24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3417 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3417  Mu-like protein prophage protein gp29-like protein  100 
 
 		 545 aa  1103    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.610061  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1912  protein of unknown function DUF935  27.71 
 
 		 511 aa  86.7  9e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.6802 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2136  hypothetical protein  22.34 
 
 		 538 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0667  hypothetical protein  21.57 
 
 		 533 aa  66.6  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2089  hypothetical protein  21.04 
 
 		 528 aa  66.6  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00551419  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3006  hypothetical protein  25.41 
 
 		 517 aa  66.2  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.357056  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1968  hypothetical protein  25.6 
 
 		 523 aa  63.9  0.000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.418273 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1641  hypothetical protein  21.84 
 
 		 523 aa  63.5  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0674  hypothetical protein  26.7 
 
 		 519 aa  63.5  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0763  hypothetical protein  26.7 
 
 		 519 aa  63.5  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3047  hypothetical protein  24.25 
 
 		 517 aa  59.3  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.88762  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2248  hypothetical protein  23.11 
 
 		 584 aa  57.8  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2680  hypothetical protein  23.94 
 
 		 521 aa  57  0.0000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1877  hypothetical protein  21.68 
 
 		 582 aa  52  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3393  protein of unknown function DUF935  24.58 
 
 		 543 aa  51.6  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.219922  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0433  protein of unknown function DUF935  21.84 
 
 		 510 aa  52  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0671  protein of unknown function DUF935  23.11 
 
 		 530 aa  50.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3373  hypothetical protein  23.81 
 
 		 523 aa  49.7  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0250  hypothetical protein  26.95 
 
 		 456 aa  45.8  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2932  hypothetical protein  23.26 
 
 		 496 aa  45.8  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.163033  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3783  hypothetical protein  23.35 
 
 		 537 aa  44.7  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.690842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2101  hypothetical protein  25.37 
 
 		 543 aa  44.3  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0242078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1299  hypothetical protein  25.37 
 
 		 543 aa  44.3  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4502  hypothetical protein  26.35 
 
 		 544 aa  43.9  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.221715 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>