More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3519 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_3519  aspartate kinase  100 
 
 
405 aa  810    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0949457  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1006  aspartate kinase  56.44 
 
 
410 aa  451  1e-125  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000423126  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1965  aspartate kinase  53.85 
 
 
405 aa  431  1e-119  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0866474  hitchhiker  0.000866025 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0999  aspartate kinase  54.11 
 
 
401 aa  430  1e-119  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.419107  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1799  aspartate kinase  53.73 
 
 
405 aa  423  1e-117  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00100247  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34450  aspartate kinase  53.47 
 
 
411 aa  421  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0250796  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1377  aspartate kinase  53.87 
 
 
400 aa  418  1e-116  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000378473  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1300  aspartate kinase  53.2 
 
 
408 aa  420  1e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000018313  normal  0.0162978 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1843  aspartate kinase, monofunctional class  52.23 
 
 
410 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.369756  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0610  aspartate kinase  52.62 
 
 
400 aa  415  9.999999999999999e-116  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3555  aspartate kinase  52.23 
 
 
410 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00961214  normal  0.594079 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1880  aspartate kinase  54.23 
 
 
405 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000266682  hitchhiker  0.0000823679 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2318  aspartate kinase  53.23 
 
 
407 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000267569  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2018  aspartate kinase  53.62 
 
 
399 aa  416  9.999999999999999e-116  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000759653  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0626  aspartate kinase  54.26 
 
 
414 aa  416  9.999999999999999e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000147671  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4473  aspartate kinase  52.23 
 
 
411 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1442  aspartate kinase  52.23 
 
 
411 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0731797  normal  0.880113 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0685  aspartate kinase  52.12 
 
 
400 aa  412  1e-114  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.985937  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0969  aspartate kinase  52.71 
 
 
409 aa  411  1e-114  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1570  aspartate kinase  53.98 
 
 
399 aa  413  1e-114  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1087  aspartate kinase  52.12 
 
 
400 aa  414  1e-114  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3978  aspartate kinase  52.23 
 
 
411 aa  413  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0966  aspartate kinase  54.32 
 
 
412 aa  414  1e-114  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00725941  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3762  aspartate kinase  52.48 
 
 
411 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.216913  normal  0.392085 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1650  aspartate kinase  51.87 
 
 
403 aa  409  1e-113  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00485759  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2262  aspartate kinase  54.98 
 
 
404 aa  410  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000147386  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1290  aspartate kinase  53.22 
 
 
409 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.686916  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1425  aspartate kinase  52.74 
 
 
599 aa  405  1.0000000000000001e-112  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2515  aspartate kinase  51.72 
 
 
406 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00310544  normal  0.299295 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2902  aspartate kinase  52.59 
 
 
424 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4274  aspartate kinase  52.71 
 
 
413 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000967452  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1264  aspartate kinase  52.72 
 
 
404 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000223474  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4611  aspartate kinase  52.1 
 
 
412 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3627  aspartate kinase  52.1 
 
 
413 aa  406  1.0000000000000001e-112  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000937685  decreased coverage  0.000000109716 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3019  aspartate kinase  52.74 
 
 
405 aa  404  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0927  aspartate kinase  50.99 
 
 
413 aa  405  1e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0567  aspartate kinase  52.7 
 
 
408 aa  402  1e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.475671  normal  0.793189 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1044  aspartate kinase  54.25 
 
 
411 aa  404  1e-111  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52580  aspartate kinase  51.85 
 
 
412 aa  403  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1461  aspartate kinase  48.8 
 
 
428 aa  398  9.999999999999999e-111  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000357046  hitchhiker  0.0000374387 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1832  aspartate kinase  53.45 
 
 
410 aa  400  9.999999999999999e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.722812  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1639  aspartate kinase  49.04 
 
 
428 aa  399  9.999999999999999e-111  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000145942  hitchhiker  0.000682871 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0390  aspartate kinase  52.97 
 
 
409 aa  397  1e-109  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1304  aspartate kinase  55.06 
 
 
405 aa  397  1e-109  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.506172 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1480  aspartate kinase  52.36 
 
 
416 aa  395  1e-109  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.630457  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2173  aspartate kinase  53.47 
 
 
417 aa  397  1e-109  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0669  aspartate kinase  53.75 
 
 
400 aa  395  1e-109  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2531  aspartate kinase  53.23 
 
 
404 aa  395  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000021173  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04060  aspartate kinase  50.62 
 
 
427 aa  392  1e-108  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.53456 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1652  aspartate kinase  51.61 
 
 
416 aa  394  1e-108  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1961  aspartate kinase  54.07 
 
 
409 aa  391  1e-107  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000119099  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0773  aspartate kinase  52.48 
 
 
406 aa  389  1e-107  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0117085  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1613  aspartate kinase  51.85 
 
 
414 aa  386  1e-106  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.805125  normal  0.584087 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1589  aspartate kinase  50.98 
 
 
408 aa  388  1e-106  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3379  aspartate kinase  51.74 
 
 
410 aa  387  1e-106  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000124538  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1941  aspartate kinase  51.72 
 
 
409 aa  382  1e-105  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.122463  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0743  aspartate kinase  51.24 
 
 
406 aa  382  1e-105  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0574  aspartate kinase  48.02 
 
 
407 aa  383  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0407  aspartate kinase, monofunctional class  52.1 
 
 
408 aa  384  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0571  aspartate kinase  52.1 
 
 
408 aa  384  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1008  aspartate kinase  51.86 
 
 
405 aa  380  1e-104  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0358  aspartate kinase  52.11 
 
 
410 aa  381  1e-104  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00114688  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1167  aspartate kinase  49.88 
 
 
412 aa  376  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000835866  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1612  aspartate kinase  48.44 
 
 
427 aa  377  1e-103  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000435622  hitchhiker  0.0000000129841 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08040  aspartate kinase  49.13 
 
 
427 aa  377  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000887302  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1116  aspartate kinase  50.25 
 
 
404 aa  376  1e-103  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  unclonable  0.0000000000216352  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1515  aspartate kinase, monofunctional class  50.99 
 
 
405 aa  377  1e-103  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000110315  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2702  aspartate kinase  50.62 
 
 
426 aa  376  1e-103  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5257  aspartate kinase  49.75 
 
 
421 aa  374  1e-102  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.541049 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0276  aspartate kinase  49.38 
 
 
409 aa  372  1e-102  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.067186 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1378  aspartate kinase  50.5 
 
 
405 aa  373  1e-102  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000455127  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1075  aspartate kinase  53 
 
 
410 aa  374  1e-102  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352103  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3982  aspartate kinase  50.12 
 
 
421 aa  373  1e-102  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4889  aspartate kinase  49.75 
 
 
421 aa  374  1e-102  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.213019  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1251  aspartate kinase  50 
 
 
408 aa  373  1e-102  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.545654 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1141  aspartate kinase  48.39 
 
 
411 aa  373  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0966  aspartate kinase  50.62 
 
 
418 aa  374  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0227813  hitchhiker  0.000505058 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4978  aspartate kinase  49.75 
 
 
421 aa  374  1e-102  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.922524  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3119  aspartate kinase  50.86 
 
 
421 aa  368  1e-101  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000795424 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0282  aspartate kinase  47.74 
 
 
434 aa  369  1e-101  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1370  aspartate kinase  50.87 
 
 
407 aa  369  1e-101  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1317  aspartate kinase  47.54 
 
 
406 aa  369  1e-101  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.573615  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5504  aspartate kinase  49.63 
 
 
421 aa  369  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0983688 
 
 
-
 
NC_002936  DET1633  aspartate kinase  50 
 
 
405 aa  367  1e-100  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000255158  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0504  aspartate kinase  49.39 
 
 
422 aa  368  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3014  aspartate kinase  48.63 
 
 
406 aa  365  1e-100  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000193467  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2609  aspartate kinase  49.5 
 
 
407 aa  366  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0578539  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2048  aspartate kinase  48.51 
 
 
409 aa  365  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.122311  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0217  aspartate kinase  50.37 
 
 
421 aa  365  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1089  aspartate kinase  51.08 
 
 
416 aa  367  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000000023583  hitchhiker  0.00464797 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0111  aspartate kinase  50.12 
 
 
411 aa  365  1e-100  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.357195  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0694  aspartate kinase  49.88 
 
 
421 aa  365  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1034  aspartate kinase  47.99 
 
 
423 aa  367  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0654239  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1126  aspartate kinase  50.36 
 
 
416 aa  364  2e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00000763531  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0370  aspartate kinase  47.84 
 
 
417 aa  363  2e-99  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1353  aspartate kinase  48.93 
 
 
422 aa  362  5.0000000000000005e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0422902  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0462  aspartate kinase  49.88 
 
 
421 aa  362  7.0000000000000005e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.173887  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1743  aspartate kinase  47.96 
 
 
419 aa  362  7.0000000000000005e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.557086  normal  0.669364 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2154  aspartate kinase  48.36 
 
 
416 aa  362  9e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2591  aspartate kinase  48.36 
 
 
416 aa  362  9e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>