More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3693 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_3693  ABC transporter related  100 
 
 
237 aa  461  1e-129  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.647625  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4255  ABC transporter related  45.95 
 
 
260 aa  162  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.350498 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0258  ABC transporter related  41.36 
 
 
424 aa  160  2e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.431626 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3607  ABC transporter related protein  42.73 
 
 
536 aa  156  2e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0086  ABC transporter related  43.95 
 
 
260 aa  156  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.363839  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4385  ABC transporter related  45.7 
 
 
251 aa  155  5.0000000000000005e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.426909  normal  0.116393 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0882  corrinoid ABC transporter ATPase  44.84 
 
 
424 aa  155  8e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0631  ABC transporter related  42.74 
 
 
260 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.17434  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2066  ABC transporter related  42.99 
 
 
258 aa  154  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3729  ABC transporter related  41.33 
 
 
260 aa  153  2e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0793  ABC transporter related  43.24 
 
 
259 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5060  ABC transporter related protein  45.49 
 
 
264 aa  152  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165572  normal  0.307259 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6080  ABC transporter related  43.4 
 
 
271 aa  152  5e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.701967  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0664  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  41.3 
 
 
263 aa  150  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.435005 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0733  ABC transporter related  43.59 
 
 
260 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4277  ABC transporter related protein  44.21 
 
 
262 aa  150  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0257  ABC transporter related  41.9 
 
 
266 aa  150  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.80562  normal  0.0615172 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3049  ABC transporter, ATPase subunit  41.78 
 
 
260 aa  150  2e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1829  ABC transporter related  37.76 
 
 
257 aa  150  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.336355  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1302  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  40.66 
 
 
258 aa  149  3e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1152  multi anti extrusion protein MatE  39.37 
 
 
255 aa  149  4e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4566  ABC transporter related  45.66 
 
 
280 aa  149  5e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2731  ABC transporter related  46.26 
 
 
255 aa  149  5e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8245  ABC transporter related  44.02 
 
 
271 aa  148  7e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.475817  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1942  ABC transporter related  43.44 
 
 
257 aa  148  7e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2099  ABC transporter related  42.6 
 
 
261 aa  148  8e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0760  iron(III) dicitrate transport system, ATP-binding protein FecE  41.56 
 
 
263 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1821  ABC transporter related  44.29 
 
 
274 aa  147  1.0000000000000001e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77339  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1344  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  39.83 
 
 
258 aa  146  2.0000000000000003e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1342  ABC transporter related  42.99 
 
 
252 aa  145  4.0000000000000006e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.868132  normal  0.307367 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2923  ABC transporter related  40.99 
 
 
260 aa  145  5e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0729345  normal  0.892851 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1832  ABC transporter related protein  41.18 
 
 
490 aa  143  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2416  ABC transporter related  39.66 
 
 
273 aa  142  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.118562 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1001  ABC transporter related  42.45 
 
 
260 aa  143  3e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.796453  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1894  ABC transporter related  34.56 
 
 
416 aa  142  6e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0511  ABC transporter related  40.27 
 
 
259 aa  142  6e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.470088 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2397  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  38.56 
 
 
255 aa  141  7e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.497702 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3202  ABC transporter related  35.45 
 
 
405 aa  141  8e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3902  ABC transporter-related protein  38.3 
 
 
270 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1116  ABC transporter related  39.38 
 
 
307 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4685  hemin importer ATP-binding subunit  43.64 
 
 
255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000508332  hitchhiker  0.00000000000000885497 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3884  ABC transporter related  44.49 
 
 
267 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2708  ABC transporter related  45.54 
 
 
257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3084  ABC transporter related  37.78 
 
 
269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.41824  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2830  ABC transporter-like  39.21 
 
 
268 aa  139  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.652667  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3784  ABC transporter related  36.36 
 
 
253 aa  139  3e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3037  ABC transporter related  37.78 
 
 
269 aa  139  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1424  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  34.55 
 
 
251 aa  139  3e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000297439  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2511  ABC transporter related  42.79 
 
 
253 aa  139  3e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3804  ABC transporter related  41.3 
 
 
271 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2015  ABC transporter related protein  44.24 
 
 
278 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00270172  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4551  hemin importer ATP-binding subunit  42.67 
 
 
255 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000433574  decreased coverage  0.0000000113958 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1172  iron ABC transporter, ATP-binding protein  36.57 
 
 
259 aa  139  4.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23980  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  46.98 
 
 
339 aa  139  4.999999999999999e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.862389 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3756  ABC transporter related protein  38.46 
 
 
274 aa  139  4.999999999999999e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.681155  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1932  ABC transporter related  33.64 
 
 
266 aa  138  7e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2492  ABC transporter related  40.27 
 
 
419 aa  138  7e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0153  ABC transporter-like  38.7 
 
 
260 aa  138  7.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3790  ABC transporter related  41.44 
 
 
262 aa  138  8.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00500294  normal  0.911746 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4687  hemin importer ATP-binding subunit  42.67 
 
 
255 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.687839  hitchhiker  0.000215024 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  34.36 
 
 
266 aa  137  1e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4828  ABC transporter related  41.49 
 
 
258 aa  137  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.169592  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0289  ABC transporter related  34.7 
 
 
268 aa  137  1e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137233  normal  0.108159 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2793  ABC transporter related  42.06 
 
 
414 aa  136  2e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1621  ABC transporter-like protein  37.95 
 
 
266 aa  137  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.76125  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  36.02 
 
 
258 aa  137  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42590  hemin importer ATP-binding subunit  44.75 
 
 
255 aa  137  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00288273  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0593  ABC transporter-like  44.09 
 
 
262 aa  137  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.835078  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1289  hypothetical protein  36.77 
 
 
259 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.128877 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5230  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  36.6 
 
 
270 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1809  ABC transporter related  37.83 
 
 
274 aa  136  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5629  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  36.6 
 
 
270 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1391  ABC transporter related protein  40.99 
 
 
272 aa  136  3.0000000000000003e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0432  ABC transporter related  36.21 
 
 
262 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1943  ABC transporter related  45.02 
 
 
253 aa  135  4e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82055  normal  0.0334831 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2341  hemin importer ATP-binding subunit  35.47 
 
 
262 aa  135  4e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0724766  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5061  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.6 
 
 
270 aa  135  5e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0298  ABC transporter related  32.26 
 
 
266 aa  135  5e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5473  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.6 
 
 
270 aa  135  5e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5510  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.6 
 
 
270 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5078  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.6 
 
 
270 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5559  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.6 
 
 
270 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2583  ABC transporter related protein  39.26 
 
 
293 aa  135  6.0000000000000005e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.641759  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5174  ABC transporter related  36.6 
 
 
270 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1212  ABC transporter related  36.75 
 
 
253 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1642  ABC transporter related protein  43.18 
 
 
274 aa  135  7.000000000000001e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3207  ABC transporter related  38.33 
 
 
253 aa  135  8e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.712241  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0418  protein of unknown function DUF105  42.2 
 
 
490 aa  135  8e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1737  ABC transporter related  39.82 
 
 
284 aa  134  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0324533  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5504  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.17 
 
 
270 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0690  ABC transporter related  36.61 
 
 
255 aa  134  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0416  ABC transporter related  43.18 
 
 
284 aa  134  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0840  ABC transporter related  36.02 
 
 
321 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0971  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  39.82 
 
 
255 aa  134  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.51617  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2740  ABC transporter related  42.67 
 
 
264 aa  133  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.090181 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3068  enterobactin-iron transport system ATP-binding protein  39.92 
 
 
269 aa  133  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263248  normal  0.356358 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2982  ABC transporter related  44 
 
 
254 aa  133  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.200508  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3182  ABC transporter related  36.02 
 
 
321 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3280  ABC transporter related  36.71 
 
 
326 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1239  ABC transporter related  40.44 
 
 
292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.469823  normal  0.0861739 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>