290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3527 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_3527  competence protein F, putative  100 
 
 
244 aa  495  1e-139  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.343371  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3090  phosphoribosyltransferase  38.82 
 
 
255 aa  134  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.318018  normal  0.255488 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0124  competence protein F, putative  40.44 
 
 
238 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3333  phosphoribosyltransferase  37.55 
 
 
242 aa  128  7.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2936  competence protein F, putative  36.44 
 
 
243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0346269  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1907  phosphoribosyltransferase  32.61 
 
 
279 aa  120  3e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000754112  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3855  phosphoribosyltransferase  36.77 
 
 
239 aa  119  6e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00709027 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3771  phosphoribosyltransferase  35.56 
 
 
239 aa  118  7e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0248  amidophosphoribosyltransferase  29.67 
 
 
245 aa  116  3e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.067407  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4125  amidophosphoribosyltransferase-like protein  33.88 
 
 
238 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000102342  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1259  amidophosphoribosyltransferase-like protein  33.91 
 
 
233 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000170778  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0737  phosphoribosyltransferase  37.71 
 
 
246 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.113594  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2675  competence protein F  36.21 
 
 
253 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3894  phosphoribosyltransferase  34.51 
 
 
259 aa  113  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.148595 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1140  phosphoribosyltransferase  35.32 
 
 
264 aa  113  3e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0794906  normal  0.739937 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0447  phosphoribosyltransferase  30.04 
 
 
229 aa  111  8.000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.300519  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2437  competence protein F  34.04 
 
 
262 aa  111  8.000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.104634 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0307  competence protein F  33.74 
 
 
255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.387643 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1028  competence protein F, putative  31.91 
 
 
262 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0109  phosphoribosyltransferase  31.87 
 
 
245 aa  110  2.0000000000000002e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0864582 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3970  competence protein F  34.6 
 
 
236 aa  109  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1495  phosphoribosyltransferase  35.41 
 
 
217 aa  109  3e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0351  competence protein F  34.98 
 
 
255 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1128  phosphoribosyltransferase  35.71 
 
 
239 aa  108  9.000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0559  phosphoribosyltransferase  36.1 
 
 
248 aa  108  9.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.230828  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0383  competence protein F  35.06 
 
 
255 aa  107  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366991  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_002936  DET1458  comF family protein, putative  32.66 
 
 
233 aa  108  1e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000115929  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0093  competence protein F  27.12 
 
 
230 aa  106  3e-22  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06360  putative phosphoribosyl transferase  34.84 
 
 
241 aa  106  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00829668  normal  0.955973 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0385  phosphoribosyltransferase  32.78 
 
 
271 aa  105  6e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.543655  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1808  putative competence protein F  31.91 
 
 
262 aa  105  6e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.640197  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2731  competence protein F, putative  32.65 
 
 
245 aa  104  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000243751  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0026  phosphoribosyltransferase  34.63 
 
 
254 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1236  ComF  32.07 
 
 
233 aa  102  4e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.105721  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2280  hypothetical protein  27.43 
 
 
234 aa  103  4e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2252  hypothetical protein  27.43 
 
 
234 aa  102  4e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3081  phosphoribosyltransferase  33.8 
 
 
237 aa  102  6e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000295242  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2264  phosphoribosyltransferase  31.84 
 
 
255 aa  102  8e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.200709  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0569  competence protein F, putative  31.45 
 
 
249 aa  101  1e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0143  putative competence protein F  25.42 
 
 
230 aa  100  1e-20  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0480  phosphoribosyltransferase  31.76 
 
 
270 aa  101  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3823  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  31.06 
 
 
258 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2248  phosphoribosyltransferase  27.27 
 
 
220 aa  99.8  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000079712  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2510  phosphoribosyltransferase  35.19 
 
 
258 aa  99.4  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.277662 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3532  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  30.86 
 
 
258 aa  99  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1736  phosphoribosyltransferase  30.47 
 
 
258 aa  98.6  9e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1878  competence protein F, putative  31.49 
 
 
262 aa  98.2  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0107  phosphoribosyltransferase  33.77 
 
 
272 aa  97.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0188  phosphoribosyltransferase  32.64 
 
 
239 aa  98.2  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138467  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3978  amidophosphoribosyltransferase  31.47 
 
 
247 aa  97.8  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000228235  hitchhiker  0.000000230998 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1977  hypothetical protein  31.91 
 
 
231 aa  97.1  2e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0592  putative phosphoribosyl transferase  35.34 
 
 
241 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.173105  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2971  phosphoribosyltransferase  33.05 
 
 
268 aa  97.4  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.566762 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0601  phosphoribosyltransferase  34.44 
 
 
271 aa  97.1  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7594  putative competence protein F (COMF)  32.76 
 
 
267 aa  97.4  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0419159 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5177  phosphoribosyltransferase  33.8 
 
 
246 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.039124  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0617  phosphoribosyltransferase  31.67 
 
 
247 aa  94.7  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4841  competence protein ComF  32.86 
 
 
245 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.399762  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1314  hypothetical protein  30.99 
 
 
226 aa  94.4  2e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1623  phosphoribosyltransferase  36.29 
 
 
227 aa  93.2  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.933338  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1124  competence protein F  33.2 
 
 
233 aa  91.3  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0317  hypothetical protein  33.33 
 
 
230 aa  91.7  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0134906 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2183  competence protein F  31.67 
 
 
256 aa  90.9  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0808644  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1537  putative competence protein F  35.24 
 
 
228 aa  90.5  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4202  phosphoribosyltransferase  36.81 
 
 
213 aa  90.1  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0030984 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3495  amidophosphoribosyltransferase  30.43 
 
 
236 aa  90.5  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.552167 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4174  putative competence protein f-related protein  34.03 
 
 
261 aa  90.1  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3006  phosphoribosyltransferase  33.19 
 
 
270 aa  89.7  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0234  putative competence protein F-related protein  33.74 
 
 
240 aa  88.6  7e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0348529 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1490  competence protein  30.34 
 
 
232 aa  88.6  8e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.923217  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2102  competence protein F  31.06 
 
 
246 aa  87  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0200  competence protein  31.02 
 
 
269 aa  87  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2108  phosphoribosyltransferase  31.84 
 
 
269 aa  87.4  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.227962  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0520  phosphoribosyltransferase  34.2 
 
 
269 aa  87.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.251587 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2296  hypothetical protein  30.64 
 
 
241 aa  86.7  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.658532  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2902  competence protein F, putative  32.77 
 
 
243 aa  86.7  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2573  amidophosphoribosyltransferase  34.76 
 
 
247 aa  86.3  4e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0158  competence protein F-related protein  33.19 
 
 
246 aa  85.9  5e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5516  phosphoribosyltransferase  29.66 
 
 
239 aa  85.9  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0090  phosphoribosyltransferase  28.44 
 
 
220 aa  85.9  6e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0273  putative competence protein F-related protein  30.57 
 
 
268 aa  85.5  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.317287  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0126  putative phosphoribosyltransferase  34.27 
 
 
260 aa  85.9  6e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0837099  normal  0.0454325 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3816  putative phosphoribosyl transferase  33.87 
 
 
266 aa  85.9  6e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.231863 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2284  phosphoribosyltransferase  32.89 
 
 
258 aa  85.5  7e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0107952 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4090  amidophosphoribosyltransferase-like protein  34.3 
 
 
246 aa  85.1  9e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0242  competence protein  33.02 
 
 
263 aa  84.7  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0418  competence protein F  33.02 
 
 
237 aa  84.7  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000113575 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4601  competence protein F  36.62 
 
 
239 aa  85.1  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0215  putative competence protein F-related protein  32.23 
 
 
240 aa  84.3  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.162002 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1812  phosphoribosyltransferase  22.75 
 
 
245 aa  84.7  0.000000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0367  comF family protein  29.44 
 
 
251 aa  84.3  0.000000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0129  competence protein F  32.6 
 
 
237 aa  84  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0258  amidophosphoribosyltransferases-like protein  32.64 
 
 
279 aa  84  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0391  phosphoribosyltransferase  32.58 
 
 
243 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.214316 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1412  hypothetical protein  28.1 
 
 
231 aa  83.2  0.000000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0156224  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0295  competence protein F, putative  31.95 
 
 
242 aa  83.2  0.000000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0572  ComF family protein  29.61 
 
 
204 aa  82.4  0.000000000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2292  ComF family protein  29.83 
 
 
286 aa  82  0.000000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1195  competence protein F  30.87 
 
 
240 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0493  competence protein ComF, putative  31.25 
 
 
244 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>