83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3620 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_3620  glycosyltransferase  100 
 
 
443 aa  912    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.270845  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1195  hypothetical protein  42.99 
 
 
420 aa  273  7e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.291365  normal  0.75436 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2340  glycosyl transferase, group 1  39.78 
 
 
397 aa  262  8.999999999999999e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.107482  normal  0.0271805 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2899  hypothetical protein  38.54 
 
 
394 aa  256  6e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.394156  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2150  amine oxidase  39.23 
 
 
1293 aa  253  6e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.017557  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4112  glycosyl transferase group 1  38.3 
 
 
385 aa  248  1e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2020  UDP-galactopyranose mutase  38.71 
 
 
814 aa  249  1e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.843123  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1306  glycosyl transferase group 1  37.44 
 
 
422 aa  243  7e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.622401  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2703  hypothetical protein  38.61 
 
 
394 aa  241  2e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0632784  normal  0.0662018 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5260  glycosyltransferase  38.46 
 
 
405 aa  238  2e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4021  glycosyl transferase group 1  37.01 
 
 
382 aa  237  4e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0280  glycosyl transferase group 1  38.24 
 
 
403 aa  230  3e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5685  UDP-galactopyranose mutase  40.88 
 
 
783 aa  230  4e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.649144  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2529  hypothetical protein  38.22 
 
 
376 aa  227  3e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0087  glycosyltransferase  37.47 
 
 
412 aa  223  4e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.170697 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5610  UDP-galactopyranose mutase  34.92 
 
 
783 aa  212  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00502091 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4118  glycosyl transferase group 1  32.73 
 
 
383 aa  189  1e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0967144  hitchhiker  0.00000000882956 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2281  glycosyl transferase, group 1  29.66 
 
 
389 aa  159  9e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2380  hypothetical protein  27.61 
 
 
434 aa  158  1e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0254989  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2210  glycosyl transferase, group 1  31.25 
 
 
392 aa  146  9e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.516379  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0105  glycosyl transferase group 1  30.49 
 
 
385 aa  145  2e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2641  hypothetical protein  37.37 
 
 
392 aa  144  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0602501  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4703  glycosyl transferase group 1  30.42 
 
 
390 aa  141  3e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3059  glycosyl transferase, group 1  32.16 
 
 
416 aa  139  8.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.304674  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2822  hypothetical protein  35.89 
 
 
392 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2727  hypothetical protein  35.89 
 
 
392 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.298348  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1819  hypothetical protein  26.4 
 
 
388 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000132371  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25661  hypothetical protein  30.58 
 
 
741 aa  132  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0058  glycosyltransferase-like protein  35.29 
 
 
443 aa  130  3e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.336763  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4204  glycosyl transferase, group 1  32.46 
 
 
398 aa  126  7e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.186805  normal  0.199136 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0179  glycosyl transferase group 1  30.26 
 
 
404 aa  125  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.160562  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0677  glycosyl transferase group 1  34.09 
 
 
397 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0652  putative glycosyl transferase  28.34 
 
 
1119 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.427712 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1956  glycosyl transferase group 1  29.58 
 
 
397 aa  119  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.454805  hitchhiker  0.000698573 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0299  putative glycosyl transferases  25.27 
 
 
385 aa  116  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0265  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.16 
 
 
427 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0256  teichuronic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  31.16 
 
 
427 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.188802  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003539  glycosyltransferase  29.07 
 
 
374 aa  112  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0199  hypothetical protein  33.33 
 
 
754 aa  110  4.0000000000000004e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02222  hypothetical protein  26.91 
 
 
375 aa  110  5e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2439  glycosyl transferase, group 1  27.97 
 
 
388 aa  108  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0169  glycosyltransferase-like protein  30.92 
 
 
751 aa  107  4e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.672061  normal  0.17945 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0171  hypothetical protein  26.55 
 
 
391 aa  106  1e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.571999 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2279  glycosyl transferase, group 1  28.05 
 
 
382 aa  105  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0170  glycosyl transferase group 1  31.7 
 
 
394 aa  104  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.269733  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1863  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.72 
 
 
378 aa  104  3e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0827  glycosyl transferase group 1  26.7 
 
 
350 aa  103  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1753  glycosyl transferase family 2  33.18 
 
 
705 aa  103  9e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0589133  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4117  glycosyl transferase group 1  29.5 
 
 
395 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0723713  hitchhiker  0.0000000981139 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2692  hypothetical protein  26.98 
 
 
370 aa  102  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1963  glycosyl transferase group 1  24.63 
 
 
406 aa  101  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000383254 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19360  hypothetical protein  24.11 
 
 
319 aa  99.8  9e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0257  teichuronic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  28.86 
 
 
411 aa  99  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0141248  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3716  glycosyl transferase group 1  26.33 
 
 
400 aa  99.4  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.668211  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0266  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.86 
 
 
411 aa  99.4  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3311  glycosyl transferase, group 1  26.26 
 
 
390 aa  98.2  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3854  hypothetical protein  25.3 
 
 
407 aa  99  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0259  teichuronic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  24.01 
 
 
477 aa  97.8  4e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.636404  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0268  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.01 
 
 
477 aa  97.1  5e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1929  glycosyl transferase, group 1  31 
 
 
409 aa  90.5  5e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0258  glycosyl transferase group 1  28.52 
 
 
388 aa  90.1  7e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4319  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
903 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.577518  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2459  methyltransferase type 11  30.53 
 
 
729 aa  79.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.127037  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1496  Methyltransferase type 11  29.15 
 
 
728 aa  77.8  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0542283  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1400  Methyltransferase type 11  28.25 
 
 
728 aa  77  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.527052  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0664  hypothetical protein  26.04 
 
 
942 aa  75.9  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000150651  hitchhiker  0.00000068678 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0649  putative glycosyltransferase  35.51 
 
 
417 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.408248  normal  0.175721 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4122  glycosyl transferase, group 1  32.5 
 
 
393 aa  68.9  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3973  hypothetical protein  26.38 
 
 
372 aa  67  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.395913 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3695  methyltransferase type 12  26.94 
 
 
726 aa  63.2  0.000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0754  hypothetical protein  28.7 
 
 
416 aa  61.6  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.200233  hitchhiker  0.000521831 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2394  glycosyl transferase, group 1  29.82 
 
 
395 aa  61.2  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1571  hypothetical protein  29.8 
 
 
396 aa  57.8  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.443604 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6552  hypothetical protein  31.75 
 
 
400 aa  57.4  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0962  hypothetical protein  29.17 
 
 
378 aa  55.8  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0348  glycosyl transferase group 1  37.7 
 
 
396 aa  53.5  0.000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.212038  normal  0.421702 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0014  glycosyl transferase, group 1  28.09 
 
 
378 aa  52.4  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.176484  normal  0.0193724 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0612  glycosyl transferase group 1  27.5 
 
 
378 aa  51.2  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2234  glycosyl transferase, group 1  26.21 
 
 
380 aa  50.4  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1678  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
373 aa  50.1  0.00009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0250  glycosyl transferase, group 1  25.84 
 
 
378 aa  45.1  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3904  glycosyl transferase group 1  25.37 
 
 
374 aa  45.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0654  glycosyl transferase group 1  32.8 
 
 
392 aa  45.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.871092  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>