294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3465 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3465  preprotein translocase, YajC subunit  100 
 
 		 114 aa  232  1.0000000000000001e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.113386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2526  preprotein translocase subunit YajC  48.42 
 
 		 109 aa  87  7e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0689  preprotein translocase subunit YajC  47.31 
 
 		 107 aa  86.3  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.367207  normal  0.660097 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3809  preprotein translocase subunit YajC  47.31 
 
 		 107 aa  86.3  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1662  protein translocase subunit yajC  42.31 
 
 		 109 aa  86.7  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000198451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2665  preprotein translocase subunit YajC  47.31 
 
 		 107 aa  86.7  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.423387 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0237  preprotein translocase subunit YajC  47.31 
 
 		 107 aa  86.3  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0611  preprotein translocase subunit YajC  47.31 
 
 		 107 aa  86.3  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0721  preprotein translocase subunit YajC  47.31 
 
 		 107 aa  86.3  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0636  preprotein translocase subunit YajC  47.31 
 
 		 107 aa  86.3  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3329  preprotein translocase subunit YajC  48.24 
 
 		 108 aa  84.3  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.211385  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2386  preprotein translocase subunit YajC  48.24 
 
 		 108 aa  84.3  5e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3363  preprotein translocase subunit YajC  48.24 
 
 		 108 aa  84.3  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3372  preprotein translocase subunit YajC  48.24 
 
 		 108 aa  84.3  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1164  preprotein translocase subunit YajC  48.24 
 
 		 108 aa  84.3  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2572  preprotein translocase subunit YajC  48.24 
 
 		 108 aa  84.3  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.933871  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0302  preprotein translocase subunit YajC  48.24 
 
 		 108 aa  84.3  5e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1667  preprotein translocase, YajC subunit  45.35 
 
 		 93 aa  84.3  5e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0070914  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1277  preprotein translocase subunit YajC  47.06 
 
 		 108 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3991  preprotein translocase subunit YajC  46.32 
 
 		 120 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340437  normal  0.209525 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0700  preprotein translocase subunit YajC  46.32 
 
 		 109 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0542  preprotein translocase, YajC subunit  45.78 
 
 		 133 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0292946 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1616  preprotein translocase subunit YajC  44.19 
 
 		 114 aa  82.8  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0558559  normal  0.288697 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00524  preprotein translocase subunit YajC  50.67 
 
 		 117 aa  82  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2055  preprotein translocase, YajC subunit  41.67 
 
 		 102 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.34976  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0995  protein translocase subunit yajC  42.7 
 
 		 94 aa  80.9  0.000000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0682  preprotein translocase, YajC subunit  42.55 
 
 		 137 aa  80.5  0.000000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0157  hypothetical protein  38.14 
 
 		 118 aa  80.5  0.000000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1860  preprotein translocase subunit  48.84 
 
 		 105 aa  79.7  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.529455  normal  0.676503 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1115  preprotein translocase, YajC subunit  45.74 
 
 		 120 aa  80.1  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.242644  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1274  preprotein translocase, YajC subunit  41.38 
 
 		 95 aa  79.3  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0845  preprotein translocase, YajC subunit  39.36 
 
 		 143 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000092041  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2714  preprotein translocase subunit YajC  47.5 
 
 		 109 aa  78.2  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.191333 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2112  preprotein translocase, YajC subunit  39 
 
 		 117 aa  78.2  0.00000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000210725  normal  0.92109 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1417  preprotein translocase, YajC subunit  42.35 
 
 		 110 aa  78.2  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.718681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1906  preprotein translocase, YajC subunit  39.58 
 
 		 116 aa  78.2  0.00000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1173  preprotein translocase, YajC subunit  44.23 
 
 		 110 aa  78.2  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441411  normal  0.139659 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2548  preprotein translocase subunit YajC  47.5 
 
 		 110 aa  77.8  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0861289 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2834  protein translocase subunit yajC  39.8 
 
 		 109 aa  77.8  0.00000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2958  preprotein translocase subunit YajC  47.5 
 
 		 110 aa  77.8  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1797  protein translocase subunit yajC  43.82 
 
 		 108 aa  77  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.188227  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0443  preprotein translocase, YajC subunit  43.82 
 
 		 108 aa  77  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0153138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1790  preprotein translocase, YajC subunit  45 
 
 		 108 aa  76.3  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.645433  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1893  preprotein translocase, YajC subunit  38.04 
 
 		 103 aa  76.3  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.49225e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0806  preprotein translocase, YajC subunit  38.1 
 
 		 103 aa  76.6  0.0000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0248725  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1340  preprotein translocase, YajC subunit  42.5 
 
 		 121 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.497494  normal  0.750332 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0391  preprotein translocase, YajC subunit  42.86 
 
 		 121 aa  75.9  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000430502  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2348  preprotein translocase, YajC subunit  37.27 
 
 		 118 aa  75.5  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2854  preprotein translocase, YajC subunit  44.58 
 
 		 114 aa  76.3  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.134392 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1507  preprotein translocase, YajC subunit  45 
 
 		 108 aa  75.9  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1799  preprotein translocase, YajC subunit  39.76 
 
 		 107 aa  75.9  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.675653  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0485  preprotein translocase, YajC subunit  40 
 
 		 112 aa  75.5  0.0000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0108  hypothetical protein  37.37 
 
 		 118 aa  74.7  0.0000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1339  preprotein translocase, YajC subunit  43.24 
 
 		 129 aa  75.1  0.0000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1717  preprotein translocase, YajC subunit  37.36 
 
 		 106 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.51746  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0343  preprotein translocase, YajC subunit  39.08 
 
 		 127 aa  75.5  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.23698 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1811  preprotein translocase, YajC subunit  37.11 
 
 		 111 aa  74.7  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.690098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1358  preprotein translocase, YajC subunit  45.07 
 
 		 90 aa  74.7  0.0000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00135815  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0192  preprotein translocase subunit YajC  39.22 
 
 		 120 aa  74.7  0.0000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0168  preprotein translocase subunit YajC  39.22 
 
 		 120 aa  74.7  0.0000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1304  preprotein translocase, YajC subunit  47.5 
 
 		 109 aa  73.9  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2298  preprotein translocase, YajC subunit  38 
 
 		 118 aa  73.9  0.0000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000341875  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0455  preprotein translocase, YajC subunit  42.05 
 
 		 109 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0666222  normal  0.0413698 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2945  preprotein translocase subunit YajC  43.75 
 
 		 108 aa  73.9  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1817  protein translocase subunit yajC  36.96 
 
 		 119 aa  73.6  0.0000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0910437  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0839  preprotein translocase, YajC subunit  40.26 
 
 		 111 aa  73.6  0.0000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1765  protein translocase subunit yajC  39.22 
 
 		 143 aa  73.2  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.242653  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3096  preprotein translocase, YajC subunit  36.67 
 
 		 111 aa  72.8  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0763389  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1698  preprotein translocase, YajC subunit  40.86 
 
 		 123 aa  72  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2010  preprotein translocase, YajC subunit  43.9 
 
 		 107 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.798178  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1062  preprotein translocase subunit YajC  37.37 
 
 		 110 aa  72.4  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.9983  hitchhiker  0.00140347 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0276  protein translocase subunit yajC  37.93 
 
 		 108 aa  72.4  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.865381  normal  0.0326765 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1292  preprotein translocase, YajC subunit  39.78 
 
 		 116 aa  72  0.000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  5.005270000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1801  preprotein translocase, YajC subunit  34.65 
 
 		 112 aa  72.4  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0543558  hitchhiker  0.0000220066 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1383  preprotein translocase subunit YajC  39.58 
 
 		 110 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000313492  hitchhiker  0.00000720992 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1217  protein translocase subunit yajC  37.23 
 
 		 168 aa  72  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.38734 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00355  preprotein translocase subunit YajC  35.35 
 
 		 110 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.324829  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3202  preprotein translocase, YajC subunit  35.35 
 
 		 110 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.463836  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1218  preprotein translocase, YajC subunit  38.89 
 
 		 109 aa  71.6  0.000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000169115  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0487  preprotein translocase subunit YajC  35.35 
 
 		 110 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0477  preprotein translocase subunit YajC  35.35 
 
 		 110 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2809  preprotein translocase subunit YajC  45 
 
 		 108 aa  71.6  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0439  preprotein translocase subunit YajC  35.35 
 
 		 110 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1241  protein translocase subunit  39.78 
 
 		 116 aa  72  0.000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.0000875528  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0437  preprotein translocase subunit YajC  35.35 
 
 		 110 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3226  preprotein translocase subunit YajC  35.35 
 
 		 110 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000105955 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00359  hypothetical protein  35.35 
 
 		 110 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.35742  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4645  protein translocase subunit yajC  36.47 
 
 		 91 aa  71.6  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2458  protein translocase subunit yajC  36.26 
 
 		 117 aa  72  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.107187  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0534  preprotein translocase, YajC subunit  39.77 
 
 		 123 aa  71.6  0.000000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3279  preprotein translocase subunit YajC  46.67 
 
 		 108 aa  71.2  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.198543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4599  preprotein translocase, YajC subunit  38.2 
 
 		 110 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0858963  normal  0.19415 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1083  protein translocase subunit yajC  45.24 
 
 		 93 aa  71.2  0.000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.452709  normal  0.0755092 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4229  preprotein translocase, YajC subunit  38.2 
 
 		 110 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0271  preprotein translocase subunit YajC  38.95 
 
 		 110 aa  71.2  0.000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.253267  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2483  preprotein translocase subunit YajC  36.63 
 
 		 110 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000329003  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3621  preprotein translocase, YajC subunit  43.75 
 
 		 118 aa  71.2  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000152664  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2905  preprotein translocase, YajC subunit  36.67 
 
 		 111 aa  71.2  0.000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.653173  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2806  preprotein translocase subunit YajC  35.64 
 
 		 110 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000242137  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1571  preprotein translocase subunit YajC  35.64 
 
 		 110 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000298712  hitchhiker  0.0000000623922 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>