195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3274 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3274  HAD family hydrolase  100 
 
 		 698 aa  1436    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.258602  normal  0.120543 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2516  glycogen debranching enzyme-like protein  35.78 
 
 		 445 aa  240  5e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1828  glycogen debranching protein  34.56 
 
 		 458 aa  227  7e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1793  hypothetical protein  30.54 
 
 		 391 aa  181  4.999999999999999e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0265229 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3891  hypothetical protein  32.65 
 
 		 394 aa  174  3.9999999999999995e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.106321  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2424  hypothetical protein  30.05 
 
 		 391 aa  174  5.999999999999999e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.481208  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0242  hypothetical protein  30.99 
 
 		 400 aa  167  6.9999999999999995e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1137  hypothetical protein  30.75 
 
 		 444 aa  163  8.000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0252196  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4592  sucrose phosphatase  33.73 
 
 		 252 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.418746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3967  sucrose-phosphate phosphatase subfamily protein  33.6 
 
 		 729 aa  121  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.205238  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2821  sucrose-phosphate phosphatase  30.61 
 
 		 249 aa  120  9e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.498458 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4476  sucrose phosphatase  30.61 
 
 		 249 aa  119  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2312  sucrose-phosphate synthase  33.06 
 
 		 723 aa  116  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.407263 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2470  sucrose phosphatase  28.23 
 
 		 252 aa  108  4e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.536318  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0650  sucrose-phosphate synthase  29.79 
 
 		 735 aa  108  4e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.238518  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2267  sucrose-phosphate phosphatase  33.46 
 
 		 721 aa  107  6e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0311712  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01235  hypothetical protein  25.79 
 
 		 389 aa  107  1e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.276449  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1267  sucrose-phosphate synthase  31.4 
 
 		 714 aa  105  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.327347 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1551  sucrose phosphate synthase  31.4 
 
 		 714 aa  105  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0284  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  31.35 
 
 		 688 aa  104  6e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.533678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0708  sucrose-phosphate synthase  31.5 
 
 		 722 aa  103  9e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3069  HAD family hydrolase  30.71 
 
 		 720 aa  103  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3516  sucrose-phosphate synthase  29.11 
 
 		 716 aa  102  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0808  HAD family hydrolase  29.05 
 
 		 709 aa  100  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2718  HAD family hydrolase  30.74 
 
 		 371 aa  96.3  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2912  sucrose-phosphate synthase  31.67 
 
 		 718 aa  96.3  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0200  HAD family hydrolase  29.88 
 
 		 684 aa  94.4  7e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.70537 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0143  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  29.3 
 
 		 684 aa  94.4  7e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.279801  normal  0.574504 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2610  sucrose-phosphate synthase, glycosyltransferase region  30.24 
 
 		 725 aa  93.6  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1794  sucrose-phosphate synthase  27.67 
 
 		 724 aa  92  3e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.399032  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3683  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  29.92 
 
 		 762 aa  92.4  3e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34680  glucosylglycerol-phosphate synthase  30.08 
 
 		 750 aa  90.5  8e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.966141  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1623  putative sucrose-6F-phosphate phosphohydrolase  24.05 
 
 		 247 aa  88.2  5e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.0026077  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2627  alpha,alpha-trehalose-phosphate synthase  31.5 
 
 		 278 aa  83.6  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.371782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3515  HAD family hydrolase  26.72 
 
 		 277 aa  78.6  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3120  glucosylglycerol-phosphate synthase  29.8 
 
 		 752 aa  79  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.361992  normal  0.0244373 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2689  sucrose-phosphate synthase  26.83 
 
 		 707 aa  77  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.288748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3831  sucrose-6F-phosphate phosphohydrolase  29.34 
 
 		 259 aa  75.5  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.678629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28910  predicted protein  27.17 
 
 		 313 aa  75.1  0.000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0458788  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0228  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  28.57 
 
 		 293 aa  73.9  0.000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.103806  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1537  hypothetical protein  32 
 
 		 390 aa  73.9  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.522426  normal  0.175013 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0609  neutral invertase  25.39 
 
 		 483 aa  68.6  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00065977  normal  0.697444 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4707  neutral invertase  25 
 
 		 482 aa  66.2  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2913  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  24.91 
 
 		 277 aa  65.1  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1322  sucrose-phosphate synthase  24.51 
 
 		 708 aa  65.1  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.435001  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1795  HAD family hydrolase  23.97 
 
 		 276 aa  64.3  0.000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000232683  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1228  Cof protein  25.52 
 
 		 266 aa  62  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0913  Cof-like hydrolase  26.09 
 
 		 272 aa  62  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21951  sucrose phosphate synthase  24.11 
 
 		 702 aa  61.6  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.269726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03531  putative neutral invertase-like protein  22.25 
 
 		 479 aa  59.3  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2774  neutral invertase  23.61 
 
 		 457 aa  58.5  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2589  glycogen debranching enzyme, putative  24.08 
 
 		 712 aa  57.8  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1509  HAD superfamily hydrolase  43.75 
 
 		 271 aa  57.4  0.0000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2315  sucrose-phosphate synthase  25.68 
 
 		 709 aa  57  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3893  Cof-like hydrolase  26.52 
 
 		 261 aa  56.6  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.805334  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0900  HAD superfamily hydrolase  46.55 
 
 		 268 aa  55.5  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3974  HAD family hydrolase  26.14 
 
 		 261 aa  55.5  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4285  HAD family hydrolase  26.14 
 
 		 261 aa  55.5  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.43423  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2313  neutral invertase  31.52 
 
 		 465 aa  55.8  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.314535 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0707  neutral invertase  30.54 
 
 		 474 aa  55.1  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.3299  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03511  putative neutral invertase-like protein  22.03 
 
 		 479 aa  55.5  0.000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.268956  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1016  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  33.06 
 
 		 300 aa  55.1  0.000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.650618  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4133  HAD family hydrolase  25.84 
 
 		 261 aa  53.5  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3804  HAD-superfamily hydrolase  26.14 
 
 		 261 aa  53.9  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4084  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  26.14 
 
 		 267 aa  53.5  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000119194 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1104  Cof-like hydrolase  25.51 
 
 		 274 aa  53.9  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000254312 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3819  HAD-superfamily hydrolase  25.76 
 
 		 261 aa  53.1  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.126763  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0397  putative neutral invertase  23.49 
 
 		 463 aa  52.8  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2983  Cof-like hydrolase  25.5 
 
 		 273 aa  53.1  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.767906  hitchhiker  0.000000295074 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2123  Cof-like hydrolase  27.42 
 
 		 266 aa  52.4  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000204309  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0376  glycogen debranching protein  24.25 
 
 		 834 aa  51.6  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.603461 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4195  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  25.47 
 
 		 267 aa  51.6  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0996454  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1965  SPP-like hydrolase  28.69 
 
 		 230 aa  51.6  0.00005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0481119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0254  glycogen debranching enzyme, putative  23.8 
 
 		 610 aa  51.2  0.00006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.735444  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1143  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  22.89 
 
 		 732 aa  51.2  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0995661 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1302  Cof-like hydrolase  31.13 
 
 		 274 aa  50.8  0.00007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.241456  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3074  Cof-like hydrolase  41.18 
 
 		 306 aa  50.8  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3163  Cof-like hydrolase  31.4 
 
 		 272 aa  50.1  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2588  Cof protein  39.33 
 
 		 269 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20027 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2291  HAD family hydrolase  26.94 
 
 		 264 aa  50.4  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0714407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2762  Cof-like hydrolase  25.67 
 
 		 261 aa  50.1  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0506  hypothetical protein  26.02 
 
 		 272 aa  49.3  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.670453  normal  0.663931 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0012  sugar phosphatase  33.33 
 
 		 271 aa  50.1  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.758679  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0560  hypothetical protein  26.02 
 
 		 272 aa  49.3  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.62907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0333  putative neutral invertase-like protein  21.4 
 
 		 479 aa  49.7  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1478  Amylo-alpha-16-glucosidase  31.39 
 
 		 725 aa  49.7  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4241  hydrolase, Cof family  25.69 
 
 		 244 aa  50.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5196  Amylo-alpha-16-glucosidase  22.67 
 
 		 736 aa  49.7  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0497  protein cof  26.02 
 
 		 272 aa  49.3  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0500  hypothetical protein  26.02 
 
 		 272 aa  49.3  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0005  sugar phosphatase  36.47 
 
 		 269 aa  48.9  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3793  HAD superfamily hydrolase  23.87 
 
 		 268 aa  49.3  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1034  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  22.11 
 
 		 731 aa  48.9  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4173  sugar phosphatase  36.47 
 
 		 269 aa  48.9  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.729204  hitchhiker  0.0085653 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4398  Cof family hydrolase  25.69 
 
 		 244 aa  48.9  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0516  protein cof  25.2 
 
 		 272 aa  49.3  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4165  sugar phosphatase  31.86 
 
 		 281 aa  48.9  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.639249  normal  0.797935 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3424  Cof-like hydrolase  26.28 
 
 		 271 aa  48.5  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.925804  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0725  HAD superfamily hydrolase  35.63 
 
 		 265 aa  48.5  0.0004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0013  sugar phosphatase  36.47 
 
 		 271 aa  48.5  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>