 276 aa  288  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.685837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4212  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  57.46 
 
 		 276 aa  287  1e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.558651 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1115  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  58.58 
 
 		 276 aa  284  9e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2802  hypothetical protein  55.88 
 
 		 278 aa  278  6e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.317432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4107  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  56.34 
 
 		 276 aa  278  8e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2258  hypothetical protein  56.67 
 
 		 276 aa  276  2e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.686135  normal  0.889784 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8089  PEP phosphonomutase  56.93 
 
 		 274 aa  275  7e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3650  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase, putative  56.15 
 
 		 286 aa  266  4e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.822886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2774  hypothetical protein  59.77 
 
 		 276 aa  265  5e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.167495 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1325  hypothetical protein  51.29 
 
 		 275 aa  262  4.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1074  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase, putative  51.85 
 
 		 278 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1448  hypothetical protein  53.14 
 
 		 279 aa  257  1e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5224  hypothetical protein  55.26 
 
 		 278 aa  255  5e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0320197  normal  0.104885 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3694  PEP phosphonomutase  54.55 
 
 		 286 aa  248  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329743  normal  0.378835 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1389  hypothetical protein  51.66 
 
 		 275 aa  245  4.9999999999999997e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000372272  normal  0.274021 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4820  PEP phosphonomutase  54.3 
 
 		 275 aa  243  3e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3087  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  54.47 
 
 		 278 aa  243  3e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0439719  normal  0.397563 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4063  hypothetical protein  53.64 
 
 		 267 aa  239  2e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.196405  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5368  PEP phosphonomutase  52.4 
 
 		 286 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0658873  normal  0.17569 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4919  PEP phosphonomutase  52.4 
 
 		 286 aa  239  4e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0062527  normal  0.246577 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3448  PEP phosphonomutase  52.4 
 
 		 286 aa  239  4e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.36236  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16740  hypothetical protein  56.69 
 
 		 274 aa  238  5e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1456  hypothetical protein  56.3 
 
 		 274 aa  238  9e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1372  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  49.28 
 
 		 278 aa  238  1e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.831005  normal  0.137367 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0773  PEP phosphonomutase  53.56 
 
 		 286 aa  227  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314114  normal  0.0162406 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4869  PEP phosphonomutase  53.68 
 
 		 286 aa  224  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21038  hitchhiker  0.00000793453 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4353  PEP phosphonomutase  54.04 
 
 		 286 aa  219  3e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000493526 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3098  PEP phosphonomutase  45.9 
 
 		 288 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2180  hypothetical protein  48.25 
 
 		 271 aa  211  2e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0150751  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4153  hypothetical protein  47.43 
 
 		 274 aa  209  6e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.847864 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2201  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase, putative  47.81 
 
 		 281 aa  205  7e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00814551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6009  hypothetical protein  45.85 
 
 		 280 aa  202  5e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00237397 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0568  hypothetical protein  46.64 
 
 		 274 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0122  hypothetical protein  47.62 
 
 		 276 aa  199  3.9999999999999996e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.647866  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1600  hypothetical protein  48.96 
 
 		 276 aa  197  2.0000000000000003e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.768763  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4222  hypothetical protein  43.8 
 
 		 275 aa  195  6e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.333624  normal  0.192087 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1612  PEP phosphonomutase  47.62 
 
 		 279 aa  194  9e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3722  hypothetical protein  43.87 
 
 		 273 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4352  hypothetical protein  43.98 
 
 		 272 aa  188  7e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.174132  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5017  putative methylisocitrate lyase or carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  41.63 
 
 		 271 aa  187  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.467428 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1688  PEP phosphonomutase  47.25 
 
 		 279 aa  186  5e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.251205  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2263  PEP phosphonomutase  49.22 
 
 		 279 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.978238  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7278  hypothetical protein  44.96 
 
 		 280 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00843163  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1745  hypothetical protein  42.01 
 
 		 276 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1920  carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase-like protein  39.71 
 
 		 271 aa  163  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181834 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5270  hypothetical protein  31.42 
 
 		 274 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2446  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  32.86 
 
 		 284 aa  156  3e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.111219  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3525  carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase  31.42 
 
 		 274 aa  155  7e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3644  hypothetical protein  41.06 
 
 		 276 aa  152  5.9999999999999996e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.354902 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0706  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  38.43 
 
 		 278 aa  138  7.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.642539  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3620  hypothetical protein  38.32 
 
 		 276 aa  137  1e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1856  hypothetical protein  41.7 
 
 		 259 aa  135  7.000000000000001e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000480494 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0856  hypothetical protein  41.3 
 
 		 264 aa  130  3e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2296  hypothetical protein  37.64 
 
 		 268 aa  130  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0067  putative PEP phosphonomutase protein  38.1 
 
 		 256 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.103814  normal  0.0160234 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3070  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  29.26 
 
 		 289 aa  125  7e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1593  putative carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  37.41 
 
 		 260 aa  125  7e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.131647  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0084  putative carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase protein  37.3 
 
 		 256 aa  123  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5113  PEP phosphonomutase  38.22 
 
 		 253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0870889 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0552  PEP phosphonomutase and related enzyme-like protein  40.64 
 
 		 254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.668619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4372  hypothetical protein  27.61 
 
 		 266 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.11441e-22 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0074  hypothetical protein  35.83 
 
 		 258 aa  112  6e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.290223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3097  putative carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase protein  34.63 
 
 		 274 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000706406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5295  PEP phosphonomutase  40.23 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0426519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0044  hypothetical protein  35.2 
 
 		 253 aa  109  6e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.669504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0163  putative carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase protein  33.33 
 
 		 253 aa  108  8.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.643607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2982  PEP phosphonomutase  37.17 
 
 		 258 aa  108  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4021  putative carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  35.66 
 
 		 294 aa  108  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3473  PEP phosphonomutase  39.84 
 
 		 255 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0613154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0900  PEP phosphonomutase  36.4 
 
 		 259 aa  104  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3408  hypothetical protein  34.65 
 
 		 277 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0235  hypothetical protein  30.74 
 
 		 258 aa  103  4e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0879  hypothetical protein  33.62 
 
 		 282 aa  102  8e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1604  hypothetical protein  33.46 
 
 		 289 aa  102  9e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3606  hypothetical protein  34.21 
 
 		 282 aa  101  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.647928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3483  hypothetical protein  34.06 
 
 		 282 aa  101  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3426  hypothetical protein  34.51 
 
 		 269 aa  100  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12030  methylisocitrate lyase  34.25 
 
 		 312 aa  99.8  5e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.55917  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1053  hypothetical protein  32.64 
 
 		 282 aa  99  8e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0256  hypothetical protein  35 
 
 		 252 aa  99  8e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.799893  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0266  hypothetical protein  35 
 
 		 252 aa  99  8e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.235193 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0246  hypothetical protein  35 
 
 		 252 aa  99  8e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1029  2,3-dimethylmalate lyase  30.34 
 
 		 287 aa  98.2  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114621  normal  0.155549 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06151  carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase-like protein (AFU_orthologue; AFUA_5G07230)  31.29 
 
 		 274 aa  97.4  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0384157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0108  methylisocitrate lyase  32.49 
 
 		 302 aa  97.4  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0279515  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4757  2,3-dimethylmalate lyase  31.52 
 
 		 287 aa  96.7  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000491467  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0568  methylisocitrate lyase  32.57 
 
 		 298 aa  94  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0410  hypothetical protein  36.86 
 
 		 258 aa  94.4  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2560  PEP phosphonomutase  39.22 
 
 		 253 aa  94.4  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14150  methylisocitrate lyase  30.96 
 
 		 312 aa  93.6  3e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3853  hypothetical protein  30.5 
 
 		 266 aa  93.6  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3283  carboxyvinyl-carboxyphosphonatephosphorylmutase  33.33 
 
 		 255 aa  93.2  4e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5509  carboxyvinyl-carboxyphosphonatephosphorylmutase  36.48 
 
 		 273 aa  93.2  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164807  normal  0.256202 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0661  2,3-dimethylmalate lyase  32.65 
 
 		 310 aa  92.4  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.428755 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6199  PEP phosphonomutase-like protein  34.75 
 
 		 425 aa  92.4  8e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.3328  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4524  hypothetical protein  32.59 
 
 		 269 aa  92  8e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.725558  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1702  methylisocitrate lyase  29.3 
 
 		 304 aa  90.9  2e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0394396 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2645  PEP phosphonomutase  35.42 
 
 		 295 aa  90.1  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.327181 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>