More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3497 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_3497  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  100 
 
 
284 aa  562  1.0000000000000001e-159  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.531289  normal  0.236776 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  46.83 
 
 
287 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3505  HemK family modification methylase  40.64 
 
 
289 aa  204  1e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.216122  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4214  HemK family modification methylase  45.55 
 
 
285 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.603488  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1490  modification methylase HemK  45 
 
 
296 aa  201  9.999999999999999e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4060  HemK family modification methylase  41.01 
 
 
284 aa  198  7.999999999999999e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.867838  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0365  HemK family modification methylase  45.04 
 
 
286 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1875  HemK family modification methylase  40.77 
 
 
301 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.210428  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1030  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  41.64 
 
 
286 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.864294  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0381  modification methylase HemK  43.01 
 
 
284 aa  195  6e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0393  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  45.39 
 
 
286 aa  194  1e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0395  modification methylase, HemK family  45.74 
 
 
286 aa  194  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1425  modification methylase HemK  39.37 
 
 
297 aa  193  2e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1585  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40.91 
 
 
297 aa  192  6e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.123528  normal  0.907026 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1714  HemK family modification methylase  43.07 
 
 
288 aa  192  6e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69784  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1085  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.95 
 
 
299 aa  191  1e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00355762  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  42.61 
 
 
288 aa  189  5e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3103  HemK family modification methylase  41.64 
 
 
284 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3525  HemK family modification methylase  43.73 
 
 
285 aa  188  7e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.836843  normal  0.984536 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1694  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40.42 
 
 
296 aa  187  2e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.886603  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0068  HemK family modification methylase  43.82 
 
 
283 aa  187  2e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0851  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.52 
 
 
297 aa  186  3e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0252199  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0042  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.83 
 
 
301 aa  184  1.0000000000000001e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.24008 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0473  HemK family modification methylase  38.49 
 
 
297 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000302756  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0093  HemK family modification methylase  38.55 
 
 
279 aa  183  3e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165478  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2540  modification methylase, HemK family  46.77 
 
 
293 aa  182  4.0000000000000006e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000199798  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1383  HemK family modification methylase  44.15 
 
 
289 aa  179  4.999999999999999e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2113  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  44.57 
 
 
281 aa  177  2e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.197793  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0987  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.68 
 
 
285 aa  176  4e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2501  HemK family modification methylase  40.43 
 
 
292 aa  176  4e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.132727 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2396  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase  41.7 
 
 
282 aa  176  5e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000357803  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2903  methyltransferase protein  46.33 
 
 
306 aa  175  6e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.907973  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17960  modification methylase, HemK family  36.01 
 
 
285 aa  175  8e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000857444  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02572  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase(HemK)  37.13 
 
 
285 aa  175  8e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.237156  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004202  Polypeptide chain release factor methylase  39.64 
 
 
284 aa  175  9e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2562  HemK family modification methylase  42.48 
 
 
298 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.429951  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4749  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40.07 
 
 
295 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1309  modification methylase, HemK family  38.62 
 
 
297 aa  174  1.9999999999999998e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.114861 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1114  HemK family modification methylase  41.79 
 
 
278 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.026044 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2889  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  44.02 
 
 
280 aa  171  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.479944 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2396  HemK family modification methylase  42.61 
 
 
283 aa  171  1e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.299117 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0779  Methyltransferase type 12  45.74 
 
 
280 aa  170  2e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0455874  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0647  HemK family modification methylase  40.99 
 
 
319 aa  170  2e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.307152  normal  0.250746 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1808  modification methylase, HemK family  40.21 
 
 
304 aa  170  2e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3598  HemK family modification methylase  39.92 
 
 
282 aa  169  3e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0376  modification methylase HemK  41.61 
 
 
298 aa  169  4e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.146746  normal  0.807288 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0435  modification methylase HemK  44.23 
 
 
286 aa  169  4e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2998  HemK family modification methylase  40.64 
 
 
288 aa  169  4e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.29427  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1799  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.6 
 
 
283 aa  169  6e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.207374  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3803  modification methylase, HemK family  40.57 
 
 
285 aa  169  6e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0942  HemK family modification methylase  39.25 
 
 
278 aa  169  6e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.452604 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0825  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  41.22 
 
 
306 aa  169  7e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.274264 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01251  hypothetical protein  38.93 
 
 
285 aa  168  8e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3708  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  39.93 
 
 
285 aa  168  8e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.432001  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2565  hemK family protein  41.47 
 
 
285 aa  168  8e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.264482  normal  0.189465 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0481  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  43.24 
 
 
280 aa  168  9e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.589534 
 
 
-
 
NC_004310  BR1868  hemK protein  38.24 
 
 
283 aa  167  2e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2359  HemK family modification methylase  41.42 
 
 
285 aa  167  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14250  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.5 
 
 
314 aa  167  2e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.537265  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2931  hemK protein  43.02 
 
 
285 aa  167  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2336  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  42.53 
 
 
276 aa  166  2.9999999999999998e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2985  HemK family modification methylase  37.02 
 
 
297 aa  166  4e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2596  HemK family modification methylase  43.02 
 
 
280 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.944902  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0509  HemK family modification methylase  43.02 
 
 
280 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0843228  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2722  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40 
 
 
283 aa  166  5e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3974  modification methylase, HemK family  36.88 
 
 
307 aa  166  5e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0065  modification methylase, HemK family  37.67 
 
 
289 aa  165  5.9999999999999996e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787039  hitchhiker  0.00284292 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2082  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.66 
 
 
300 aa  165  6.9999999999999995e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000794612  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0413  HemK family modification methylase  43.02 
 
 
280 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0469  HemK family modification methylase  41.16 
 
 
317 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.667677  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2713  HemK family modification methylase  41.38 
 
 
274 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1912  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  41 
 
 
277 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0850  HemK family modification methylase  45.35 
 
 
280 aa  163  2.0000000000000002e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1548  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  41 
 
 
277 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.299317 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1906  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  41 
 
 
277 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0613255  normal  0.396695 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4832  modification methylase, HemK family  38.97 
 
 
285 aa  163  3e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000233725  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2448  modification methylase, HemK family  32.6 
 
 
361 aa  163  3e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1555  HemK family modification methylase  43.77 
 
 
294 aa  162  4.0000000000000004e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00502304 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0113  modification methylase, HemK family  38.75 
 
 
299 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1970  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  41 
 
 
277 aa  161  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.017955  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2800  modification methylase, HemK family  44.02 
 
 
300 aa  161  9e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.668211 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0439  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  42.26 
 
 
280 aa  161  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.490288 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0999  HemK family modification methylase  43.35 
 
 
281 aa  161  1e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3596  modification methylase HemK  42.47 
 
 
280 aa  161  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.900559 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2459  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  39.46 
 
 
276 aa  161  1e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.106531  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0611  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.87 
 
 
289 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0680432  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1364  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  40.61 
 
 
277 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000140112  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0503  hemK protein  43.41 
 
 
285 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0973  methyltransferase, HemK family protein  43.41 
 
 
285 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.199925  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0677  methyltransferase, HemK family protein  43.41 
 
 
285 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1944  protein hemK  43.41 
 
 
285 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3046  modification methylase HemK  40.43 
 
 
289 aa  160  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2178  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  38.78 
 
 
276 aa  160  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.255664  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1755  hemK protein  37.59 
 
 
286 aa  159  4e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000114264  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0765  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  42.25 
 
 
275 aa  159  6e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.267052  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2065  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  38.4 
 
 
276 aa  158  9e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000395373  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2285  hypothetical protein  35.61 
 
 
287 aa  158  9e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3148  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  43.63 
 
 
300 aa  158  9e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.709497  normal  0.0196478 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3591  putative protein hemK  43.02 
 
 
285 aa  158  9e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.334574  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0895  HemK family modification methylase  39.01 
 
 
275 aa  158  9e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.272533  normal  0.496142 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>