More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3362 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_3362  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 
358 aa  711    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1186  RND family efflux transporter MFP subunit  37.01 
 
 
374 aa  184  3e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.425099  normal  0.0297054 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1815  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.41 
 
 
388 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.100454  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1921  RND family efflux transporter MFP subunit  35.84 
 
 
340 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00271277  normal  0.413551 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3735  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.32 
 
 
362 aa  161  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2132  HlyD family secretion protein  33.66 
 
 
360 aa  158  1e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.732379  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0901  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.39 
 
 
351 aa  158  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.470272  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2939  RND family efflux transporter MFP subunit  33.72 
 
 
352 aa  156  4e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0067677  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2657  cation or acridine efflux membrane fusion protein  31.29 
 
 
357 aa  151  1e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1999  RND family efflux transporter MFP subunit  33.33 
 
 
390 aa  151  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00132105  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1681  RND family efflux transporter MFP subunit  32.29 
 
 
434 aa  148  1.0000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0776882  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3927  RND family efflux transporter MFP subunit  31.53 
 
 
392 aa  147  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1036  RND family efflux transporter MFP subunit  30.22 
 
 
354 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0364  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.35 
 
 
362 aa  145  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.405995  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0779  RND family efflux transporter MFP subunit  32.49 
 
 
415 aa  144  3e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.521132  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0110  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.75 
 
 
360 aa  142  8e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0109  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.75 
 
 
360 aa  142  8e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1209  RND family efflux transporter MFP subunit  31.89 
 
 
381 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.421019  normal  0.31825 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1021  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.94 
 
 
390 aa  141  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0159772  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2282  secretion protein HlyD  32.4 
 
 
467 aa  141  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1145  hypothetical protein  31.17 
 
 
371 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3204  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.15 
 
 
368 aa  141  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0703  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.62 
 
 
355 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0200  secretion protein HlyD  29.78 
 
 
365 aa  139  4.999999999999999e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1969  RND family efflux transporter MFP subunit  33.45 
 
 
418 aa  139  7.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.728278 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0176  RND family efflux transporter MFP subunit  34.54 
 
 
353 aa  137  4e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.371241 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1440  secretion protein HlyD  32.17 
 
 
376 aa  136  6.0000000000000005e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0768  acriflavin resistance periplasmic protein  30.63 
 
 
348 aa  135  8e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.69171  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2243  RND family efflux transporter MFP subunit  32.55 
 
 
376 aa  135  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3700  secretion protein HlyD  30.74 
 
 
381 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1044  RND family efflux transporter MFP subunit  31.02 
 
 
365 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0078  RND family efflux transporter MFP subunit  31.02 
 
 
365 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1201  RND family efflux transporter MFP subunit  31.02 
 
 
365 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0341767  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0383  RND family efflux transporter MFP subunit  31.02 
 
 
365 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0031  RND family efflux transporter MFP subunit  31.02 
 
 
365 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5137  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.69 
 
 
367 aa  133  5e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2781  RND family efflux transporter MFP subunit  31.72 
 
 
372 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00032103  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1851  RND family efflux transporter MFP subunit  32.7 
 
 
361 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000181813  hitchhiker  0.00565244 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1496  RND family efflux transporter MFP subunit  30.66 
 
 
365 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1580  RND family efflux transporter MFP subunit  30.66 
 
 
365 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.610408  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01736  HlyD family secretion protein  30.42 
 
 
349 aa  130  3e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3889  RND family efflux transporter MFP subunit  33.45 
 
 
364 aa  130  3e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1288  RND family efflux transporter MFP subunit  29.93 
 
 
365 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4149  RND family efflux transporter MFP subunit  29.32 
 
 
372 aa  129  6e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.815582  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  30.65 
 
 
361 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000249801  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5576  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.5 
 
 
353 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.110033 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3803  RND family efflux transporter MFP subunit  30.27 
 
 
376 aa  129  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.591559 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1906  HlyD family-like protein  29.97 
 
 
361 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000977353  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1739  RND family efflux transporter MFP subunit  32.89 
 
 
366 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3208  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.65 
 
 
357 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0146448  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2588  RND family efflux transporter MFP subunit  30.2 
 
 
360 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000707575  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3650  secretion protein HlyD  29.74 
 
 
397 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.521212 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1610  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.3 
 
 
372 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0930  RND family efflux transporter MFP subunit  27.81 
 
 
366 aa  128  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2700  secretion protein HlyD  31.97 
 
 
403 aa  127  3e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1636  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.33 
 
 
383 aa  127  3e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.372421  normal  0.934491 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1982  RND family efflux transporter MFP subunit  31.29 
 
 
360 aa  127  3e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000542821  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1439  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.72 
 
 
380 aa  127  4.0000000000000003e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0465471  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1809  secretion protein HlyD  30.07 
 
 
397 aa  126  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2322  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.12 
 
 
371 aa  126  5e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0437768 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2179  RND family efflux transporter MFP subunit  33.33 
 
 
361 aa  126  6e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000248395  normal  0.140593 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1554  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.84 
 
 
363 aa  125  9e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0484603  hitchhiker  0.00000015248 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1879  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.84 
 
 
363 aa  125  9e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0975  RND family efflux transporter MFP subunit  28.99 
 
 
382 aa  125  9e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0109715 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2665  RND family efflux transporter MFP subunit  29.87 
 
 
360 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000267288  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1796  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.87 
 
 
360 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000436323  hitchhiker  0.00000011193 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2550  RND family efflux transporter MFP subunit  29.87 
 
 
360 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000229958  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01922  RND efflux membrane fusion protein  31.23 
 
 
318 aa  124  3e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1881  HlyD family-like protein  28.96 
 
 
360 aa  123  4e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2428  RND family efflux transporter MFP subunit  32.37 
 
 
361 aa  123  5e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00201655  decreased coverage  0.00000151053 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2338  RND family efflux transporter MFP subunit  29.19 
 
 
360 aa  122  6e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00136978  hitchhiker  0.0000141161 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2410  RND family efflux transporter MFP subunit  29.19 
 
 
360 aa  122  6e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000315716  hitchhiker  0.00636413 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4297  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.43 
 
 
397 aa  123  6e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.430357  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2952  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.97 
 
 
374 aa  122  7e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1580  RND family efflux transporter MFP subunit  33.12 
 
 
365 aa  122  7e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.186167  normal  0.460313 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4492  secretion protein HlyD  31.64 
 
 
382 aa  122  7e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0226833 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1658  RND family efflux transporter MFP subunit  29.19 
 
 
360 aa  122  9e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000232607  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0466  RND family efflux transporter MFP subunit  27.69 
 
 
372 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.808341  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0870  acriflavin resistance periplasmic protein  29.55 
 
 
351 aa  121  1.9999999999999998e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0358  RND family efflux transporter MFP subunit  27.7 
 
 
372 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1146  RND family efflux transporter MFP subunit  29.55 
 
 
351 aa  121  1.9999999999999998e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1177  RND family efflux transporter MFP subunit  30.6 
 
 
417 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1194  acriflavin resistance periplasmic protein  29.06 
 
 
380 aa  120  3e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2284  secretion protein HlyD  31.97 
 
 
403 aa  120  3e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.831641  normal  0.154042 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0706  secretion protein HlyD  27.86 
 
 
366 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000331728  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4943  RND efflux membrane fusion protein precursor  31.58 
 
 
375 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1650  secretion protein HlyD  30.03 
 
 
397 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3140  secretion protein HlyD  28.67 
 
 
360 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.203317  normal  0.359518 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2043  RND family efflux transporter MFP subunit  31.62 
 
 
404 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.148074  normal  0.931139 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0767  RND family efflux transporter MFP subunit  31.61 
 
 
372 aa  119  7.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00075698  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2095  secretion protein HlyD  33.88 
 
 
354 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0944  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.88 
 
 
356 aa  118  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0623416  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0907  RND efflux membrane fusion protein-related protein  28.7 
 
 
406 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1119  RND family efflux transporter MFP subunit  29.33 
 
 
369 aa  118  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000371819  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4327  HlyD family secretion protein  28.24 
 
 
372 aa  117  3e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56880  putative membrane fusion protein  31.23 
 
 
376 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0946  RND family efflux transporter MFP subunit  28.99 
 
 
382 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3679  RND family efflux transporter MFP subunit  31.41 
 
 
365 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2439  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.97 
 
 
379 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000851177  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2064  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.41 
 
 
365 aa  116  5e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>