More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3663 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3663  3-isopropylmalate dehydrogenase  100 
 
 		 347 aa  712    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.185216  normal  0.76534 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0785  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.43 
 
 		 369 aa  419  1e-116  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.537709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0908  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.71 
 
 		 362 aa  402  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0378851  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3353  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.43 
 
 		 362 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.133211 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001657  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.85 
 
 		 363 aa  393  1e-108  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0391  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.56 
 
 		 358 aa  394  1e-108  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2066  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.98 
 
 		 363 aa  389  1e-107  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0602  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.71 
 
 		 362 aa  390  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000206723  normal  0.0345378 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1045  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.43 
 
 		 362 aa  388  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.18231  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00816  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.56 
 
 		 363 aa  391  1e-107  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0348  3-isopropylmalate dehydrogenase  58 
 
 		 363 aa  390  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000128786  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0744  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.98 
 
 		 363 aa  386  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00075  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.98 
 
 		 363 aa  386  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3525  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.98 
 
 		 363 aa  386  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0121  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.98 
 
 		 363 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.165091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0076  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.98 
 
 		 363 aa  386  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0078  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.98 
 
 		 363 aa  387  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.656199 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1904  3-isopropylmalate dehydrogenase  56 
 
 		 365 aa  386  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000997715  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0376  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.39 
 
 		 363 aa  385  1e-106  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0123  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.98 
 
 		 363 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0556005 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0078  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.98 
 
 		 363 aa  386  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0080  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.98 
 
 		 363 aa  387  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00074  hypothetical protein  55.98 
 
 		 363 aa  386  1e-106  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3584  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.98 
 
 		 363 aa  386  1e-106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00038703 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0124  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.98 
 
 		 363 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.736589  normal  0.998111 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0128  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.98 
 
 		 363 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0045  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.86 
 
 		 362 aa  387  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0146911  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0128  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.98 
 
 		 363 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0349763 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2879  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.43 
 
 		 362 aa  383  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0631  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.98 
 
 		 363 aa  382  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.305099  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2937  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.56 
 
 		 363 aa  384  1e-105  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3406  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.27 
 
 		 363 aa  382  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3536  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.56 
 
 		 363 aa  384  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0621  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.69 
 
 		 363 aa  384  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0240916 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0593  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.27 
 
 		 363 aa  384  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0067  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.69 
 
 		 363 aa  384  1e-105  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3796  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.1 
 
 		 363 aa  374  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0386  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.19 
 
 		 364 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0412  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.19 
 
 		 364 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000160123 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0398  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.19 
 
 		 364 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00047099 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0387  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.88 
 
 		 364 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4235  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.88 
 
 		 364 aa  369  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0472  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.57 
 
 		 364 aa  369  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3587  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.57 
 
 		 364 aa  368  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0369  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.88 
 
 		 364 aa  370  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3760  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.88 
 
 		 364 aa  370  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.930795  normal  0.184493 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0394  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.66 
 
 		 364 aa  367  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000221943 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0335  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.88 
 
 		 364 aa  364  1e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3819  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.96 
 
 		 364 aa  363  3e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3827  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.35 
 
 		 364 aa  362  4e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3471  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.66 
 
 		 364 aa  360  2e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.556446 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4549  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.88 
 
 		 364 aa  360  3e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.412128  normal  0.012049 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0336  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.15 
 
 		 364 aa  359  3e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.309261  normal  0.513692 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0128  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.94 
 
 		 356 aa  358  5e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0016  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.49 
 
 		 358 aa  358  9e-98  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2095  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.78 
 
 		 358 aa  358  9e-98  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1888  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.2 
 
 		 358 aa  357  9.999999999999999e-98  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3608  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.23 
 
 		 363 aa  353  2e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2140  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.18 
 
 		 358 aa  353  2.9999999999999997e-96  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0114  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.2 
 
 		 352 aa  352  5e-96  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0288  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.76 
 
 		 356 aa  351  8.999999999999999e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2015  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.01 
 
 		 360 aa  349  3e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.021307  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1193  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.59 
 
 		 363 aa  349  3e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2487  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.76 
 
 		 352 aa  349  4e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1892  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.58 
 
 		 360 aa  347  1e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.154027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23790  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.44 
 
 		 360 aa  346  3e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0915643 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2721  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.3 
 
 		 360 aa  346  3e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0190941  normal  0.0566777 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34260  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.01 
 
 		 360 aa  345  8e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0864  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.31 
 
 		 350 aa  343  2e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000147801  hitchhiker  0.00313755 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0797  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.01 
 
 		 357 aa  343  2e-93  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000426941  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1740  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.57 
 
 		 357 aa  343  2e-93  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1519  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.58 
 
 		 360 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.676476  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2063  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.43 
 
 		 360 aa  342  5e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2252  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.78 
 
 		 357 aa  342  5.999999999999999e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02610  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.15 
 
 		 357 aa  342  7e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03086  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.57 
 
 		 365 aa  341  9e-93  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1985  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.86 
 
 		 360 aa  341  9e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.2378  decreased coverage  0.00707192 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1988  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.3 
 
 		 360 aa  341  1e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.325379  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4209  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.82 
 
 		 362 aa  341  1e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3771  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.3 
 
 		 360 aa  341  1e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1551  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.58 
 
 		 360 aa  341  1e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.346494 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2131  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.67 
 
 		 355 aa  341  1e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.609597  normal  0.0221523 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2099  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.72 
 
 		 355 aa  340  2e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000153808  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1563  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.58 
 
 		 357 aa  340  2e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.27267  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2175  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.86 
 
 		 360 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0671441  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0364  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.01 
 
 		 354 aa  339  2.9999999999999998e-92  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0381  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.01 
 
 		 354 aa  339  2.9999999999999998e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2075  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.29 
 
 		 358 aa  339  5e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1732  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.29 
 
 		 358 aa  339  5e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00156138  hitchhiker  0.00249428 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2592  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.3 
 
 		 371 aa  338  5.9999999999999996e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.229971  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1539  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.86 
 
 		 357 aa  338  7e-92  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2093  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.3 
 
 		 359 aa  338  9.999999999999999e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0127981  normal  0.7067 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3847  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.54 
 
 		 355 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.937841 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4627  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.82 
 
 		 355 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.391224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3343  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.26 
 
 		 355 aa  335  5e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1483  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.58 
 
 		 357 aa  335  5.999999999999999e-91  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.607612  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1918  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.44 
 
 		 353 aa  334  1e-90  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4415  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.82 
 
 		 355 aa  334  1e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3952  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.82 
 
 		 355 aa  334  1e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.201991 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3576  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.82 
 
 		 355 aa  334  1e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.490614 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>