More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3839 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_3839  histidine kinase  100 
 
 
590 aa  1169    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.783031 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2694  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.52 
 
 
1118 aa  363  5.0000000000000005e-99  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2216  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.21 
 
 
812 aa  361  2e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.368148  normal  0.0314025 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.81 
 
 
1326 aa  351  2e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1117  ATPase domain-containing protein  41.89 
 
 
847 aa  346  6e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.511479  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1204  sensory box histidine kinase/response regulator  41.21 
 
 
1177 aa  346  8.999999999999999e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1271  hybrid signal transduction histidine kinase and diguanylate cyclase/phosphodiesterase  37.38 
 
 
1499 aa  345  1e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.422796  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.09 
 
 
916 aa  340  2.9999999999999998e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.22 
 
 
1202 aa  340  2.9999999999999998e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.58 
 
 
1442 aa  339  7e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1096  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.06 
 
 
1548 aa  339  9e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.363033 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0240  Hpt sensor hybrid histidine kinase  39.66 
 
 
1005 aa  337  5e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1392  PAS sensor protein  42.67 
 
 
977 aa  336  7e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.802774  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0617  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.69 
 
 
1398 aa  334  2e-90  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.536457  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.25 
 
 
1267 aa  335  2e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  39.23 
 
 
929 aa  334  2e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.18 
 
 
1284 aa  333  4e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.92301  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.18 
 
 
1363 aa  332  8e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1949  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.14 
 
 
1397 aa  331  2e-89  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.539898  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1850  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.57 
 
 
946 aa  332  2e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0866059  normal  0.191772 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4165  sensory box histidine kinase/response regulator  34.63 
 
 
1683 aa  330  5.0000000000000004e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.418603  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4311  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.04 
 
 
1090 aa  330  6e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1268  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.58 
 
 
1069 aa  329  8e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1056  two component hybrid sensor histidine kinase  38.07 
 
 
1014 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  38.84 
 
 
1135 aa  326  6e-88  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0960  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.39 
 
 
1245 aa  326  6e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.29 
 
 
1369 aa  326  9e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0092  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.94 
 
 
1313 aa  325  1e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.783031 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  37.88 
 
 
1331 aa  325  1e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2063  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.82 
 
 
1622 aa  325  1e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.578386 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.45 
 
 
1768 aa  325  2e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2106  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.34 
 
 
993 aa  324  3e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.295041 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.07 
 
 
1550 aa  323  4e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.33 
 
 
1611 aa  324  4e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0903  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.36 
 
 
977 aa  323  5e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.393558  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1908  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.98 
 
 
991 aa  322  8e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1670  ATPase domain-containing protein  42.02 
 
 
750 aa  322  9.000000000000001e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.081803  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2575  sensor histidine kinase/response regulator  42.03 
 
 
850 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1616  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.7 
 
 
1240 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98218  normal  0.696471 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.27 
 
 
833 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4029  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.66 
 
 
835 aa  321  1.9999999999999998e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.15703 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1977  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.2 
 
 
1072 aa  320  3.9999999999999996e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732577  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0258  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 
1040 aa  320  5e-86  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.119641 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1596  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.33 
 
 
705 aa  320  7e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1505  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.66 
 
 
818 aa  319  1e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0357  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.79 
 
 
1310 aa  318  2e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.464939  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1212  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.55 
 
 
919 aa  318  2e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.979568  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  37.9 
 
 
923 aa  318  2e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0621  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.48 
 
 
1309 aa  318  2e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.288255 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.67 
 
 
1765 aa  317  4e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1029  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.02 
 
 
1820 aa  317  4e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.165868 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37090  alginate regulatory hybrid histidine protein kinase GacS  38.27 
 
 
905 aa  317  5e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0555684  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.01 
 
 
2213 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1200  hybrid sensory histidine kinase BarA  36.33 
 
 
933 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.930165  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2711  Hpt sensor hybrid histidine kinase  39.46 
 
 
818 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0181892 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2674  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.23 
 
 
1305 aa  315  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1650  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.71 
 
 
917 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.1856 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1285  hybrid sensory histidine kinase BarA  36.35 
 
 
937 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000242189 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  36.28 
 
 
1763 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3120  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  35.48 
 
 
1653 aa  314  2.9999999999999996e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3028  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.39 
 
 
1426 aa  314  2.9999999999999996e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.514624  normal  0.437775 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3847  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.93 
 
 
921 aa  314  3.9999999999999997e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0937  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  37.2 
 
 
852 aa  313  5.999999999999999e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.661814  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3543  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.35 
 
 
1603 aa  313  6.999999999999999e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00143205 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0366  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.27 
 
 
1266 aa  313  6.999999999999999e-84  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.926091  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2842  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.81 
 
 
936 aa  311  2e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.870655 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  36.23 
 
 
1765 aa  311  2e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1474  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.19 
 
 
950 aa  311  2e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3604  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 
1172 aa  311  2e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3158  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.39 
 
 
1131 aa  311  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0979379 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0678  ammonium transporter  37.33 
 
 
1322 aa  310  4e-83  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760367  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1501  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.19 
 
 
925 aa  310  4e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1450  histidine kinase  40.27 
 
 
785 aa  310  4e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.106734  normal  0.251272 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3920  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  38.58 
 
 
758 aa  310  5e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4222  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.57 
 
 
922 aa  310  5e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.588582  normal  0.325016 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2979  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.6 
 
 
1340 aa  310  5e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.698765 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1950  PAS sensor protein  33.02 
 
 
1179 aa  310  6.999999999999999e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.488377  hitchhiker  0.000911769 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4067  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.5 
 
 
917 aa  310  6.999999999999999e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.125923  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0437  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.73 
 
 
1130 aa  309  8e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.454643  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0067  signal transduction histidine kinase-like protein protein  37.96 
 
 
1021 aa  309  8e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2370  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.68 
 
 
1433 aa  309  9e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2377  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.99 
 
 
1124 aa  309  9e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.506766  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50630  Periplasmic hybrid histidine protein kinase, two-component  37.29 
 
 
1030 aa  309  1.0000000000000001e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.366718  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1958  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.2 
 
 
816 aa  308  1.0000000000000001e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952692  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2456  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.36 
 
 
1128 aa  309  1.0000000000000001e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.165433 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.15 
 
 
1767 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.15 
 
 
1767 aa  308  3e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4582  sensor/response regulator hybrid  37.73 
 
 
925 aa  307  3e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0979  sensor histidine kinase  33.52 
 
 
1574 aa  307  4.0000000000000004e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00449169 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1252  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.76 
 
 
917 aa  307  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.376653  hitchhiker  0.0000592891 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2369  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.08 
 
 
1316 aa  306  5.0000000000000004e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2554  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.75 
 
 
876 aa  306  5.0000000000000004e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00476673 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3070  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.08 
 
 
1166 aa  306  6e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109625 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3355  hybrid sensory histidine kinase BarA  35.51 
 
 
937 aa  306  8.000000000000001e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0869798  hitchhiker  0.00259338 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.11 
 
 
1771 aa  306  9.000000000000001e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3314  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.62 
 
 
1582 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.660804  hitchhiker  0.0000234203 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.89 
 
 
1333 aa  305  2.0000000000000002e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000202305 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0544  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.45 
 
 
981 aa  305  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.811836  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0066  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.07 
 
 
721 aa  305  2.0000000000000002e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3652  Signal transduction histidine kinase-like  32.86 
 
 
765 aa  305  2.0000000000000002e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.471696  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>