More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3760 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_3760  MATE efflux family protein  100 
 
 
464 aa  920    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0299  MATE efflux family protein  41.35 
 
 
456 aa  357  1.9999999999999998e-97  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000180901  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1506  MATE efflux family protein  41.51 
 
 
450 aa  349  6e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0691  MATE efflux family protein  40.69 
 
 
450 aa  341  2e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0651  MATE efflux family protein  41.44 
 
 
446 aa  333  3e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000388571  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1343  MATE efflux family protein  36.38 
 
 
464 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000317655  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0901  MATE efflux family protein  35.54 
 
 
463 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000627796  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1082  efflux protein  36.38 
 
 
464 aa  303  6.000000000000001e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000125629  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4103  Na+ driven multidrug efflux pump  36.44 
 
 
463 aa  302  6.000000000000001e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0660054  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1266  MATE efflux family protein  36.61 
 
 
464 aa  302  9e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1239  MATE efflux family protein  36.38 
 
 
464 aa  302  9e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.238085  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1106  MATE efflux family protein  36.38 
 
 
464 aa  301  1e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000560081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1088  efflux protein  36.38 
 
 
464 aa  301  1e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000024435  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1196  MATE efflux family protein  36.38 
 
 
464 aa  301  1e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000655029  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1305  MATE efflux family protein  35.78 
 
 
464 aa  300  3e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.40401  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1094  MATE efflux family protein  35.78 
 
 
464 aa  298  1e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000923462  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0645  DcuC protein  33.96 
 
 
439 aa  277  3e-73  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0078  mate efflux family protein  33.49 
 
 
439 aa  275  1.0000000000000001e-72  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.129262  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18490  MATE efflux family protein  33.03 
 
 
442 aa  273  5.000000000000001e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000174233  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0536  mate efflux family protein  33.72 
 
 
440 aa  268  1e-70  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0648  mate efflux family protein  30.8 
 
 
440 aa  263  6e-69  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.849411  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000940  Na+ driven multidrug efflux pump  32.73 
 
 
446 aa  257  3e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000926882  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3187  MATE efflux family protein  34.08 
 
 
486 aa  249  9e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06935  Na+-driven multidrug efflux pump  32.05 
 
 
446 aa  246  4.9999999999999997e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3779  MATE efflux family protein  33.41 
 
 
453 aa  246  9e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3656  MATE efflux family protein  33.18 
 
 
453 aa  244  3e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0802  MATE efflux family protein  34.3 
 
 
453 aa  244  3e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0649  MATE efflux family protein  32.89 
 
 
453 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3589  MATE efflux family protein  32.89 
 
 
476 aa  242  1e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3485  MATE efflux family protein  33.41 
 
 
453 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3315  MATE efflux family protein  33.04 
 
 
456 aa  239  1e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0638  MATE efflux family protein  33.04 
 
 
456 aa  238  1e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0795  conserved hypothetical integral membrane protein, MATE family efflux protein  30.65 
 
 
438 aa  227  4e-58  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.472325  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1050  MATE efflux family protein  28.37 
 
 
438 aa  216  5e-55  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0807602  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0648  MATE efflux family protein  27.67 
 
 
438 aa  212  1e-53  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0722  MATE efflux family protein  27.21 
 
 
438 aa  211  2e-53  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0500546  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0446  multi anti extrusion protein MatE  34.46 
 
 
455 aa  209  8e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  25.79 
 
 
469 aa  177  3e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0009  multi antimicrobial extrusion protein MatE  26.86 
 
 
555 aa  175  1.9999999999999998e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.64807  hitchhiker  0.000313529 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7312  hypothetical protein  28.19 
 
 
458 aa  160  5e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  26.22 
 
 
458 aa  157  4e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  25.11 
 
 
475 aa  154  2.9999999999999998e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0279  MATE efflux family protein  24.2 
 
 
445 aa  154  4e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  27.05 
 
 
461 aa  152  8.999999999999999e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  24.55 
 
 
464 aa  147  5e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  22.86 
 
 
453 aa  145  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  24.6 
 
 
475 aa  145  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3815  MATE efflux family protein  28.92 
 
 
467 aa  143  7e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.142559  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0830  MATE efflux family protein  24.89 
 
 
445 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000918772  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2653  MATE efflux family protein  27.82 
 
 
484 aa  139  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0875  mate efflux family protein  26.64 
 
 
446 aa  135  9.999999999999999e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  24.56 
 
 
464 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  24.56 
 
 
464 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  24.77 
 
 
450 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1139  hypothetical protein  23.79 
 
 
484 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000023845  hitchhiker  0.0000334983 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2267  hypothetical protein  23.79 
 
 
546 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000010697  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1659  hypothetical protein  24.01 
 
 
495 aa  130  7.000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000439345  normal  0.0451104 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01896  predicted multidrug efflux system  23.57 
 
 
547 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0202846  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1669  MATE efflux family protein  23.57 
 
 
495 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135228  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1504  hypothetical protein  25 
 
 
502 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.969676  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1694  hypothetical protein  23.64 
 
 
474 aa  128  2.0000000000000002e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.832751  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2508  multi anti extrusion protein MatE  26.33 
 
 
463 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01885  hypothetical protein  23.57 
 
 
547 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0187925  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  26.61 
 
 
468 aa  129  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2829  hypothetical protein  23.57 
 
 
484 aa  127  3e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000399298  normal  0.437543 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2504  hypothetical protein  23.64 
 
 
474 aa  127  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0192343  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2108  hypothetical protein  23.57 
 
 
546 aa  127  5e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.24671e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  24.35 
 
 
460 aa  127  6e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1531  hypothetical protein  27.03 
 
 
478 aa  125  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2407  hypothetical protein  23.64 
 
 
476 aa  125  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.149109  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2872  hypothetical protein  25 
 
 
474 aa  124  3e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0273189  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1132  mate efflux family protein  22.27 
 
 
446 aa  124  4e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0193769  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0427  MATE efflux family protein  25.34 
 
 
446 aa  124  5e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.744275  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  24.88 
 
 
477 aa  123  6e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1252  MATE efflux family protein  25.66 
 
 
445 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000131388  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  26.1 
 
 
483 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  26.26 
 
 
486 aa  122  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0441  MATE efflux family protein  25.11 
 
 
446 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000223642  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1856  Na+-driven multidrug efflux pump  26.02 
 
 
429 aa  122  1.9999999999999998e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0920105  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000109  adhesin  24.72 
 
 
461 aa  121  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.466925  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  26.51 
 
 
452 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0347  MATE efflux family protein  22.53 
 
 
454 aa  120  3.9999999999999996e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000816576  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1590  hypothetical protein  24.32 
 
 
476 aa  119  7.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00267858  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2542  MATE efflux family protein  25.69 
 
 
459 aa  119  9.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3993  MATE efflux family protein  25.74 
 
 
447 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2173  MATE efflux family protein  24.95 
 
 
481 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.843006 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4087  MATE efflux family protein  25.97 
 
 
447 aa  117  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1418  MATE efflux family protein  25.7 
 
 
462 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  22.2 
 
 
438 aa  116  8.999999999999998e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1724  multi anti extrusion protein MatE  25.58 
 
 
471 aa  116  8.999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  26.42 
 
 
470 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2333  MATE efflux family protein  25.42 
 
 
456 aa  116  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2574  hypothetical protein  23.39 
 
 
480 aa  115  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  25.89 
 
 
469 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0522  MATE efflux family protein  23.18 
 
 
461 aa  113  6e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05715  Na+-driven multidrug efflux pump  24.61 
 
 
461 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0056  MATE efflux family protein  24.52 
 
 
412 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00168356  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0897  MATE efflux family protein  22.97 
 
 
453 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000262958  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3106  hypothetical protein  24.12 
 
 
484 aa  111  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.20256 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  24.08 
 
 
485 aa  110  5e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>