More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3273 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_3273  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 
320 aa  628  1e-179  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.225179  normal  0.109197 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4043  ribokinase-like domain-containing protein  33.45 
 
 
303 aa  169  8e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1904  ribokinase-like domain-containing protein  34.16 
 
 
306 aa  159  5e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0842808  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0562  PfkB domain protein  34.71 
 
 
299 aa  156  5.0000000000000005e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3763  PfkB domain protein  31.71 
 
 
301 aa  155  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00234329  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2838  fructokinase  34.12 
 
 
324 aa  153  4e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.050359  normal  0.34699 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3183  PfkB domain protein  34.15 
 
 
297 aa  150  4e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.208459  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1054  ribokinase family sugar kinase  35.23 
 
 
300 aa  149  6e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.553217  normal  0.355065 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0221  PfkB domain protein  31.58 
 
 
292 aa  147  3e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.349538  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2522  putative fructokinase  38.19 
 
 
300 aa  142  9e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000987488  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0367  ribokinase-like domain-containing protein  28.62 
 
 
296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000567214 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3070  PfkB family of carbohydrate kinase  36.54 
 
 
305 aa  133  3e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1266  PfkB domain protein  36.08 
 
 
303 aa  132  7.999999999999999e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.341209 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1550  carbohydrate kinase, PfkB family  36.08 
 
 
303 aa  132  7.999999999999999e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0205  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  34.26 
 
 
298 aa  127  3e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1998  PfkB domain protein  33.11 
 
 
312 aa  126  4.0000000000000003e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2609  PfkB  35.74 
 
 
311 aa  122  6e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0462  kinase, PfkB family  33.22 
 
 
300 aa  120  1.9999999999999998e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1796  PfkB  33.33 
 
 
293 aa  120  3e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000052274  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1600  PfkB domain protein  33.56 
 
 
305 aa  119  6e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0095  PfkB domain protein  37.93 
 
 
294 aa  118  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0018  PfkB domain protein  25.34 
 
 
300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2911  PfkB domain protein  35.62 
 
 
320 aa  115  8.999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2268  PfkB  33.33 
 
 
296 aa  113  5e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.985563  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4230  PfkB domain protein  34.38 
 
 
302 aa  103  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0033  PfkB domain protein  36.39 
 
 
294 aa  100  3e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.49998  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0649  ribokinase-like domain-containing protein  32.54 
 
 
308 aa  96.3  7e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0225975  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1025  PfkB domain protein  27.87 
 
 
333 aa  83.2  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00743339 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1030  PfkB domain protein  33.1 
 
 
329 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.185699  normal  0.340834 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17670  PfkB-family carbohydrate kinase  31.44 
 
 
323 aa  81.3  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0565403  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0996  PfkB domain protein  28.03 
 
 
333 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  25.34 
 
 
306 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0129  ribokinase-like domain-containing protein  30 
 
 
308 aa  79.3  0.00000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2601  ribokinase-like domain-containing protein  32.59 
 
 
332 aa  78.6  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000338156  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1304  carbohydrate kinase, PfkB  34.53 
 
 
316 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0115  fructokinase  28.17 
 
 
308 aa  77.4  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2652  PfkB domain protein  33.45 
 
 
316 aa  75.5  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2556  PfkB domain protein  33.45 
 
 
316 aa  75.1  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0308577  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0112  fructokinase  27.82 
 
 
308 aa  74.3  0.000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0686594  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2946  ribokinase-like domain-containing protein  31.68 
 
 
306 aa  72.4  0.000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.014237  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2919  PfkB  29.83 
 
 
325 aa  71.6  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000103669  normal  0.041423 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1494  fructokinase, putative  26.42 
 
 
319 aa  71.6  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.215965  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1154  ribokinase-like domain-containing protein  23.9 
 
 
319 aa  71.6  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0836  PfkB  27.6 
 
 
306 aa  70.9  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.408369  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0266  PfkB domain protein  27.24 
 
 
324 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2461  ribokinase-like domain-containing protein  32.88 
 
 
316 aa  70.1  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281644  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2239  ribokinase-like domain-containing protein  32.38 
 
 
306 aa  68.9  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4740  ribokinase-like domain-containing protein  30.83 
 
 
317 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2029  PfkB domain-containing protein  27.69 
 
 
323 aa  68.6  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.159361  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18371  putative carbohydrate kinase  25 
 
 
332 aa  68.6  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.455738  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  27.42 
 
 
323 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2797  carbohydrate kinase  32.6 
 
 
308 aa  67.8  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.409466 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0744  PfkB domain protein  32.13 
 
 
311 aa  67.4  0.0000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1088  PfkB domain protein  27.65 
 
 
315 aa  67.4  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332998  normal  0.446333 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0116  fructokinase  27.12 
 
 
324 aa  67.4  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.393597  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3202  PfkB  31.54 
 
 
344 aa  67.4  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00232664  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2113  ribokinase-like domain-containing protein  26.79 
 
 
319 aa  67  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.398904  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2077  ribokinase-like domain-containing protein  26.79 
 
 
319 aa  67  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2019  aminoimidazole riboside kinase  28.62 
 
 
298 aa  66.2  0.0000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0270358  normal  0.162694 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3619  PfkB domain-containing protein  29.3 
 
 
309 aa  66.6  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2734  PfkB  26.07 
 
 
327 aa  66.2  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.228263  normal  0.103091 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0808  fructokinase  26.24 
 
 
313 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01731  putative carbohydrate kinase  29.06 
 
 
346 aa  65.9  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2118  PfkB domain protein  24.24 
 
 
307 aa  65.1  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2220  ribokinase-like domain-containing protein  30.26 
 
 
316 aa  65.1  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.101084 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2919  fructokinase  30.42 
 
 
310 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141756  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0996  PfkB domain protein  29.64 
 
 
298 aa  65.5  0.000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.809854  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0915  fructokinase  25.89 
 
 
313 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2257  putative fructokinase  31.07 
 
 
306 aa  64.7  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2674  PfkB  29.64 
 
 
309 aa  65.1  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.201136  normal  0.321692 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17531  putative carbohydrate kinase  25.69 
 
 
338 aa  64.7  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16610  PfkB-family carbohydrate kinase  26.39 
 
 
323 aa  64.7  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0544  ribokinase-like domain-containing protein  31.18 
 
 
331 aa  64.7  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.76249 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0931  ribokinase-like domain-containing protein  31.07 
 
 
306 aa  64.7  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.63818 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3490  ribokinase-like domain-containing protein  31.85 
 
 
320 aa  64.3  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.32556  normal  0.0478454 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3592  aminoimidazole riboside kinase  27.85 
 
 
304 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000158875 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0716  fructokinase  24.72 
 
 
313 aa  63.9  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0666  fructokinase  24.72 
 
 
313 aa  63.9  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0752  fructokinase  24.72 
 
 
313 aa  63.9  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1904  PfkB  30.43 
 
 
336 aa  63.5  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0331042  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3592  PfkB domain protein  29.37 
 
 
311 aa  63.9  0.000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0720957  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2647  aminoimidazole riboside kinase  27.85 
 
 
304 aa  63.9  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18161  putative carbohydrate kinase  23.99 
 
 
332 aa  63.5  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.409365  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2035  ribokinase-like domain-containing protein  29.71 
 
 
321 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18191  putative carbohydrate kinase  23.97 
 
 
332 aa  62.8  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1118  PfkB domain protein  32.42 
 
 
316 aa  63.2  0.000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.59245  normal  0.875512 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3260  ribokinase-like domain-containing protein  31.2 
 
 
320 aa  62.8  0.000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.846286 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4360  PfkB  30.53 
 
 
317 aa  62.8  0.000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.493573  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34340  fructokinase  30.8 
 
 
310 aa  62.8  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00034201  normal  0.472957 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4446  ribokinase-like domain-containing protein  30.53 
 
 
317 aa  62.8  0.000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0570373 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1891  ribokinase-like domain-containing protein  29.76 
 
 
313 aa  62.4  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370401  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0530  fructokinase  30.08 
 
 
308 aa  62  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.955105  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3350  hypothetical protein  30.96 
 
 
315 aa  62  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.373497 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0053  ribokinase-like domain-containing protein  27.65 
 
 
317 aa  62  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0954  PfkB domain protein  24.66 
 
 
321 aa  62.4  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.102628  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0971  aminoimidazole riboside kinase  26.47 
 
 
308 aa  62.4  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00309121  normal  0.0346902 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01230  fructokinase  22.41 
 
 
311 aa  61.2  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.826599  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0135  PfkB domain protein  29 
 
 
308 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.472286 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0223  PfkB domain protein  28.73 
 
 
317 aa  61.6  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3887  PfkB domain-containing protein  30.51 
 
 
314 aa  61.6  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.316925  normal  0.428898 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>