More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3649 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_3649  isochorismate synthase  100 
 
 
485 aa  961    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4072  isochorismate synthases  37.02 
 
 
498 aa  360  2e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.108156  unclonable  0.0000687043 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4752  isochorismate synthase  41.48 
 
 
473 aa  348  1e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2632  menaquinone-specific isochorismate synthase  40.47 
 
 
471 aa  346  6e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1395  isochorismate synthase  39.05 
 
 
471 aa  346  6e-94  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1520  isochorismate synthase  36.1 
 
 
492 aa  342  7e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1547  isochorismate synthase  36.1 
 
 
492 aa  342  9e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.471874  normal  0.556355 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5120  isochorismate synthase  41.47 
 
 
506 aa  315  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0857744  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2188  isochorismate synthase  41.18 
 
 
467 aa  273  4.0000000000000004e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.976142  normal  0.55094 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0667  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  38.39 
 
 
481 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.48283 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0219  isochorismate synthase  37.16 
 
 
482 aa  243  6e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0140875  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09210  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  37.23 
 
 
476 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.059439  normal  0.799478 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0869  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  36.66 
 
 
476 aa  232  1e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.81053  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3364  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  38.17 
 
 
476 aa  232  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5003  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  38.17 
 
 
476 aa  232  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5284  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  37.5 
 
 
477 aa  231  3e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283486  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2595  isochorismate synthase  39.39 
 
 
469 aa  226  6e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0026  isochorismate synthase  35.46 
 
 
455 aa  224  2e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.828763 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1345  isochorismate synthase  35.68 
 
 
467 aa  224  3e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1784  isochorismate synthase  40 
 
 
451 aa  224  4e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4216  isochorismate synthase  35.07 
 
 
486 aa  220  6e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.192209  normal  0.410479 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1413  isochorismate synthase  39.22 
 
 
407 aa  218  1e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.36594  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3578  isochorismate synthase  37.87 
 
 
483 aa  216  5.9999999999999996e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0501054  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1717  isochorismate synthase  37.82 
 
 
409 aa  216  5.9999999999999996e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2398  isochorismate synthase  37.79 
 
 
415 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  unclonable  0.000000000233134  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2562  isochorismate synthase  39.29 
 
 
449 aa  213  5.999999999999999e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.208593 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2145  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  50.59 
 
 
484 aa  212  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00728668  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0781  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  50.59 
 
 
484 aa  212  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01951  isochorismate synthase  35.16 
 
 
465 aa  211  2e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.109371  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1487  isochorismate synthase  36.59 
 
 
445 aa  211  3e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.674496  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0871  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  50.2 
 
 
492 aa  211  3e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2439  isochorismate synthase  33.62 
 
 
468 aa  207  3e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2800  isochorismate synthase  30.02 
 
 
460 aa  206  5e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4053  hypothetical protein  37.73 
 
 
412 aa  206  6e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0581  isochorismate synthase  37.04 
 
 
466 aa  204  3e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1833  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  41.54 
 
 
481 aa  204  3e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.265148  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0814  isochorismate synthase  36.32 
 
 
451 aa  202  9.999999999999999e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02521  isochorismate synthase  31.47 
 
 
466 aa  201  3e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4561  isochorismate synthase  48.66 
 
 
424 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27351  isochorismate synthase  32.39 
 
 
505 aa  197  4.0000000000000005e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.705522 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0041  isochorismate synthase  39.54 
 
 
452 aa  196  7e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.124842  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1545  isochorismate synthase  30.6 
 
 
466 aa  196  9e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2120  isochorismate synthase  32.14 
 
 
475 aa  196  1e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0751  isochorismate synthase  40.98 
 
 
384 aa  192  1e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1919  isochorismate synthase  46.88 
 
 
451 aa  192  1e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3570  isochorismate synthase  35.71 
 
 
554 aa  189  8e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2897  isochorismate synthases  36.41 
 
 
473 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0157993  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5016  menaquinone-specific isochorismate synthase  31.58 
 
 
464 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000376583  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4998  menaquinone-specific isochorismate synthase  31.58 
 
 
464 aa  184  3e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0061781  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4969  menaquinone-specific isochorismate synthase  31.58 
 
 
464 aa  183  7e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4751  menaquinone-specific isochorismate synthase  31.28 
 
 
464 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.424984  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5112  menaquinone-specific isochorismate synthase  31.28 
 
 
464 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00381916  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4589  menaquinone-specific isochorismate synthase  31.58 
 
 
464 aa  182  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000229188  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4611  menaquinone-specific isochorismate synthase  31.58 
 
 
464 aa  182  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0347123  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0251  menaquinone-specific isochorismate synthase  31.6 
 
 
464 aa  182  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000139379  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4987  menaquinone-specific isochorismate synthase  31.94 
 
 
464 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00107234  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5716  isochorismate synthase  36.49 
 
 
495 aa  181  4e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0567  isochorismate synthase  34.76 
 
 
461 aa  180  4e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3494  menaquinone-specific isochorismate synthase  31.61 
 
 
464 aa  179  1e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0194086  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3982  isochorismate synthase  43.4 
 
 
377 aa  179  1e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.571386 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1877  isochorismate synthase  32.53 
 
 
475 aa  178  2e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4311  isochorismate synthase  34.08 
 
 
452 aa  178  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.240135  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0516  isochorismate synthases  32.81 
 
 
428 aa  178  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.868248  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4256  isochorismate synthase  34.08 
 
 
452 aa  178  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4713  menaquinone-specific isochorismate synthase, putative  33.8 
 
 
452 aa  177  4e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0130  menaquinone-specific isochorismate synthase, putative  31 
 
 
452 aa  177  4e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.331361  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21430  isochorismate synthase family protein  38.64 
 
 
465 aa  176  6e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0130324  decreased coverage  0.00000737773 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0088  isochorismate synthase  33.8 
 
 
452 aa  176  7e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0560  isochorismate synthase  39.26 
 
 
398 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0093  isochorismate synthase  34.08 
 
 
452 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.229971  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4451  isochorismate synthase  33.52 
 
 
452 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2720  isochorismate synthase  34.49 
 
 
441 aa  174  3.9999999999999995e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.307499 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3873  isochorismate synthase  33.52 
 
 
452 aa  173  6.999999999999999e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.971486  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1802  isochorismate synthase  39.54 
 
 
395 aa  173  6.999999999999999e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1690  isochorismate synthases  42.46 
 
 
394 aa  173  6.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0462  isochorismate synthase  37.04 
 
 
398 aa  171  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3913  isochorismate synthases  32.81 
 
 
460 aa  169  7e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.348383  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0332  isochorismate synthase  33.25 
 
 
473 aa  169  1e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0246955  normal  0.0588972 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4698  isochorismate synthase  29.87 
 
 
464 aa  169  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00246668  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4515  isochorismate synthase  40.33 
 
 
401 aa  168  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.589784  normal  0.140007 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0130  isochorismate synthase  32.76 
 
 
414 aa  168  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000366524  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4089  isochorismate synthase  33.15 
 
 
452 aa  168  2e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3868  isochorismate synthases  34.08 
 
 
452 aa  167  4e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.172754  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3677  isochorismate synthase  41.32 
 
 
452 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14050  isochorismate synthase family protein  31.4 
 
 
418 aa  166  9e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1098  menaquinone-specific isochorismate synthase  38.67 
 
 
440 aa  165  2.0000000000000002e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.994822  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21220  Isochorismate synthase  40.45 
 
 
403 aa  164  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.12454  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4071  isochorismate synthases  31.91 
 
 
452 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.381607  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1318  isochorismate synthase  38.32 
 
 
395 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00818853  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2018  isochorismate synthase  37.42 
 
 
425 aa  164  3e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.577572 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0536  isochorismate synthase  33.33 
 
 
469 aa  164  3e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1026  isochorismate synthase  38.08 
 
 
484 aa  164  4.0000000000000004e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102724 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0466  isochorismate synthase  39.41 
 
 
447 aa  164  4.0000000000000004e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3961  isochorismate synthases  31.65 
 
 
452 aa  163  8.000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.338247  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2387  isochorismate synthase DhbC  38.04 
 
 
399 aa  162  9e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4032  isochorismate synthase  39.03 
 
 
376 aa  162  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2469  isochorismate synthase DhbC  38.15 
 
 
399 aa  161  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000172117  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2399  isochorismate synthase DhbC  37.78 
 
 
399 aa  161  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0854812  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1755  isochorismate synthase DhbC  36.27 
 
 
403 aa  160  4e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000357241  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004033  menaquinone-specific isochorismate synthase  37.64 
 
 
435 aa  160  6e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>