More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3350 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3350  permease  100 
 
 		 816 aa  1625    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.156293  normal  0.62653 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1814  permease  38.77 
 
 		 809 aa  515  1e-144  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736977 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3500  ABC efflux pump, inner membrane subunit  34.67 
 
 		 823 aa  436  1e-121  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0297  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.82 
 
 		 813 aa  419  1e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1368  permease  33.45 
 
 		 814 aa  416  9.999999999999999e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.654458 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3459  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.89 
 
 		 817 aa  418  9.999999999999999e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0129037 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1827  permease  35.36 
 
 		 805 aa  414  1e-114  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.360396  normal  0.426274 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0418  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.37 
 
 		 807 aa  404  1e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0396229 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1894  permease  33.46 
 
 		 802 aa  399  1e-109  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180891 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1875  permease  34.64 
 
 		 796 aa  390  1e-107  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1995  permease  33.5 
 
 		 821 aa  390  1e-107  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.70072  normal  0.177853 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0289  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.29 
 
 		 805 aa  385  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0368  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.02 
 
 		 816 aa  383  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2047  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.45 
 
 		 882 aa  381  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4159  permease  33.94 
 
 		 804 aa  374  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.437191 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3156  permease  34.42 
 
 		 887 aa  370  1e-101  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.76534 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1892  permease  34.35 
 
 		 798 aa  370  1e-101  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.723684  normal  0.478639 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1893  permease  34.06 
 
 		 805 aa  371  1e-101  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.628552  normal  0.326735 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1890  ABC efflux pump, inner membrane subunit  35.23 
 
 		 883 aa  367  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.911566  normal  0.0476843 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1852  permease  32.28 
 
 		 869 aa  363  5.0000000000000005e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.155469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4284  ABC efflux pump, inner membrane subunit  34.72 
 
 		 871 aa  362  1e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1829  permease  32.07 
 
 		 797 aa  362  1e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1898  permease  33.9 
 
 		 808 aa  356  1e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0618  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.45 
 
 		 822 aa  346  1e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1681  permease  33.7 
 
 		 819 aa  345  2e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715398 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3887  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.17 
 
 		 807 aa  343  5e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1855  permease  32.45 
 
 		 865 aa  343  1e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1897  permease  32.59 
 
 		 831 aa  342  2e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0370  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.7 
 
 		 805 aa  338  2.9999999999999997e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.701449 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4528  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.45 
 
 		 809 aa  338  2.9999999999999997e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.697087 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1876  permease  33.29 
 
 		 804 aa  337  5.999999999999999e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0616  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32 
 
 		 862 aa  336  1e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1888  permease  33.65 
 
 		 810 aa  331  3e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.712719 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1828  permease  32.78 
 
 		 803 aa  330  9e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.762234 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3647  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.62 
 
 		 821 aa  329  1.0000000000000001e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.737099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0754  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.23 
 
 		 878 aa  328  2.0000000000000001e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.535392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1896  permease  33.9 
 
 		 810 aa  324  3e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1887  permease  30.45 
 
 		 809 aa  322  9.999999999999999e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.556655  normal  0.69487 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1874  permease  30.76 
 
 		 800 aa  319  1e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.219896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0619  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.4 
 
 		 810 aa  319  1e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0369  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.34 
 
 		 855 aa  318  3e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.476838 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1889  permease  29.82 
 
 		 803 aa  317  8e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1906  permease  34.58 
 
 		 806 aa  316  9e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0371  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.21 
 
 		 805 aa  309  1.0000000000000001e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1933  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.1 
 
 		 805 aa  309  1.0000000000000001e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1883  permease  34.62 
 
 		 808 aa  308  2.0000000000000002e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.142413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1856  permease  31.75 
 
 		 887 aa  307  5.0000000000000004e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4627  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.53 
 
 		 915 aa  305  2.0000000000000002e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.618125 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0984  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.36 
 
 		 817 aa  302  1e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000176456 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3471  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.23 
 
 		 893 aa  301  3e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440617  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1873  permease  30.92 
 
 		 803 aa  298  3e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0341  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.09 
 
 		 874 aa  298  3e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1890  permease  29.62 
 
 		 845 aa  296  2e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.485646 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1878  permease  30.7 
 
 		 817 aa  286  1.0000000000000001e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.159783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0101  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.51 
 
 		 808 aa  285  3.0000000000000004e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.965673 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3041  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.87 
 
 		 844 aa  280  7e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0235871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1869  permease  30.71 
 
 		 811 aa  279  2e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3609  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.17 
 
 		 849 aa  278  3e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.123947 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2120  putative ABC transporter, permease protein  28.54 
 
 		 809 aa  273  1e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.5337  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4395  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.58 
 
 		 879 aa  273  1e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1885  permease  30.94 
 
 		 843 aa  269  1e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.47484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1993  permease  32.05 
 
 		 808 aa  266  1e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.483054  normal  0.18288 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1877  permease  30.61 
 
 		 808 aa  266  1e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0021  permease  33.04 
 
 		 861 aa  266  1e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0686049  normal  0.167334 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1708  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.78 
 
 		 888 aa  261  3e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.232779 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1895  permease  30.7 
 
 		 835 aa  261  5.0000000000000005e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.88407 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0307  peptide ABC transporter permease  27.21 
 
 		 810 aa  259  2e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.341925  normal  0.050461 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3461  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.05 
 
 		 919 aa  256  1.0000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00119144  decreased coverage  0.00373054 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1285  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.98 
 
 		 913 aa  254  4.0000000000000004e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4572  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.91 
 
 		 812 aa  252  2e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.443646  normal  0.637392 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1088  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.72 
 
 		 880 aa  246  9.999999999999999e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0674976 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3591  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.59 
 
 		 820 aa  243  7.999999999999999e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171313  normal  0.56936 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1899  permease  30.63 
 
 		 848 aa  242  2e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0096  protein of unknown function DUF214  25.39 
 
 		 813 aa  234  7.000000000000001e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1886  permease  30.2 
 
 		 844 aa  230  6e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0760  permease  29.5 
 
 		 819 aa  224  4e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.21573  normal  0.423972 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3604  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.47 
 
 		 884 aa  224  4e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.729467  normal  0.137279 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0776  putative permease  26.02 
 
 		 807 aa  221  5e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0081  protein of unknown function DUF214  26.45 
 
 		 810 aa  216  9.999999999999999e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.484332  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2896  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.85 
 
 		 846 aa  207  8e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3350  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.21 
 
 		 828 aa  170  8e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3155  hypothetical protein  27.83 
 
 		 931 aa  163  1e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4417  putative ABC transporter, permease protein  24.28 
 
 		 830 aa  137  7.000000000000001e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.56334  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4594  protein of unknown function DUF214  25.14 
 
 		 813 aa  128  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0140  protein of unknown function DUF214  24.86 
 
 		 816 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0603  protein of unknown function DUF214  24.05 
 
 		 809 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.237353 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2178  protein of unknown function DUF214  25.68 
 
 		 790 aa  117  8.999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.424889 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4849  protein of unknown function DUF214  24.5 
 
 		 802 aa  114  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.011256  normal  0.10572 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5431  protein of unknown function DUF214  27.27 
 
 		 800 aa  113  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.109998 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1651  protein of unknown function DUF214  24.13 
 
 		 800 aa  110  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.9714 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2599  protein of unknown function DUF214  27.29 
 
 		 812 aa  109  3e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0931  protein of unknown function DUF214  24.27 
 
 		 804 aa  106  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0935  protein of unknown function DUF214  23.64 
 
 		 785 aa  105  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0947  protein of unknown function DUF214  24.72 
 
 		 805 aa  105  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5420  protein of unknown function DUF214  22.65 
 
 		 784 aa  104  7e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0066196  normal  0.0691461 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4591  protein of unknown function DUF214  22.51 
 
 		 795 aa  103  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.597016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4642  protein of unknown function DUF214  24.74 
 
 		 801 aa  102  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000162597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2978  protein of unknown function DUF214  23.32 
 
 		 788 aa  103  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.163424 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4619  protein of unknown function DUF214  26.69 
 
 		 817 aa  102  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.231177 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4368  protein of unknown function DUF214  24.09 
 
 		 800 aa  101  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.129517 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>