More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3871 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3871  polysaccharide export protein  100 
 
 		 214 aa  422  1e-117  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.631942  normal  0.0416181 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3242  polysaccharide export protein  38.37 
 
 		 212 aa  132  3e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.76534 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6499  polysaccharide export protein  33.16 
 
 		 205 aa  107  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1596  polysaccharide export protein  34.5 
 
 		 206 aa  102  6e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.10693 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0148  capsular polysaccharide export protein, putative  32.65 
 
 		 277 aa  101  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.181094  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2182  polysaccharide export protein  33.71 
 
 		 298 aa  89.4  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2738  polysaccharide export protein  32.02 
 
 		 192 aa  89  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2833  polysaccharide export protein  32.02 
 
 		 192 aa  89  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.173775  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01391  exopolysaccharide xanthan biosynthesis export protein GumB  29.49 
 
 		 232 aa  88.2  9e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.300976  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2650  polysaccharide export protein  31.53 
 
 		 192 aa  86.3  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.28267  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1695  polysaccharide export protein  29.27 
 
 		 356 aa  85.5  5e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.24357  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3013  polysaccharide export protein  31.33 
 
 		 270 aa  84.7  8e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1658  polysaccharide export protein  31.52 
 
 		 277 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00056738  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2881  polysaccharide export protein  26.89 
 
 		 229 aa  84  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1525  polysaccharide export protein  27.75 
 
 		 243 aa  82.8  0.000000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0242  polysaccharide export protein  30.72 
 
 		 264 aa  82.8  0.000000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2026  polysaccharide export protein  32.5 
 
 		 270 aa  81.6  0.000000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02478  polysaccharide export periplasmic protein  33.92 
 
 		 153 aa  81.3  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2618  polysaccharide export protein  30.54 
 
 		 193 aa  80.1  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.676482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0160  polysaccharide export protein  29.58 
 
 		 208 aa  80.1  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1795  polysaccharide export outer membrane protein  29.55 
 
 		 264 aa  79.7  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1903  polysaccharide export protein  33.92 
 
 		 221 aa  79.7  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3319  polysaccharide export protein  32.94 
 
 		 351 aa  79.3  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.211792 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1538  GumB protein  34.34 
 
 		 249 aa  79  0.00000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1170  polysaccharide export protein  26.98 
 
 		 211 aa  79  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1877  polysaccharide export protein  32.74 
 
 		 281 aa  78.6  0.00000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2392  polysaccharide export protein  29.67 
 
 		 210 aa  78.2  0.00000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1538  periplasmic polysaccharide export protein  31.55 
 
 		 268 aa  77.8  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1482  polysaccharide export protein  33.73 
 
 		 270 aa  77.8  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.242862  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2586  polysaccharide export protein  31.74 
 
 		 184 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.693737  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4309  polysaccharide export protein  31.32 
 
 		 495 aa  77.4  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1156  polysaccharide export protein  32.09 
 
 		 187 aa  77.8  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.508119  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1985  polysaccharide export protein  27.94 
 
 		 208 aa  77  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560938  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0734  polysaccharide export protein  32.16 
 
 		 192 aa  77.4  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0580696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3803  polysaccharide export protein  29.79 
 
 		 344 aa  76.6  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2495  polysaccharide export protein  30.43 
 
 		 212 aa  76.6  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3716  polysaccharide export protein  32.75 
 
 		 241 aa  76.3  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3311  polysaccharide export protein  33.08 
 
 		 324 aa  76.3  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.328062 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5213  polysaccharide export protein  34.13 
 
 		 190 aa  74.7  0.0000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.118373  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2957  polysaccharide export protein  34.73 
 
 		 190 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.836808  normal  0.0520803 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0281  polysaccharide export outer membrane protein  28.17 
 
 		 207 aa  74.7  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.585377  normal  0.906054 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2367  polysaccharide export protein EpsE  32.07 
 
 		 262 aa  73.9  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3192  polysaccharide export protein  26.44 
 
 		 227 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0460  hypothetical protein  33.06 
 
 		 175 aa  73.2  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02599  polysaccharide biosynthesis/export protein  30.65 
 
 		 183 aa  72.8  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.357236  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4601  polysaccharide export protein  30.95 
 
 		 473 aa  73.2  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.930879 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1535  polysaccharide export protein  29.07 
 
 		 495 aa  72.8  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.106975 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1536  polysaccharide export protein  28.16 
 
 		 207 aa  72.4  0.000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.595422  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1508  polysaccharide export protein  29.07 
 
 		 495 aa  72.4  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3509  polysaccharide export protein  28.29 
 
 		 213 aa  72.4  0.000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000101119 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1414  polysaccharide export protein  36.8 
 
 		 234 aa  72  0.000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.639365 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4816  polysaccharide export protein  35.34 
 
 		 253 aa  71.6  0.000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.769943 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1487  polysaccharide export protein  30.81 
 
 		 193 aa  71.2  0.000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0270462  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1660  polysaccharide export protein  27.06 
 
 		 214 aa  71.2  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.614311  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4708  polysaccharide export protein  32.54 
 
 		 219 aa  71.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.655126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1072  polysaccharide export protein  28.57 
 
 		 178 aa  71.2  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.875269  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1728  putative capsular polysaccharide transport outermembrane protein  29.84 
 
 		 352 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0503982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2696  polysaccharide export protein  34.91 
 
 		 196 aa  70.1  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.975578 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4037  polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 235 aa  70.9  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0979  polysaccharide export protein  26.48 
 
 		 234 aa  70.1  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5320  polysaccharide export protein  34.32 
 
 		 213 aa  70.1  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.884665  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3319  polysaccharide export protein  35.21 
 
 		 383 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00116836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4169  polysaccharide export protein  35.21 
 
 		 423 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.95415  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4197  polysaccharide export protein  35.21 
 
 		 423 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.937901 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1665  polysaccharide export protein  32 
 
 		 189 aa  69.3  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1691  polysaccharide export protein  30.81 
 
 		 244 aa  69.3  0.00000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000171908  normal  0.0125517 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4819  polysaccharide export protein  28.07 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4241  polysaccharide export protein  30.05 
 
 		 417 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.238114 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1312  polysaccharide export protein  30.92 
 
 		 191 aa  68.9  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0132  putative polysaccharide export protein, outer membrane  26.92 
 
 		 206 aa  68.6  0.00000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.679141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1118  polysaccharide export protein  33.8 
 
 		 426 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6483  polysaccharide export protein  35.21 
 
 		 426 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.45057 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4418  polysaccharide export protein  33.68 
 
 		 220 aa  68.6  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3621  polysaccharide export protein  33.1 
 
 		 408 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.816168 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1224  polysaccharide export protein  29.47 
 
 		 191 aa  68.6  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2464  polysaccharide export protein  32.75 
 
 		 235 aa  68.6  0.00000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.719315  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4096  polysaccharide export protein  33.1 
 
 		 407 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.512388  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1175  polysaccharide biosynthesis/export protein  33.59 
 
 		 152 aa  67.8  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.265571  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2894  polysaccharide export protein  29.83 
 
 		 377 aa  68.2  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0993342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1069  polysaccharide export protein  25.48 
 
 		 227 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0428  polysaccharide export protein  27.01 
 
 		 202 aa  67.8  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0542078 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1959  polysaccharide export protein  29.82 
 
 		 286 aa  68.2  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.698797  normal  0.015315 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5025  polysaccharide biosynthesis/export protein  25.12 
 
 		 211 aa  67  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1463  putative polysaccharide export protein  30.34 
 
 		 352 aa  67.4  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.24713e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0819  polysaccharide export protein  29.12 
 
 		 379 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7871  hypothetical protein  32.39 
 
 		 238 aa  67  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1524  polysaccharide export protein  33.73 
 
 		 196 aa  67  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5038  polysaccharide export protein  33.53 
 
 		 358 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3287  polysaccharide export protein  27.84 
 
 		 492 aa  66.6  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1588  polysaccharide export protein  29.38 
 
 		 257 aa  66.6  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.101952  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3126  polysaccharide export protein  27.93 
 
 		 185 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0660  polysaccharide export protein  26.63 
 
 		 823 aa  65.5  0.0000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2734  capsular polysaccharide export protein, putative  28.16 
 
 		 276 aa  65.9  0.0000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0365414 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4531  polysaccharide export protein  30.69 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0783  capsule polysaccharide export protein, putative  28.91 
 
 		 195 aa  65.5  0.0000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0810  polysaccharide export protein  27.45 
 
 		 184 aa  65.1  0.0000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0776  putative capsule polysaccharide export protein  28.91 
 
 		 196 aa  65.5  0.0000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0834  polysaccharide export protein  26.32 
 
 		 309 aa  65.1  0.0000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5370  polysaccharide export protein  29.63 
 
 		 391 aa  64.7  0.0000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2482  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  25.73 
 
 		 391 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.153813  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>