More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3163 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_3151  beta-lactamase  57.03 
 
 
933 aa  889    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3163  beta-lactamase  100 
 
 
862 aa  1729    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111664  normal  0.813914 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0651  hypothetical protein  57.19 
 
 
462 aa  364  4e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.168362  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1393  immunoglobulin I-set domain-containing protein  51.34 
 
 
810 aa  307  5.0000000000000004e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1253  peptidase C10 streptopain  50.3 
 
 
884 aa  297  6e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.662646 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0327  Alpha-N-arabinofuranosidase  46.2 
 
 
1221 aa  293  1e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.495752  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0313  immunoglobulin I-set domain-containing protein  43.72 
 
 
887 aa  292  2e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.488254  normal  0.343901 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0797  immunoglobulin I-set domain-containing protein  47.89 
 
 
826 aa  292  2e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.431236  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  51.14 
 
 
1383 aa  291  4e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1394  immunoglobulin I-set domain-containing protein  51.75 
 
 
1126 aa  289  1e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  48.87 
 
 
1848 aa  288  2e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4612  immunoglobulin I-set domain-containing protein  47.37 
 
 
714 aa  288  2.9999999999999996e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.830673  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  48.69 
 
 
1026 aa  286  1.0000000000000001e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2120  fibronectin type III domain-containing protein  47.79 
 
 
1178 aa  286  2.0000000000000002e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.348152  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0854  immunoglobulin I-set domain-containing protein  48.25 
 
 
1607 aa  278  4e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4251  Ig family protein  48.23 
 
 
2802 aa  276  9e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.676511 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  46.27 
 
 
1130 aa  276  1.0000000000000001e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2256  immunoglobulin I-set domain-containing protein  46.57 
 
 
1183 aa  273  7e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0104124 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1618  immunoglobulin I-set domain-containing protein  44.51 
 
 
540 aa  273  9e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.490097  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2184  immunoglobulin I-set domain-containing protein  47.18 
 
 
1507 aa  273  9e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2042  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  50.16 
 
 
805 aa  271  2.9999999999999997e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.218324 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4126  hypothetical protein  45.78 
 
 
640 aa  271  4e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.657356  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3237  glycoside hydrolase family protein  48.05 
 
 
1195 aa  270  1e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.414155 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4610  glycoside hydrolase family protein  43.06 
 
 
721 aa  267  8e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0031  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  43.73 
 
 
701 aa  266  1e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0166776 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  44.14 
 
 
1292 aa  263  1e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4617  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  46.71 
 
 
633 aa  259  1e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3660  peptidase S41  43.48 
 
 
791 aa  255  3e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.120532  normal  0.922939 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4304  hypothetical protein  42.62 
 
 
920 aa  254  6e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.126578  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4616  immunoglobulin I-set domain-containing protein  42.27 
 
 
408 aa  254  7e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0852  immunoglobulin I-set domain-containing protein  49 
 
 
1176 aa  245  1.9999999999999999e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0853  hypothetical protein  41.6 
 
 
1176 aa  240  6.999999999999999e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0561524  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0638  PKD domain-containing protein  46.81 
 
 
1285 aa  237  9e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3823  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  44.64 
 
 
1255 aa  232  2e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0816549  normal  0.385041 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3371  GDSL family lipase  48.48 
 
 
648 aa  232  3e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.754827  normal  0.777259 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0032  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  39.44 
 
 
664 aa  216  9.999999999999999e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.468114  decreased coverage  0.00512066 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0346  hypothetical protein  46.44 
 
 
288 aa  206  1e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0312  hypothetical protein  41.24 
 
 
3563 aa  199  2.0000000000000003e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.61904 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2213  beta-lactamase  36.24 
 
 
380 aa  188  3e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5620  beta-lactamase  33.25 
 
 
417 aa  176  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.141617  normal  0.875115 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6028  beta-lactamase  32.71 
 
 
438 aa  160  7e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.198472  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3963  hypothetical protein  45.83 
 
 
1083 aa  156  1e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4797  beta-lactamase  29.35 
 
 
440 aa  118  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  33.5 
 
 
578 aa  110  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  34.33 
 
 
487 aa  110  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6294  beta-lactamase  32.67 
 
 
394 aa  104  8e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8721  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  31.1 
 
 
480 aa  100  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  25.35 
 
 
446 aa  100  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6025  beta-lactamase  30.18 
 
 
460 aa  99.8  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.565651 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.97 
 
 
442 aa  98.6  5e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3615  beta-lactamase  38.74 
 
 
611 aa  97.8  8e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0663146 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3030  alkaline D-peptidase  28.93 
 
 
388 aa  97.4  9e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1311  beta-lactamase  24.8 
 
 
669 aa  97.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5443  putative beta-lactamase  26.05 
 
 
364 aa  96.3  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.65256  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  28.77 
 
 
377 aa  96.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5618  beta-lactamase  30.06 
 
 
456 aa  95.9  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357665  normal  0.013094 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3422  beta-lactamase  30.14 
 
 
593 aa  95.9  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.126074  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2638  beta-lactamase  29.08 
 
 
445 aa  95.9  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2819  alkaline D-peptidase  32.97 
 
 
388 aa  95.5  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118082  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2769  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  32.97 
 
 
389 aa  95.5  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.48212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3033  alkaline d-peptidase  32.97 
 
 
388 aa  95.5  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.400662  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2217  alkaline D-peptidase  28.62 
 
 
388 aa  95.5  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  3.66047e-16 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3731  beta-lactamase  37.77 
 
 
603 aa  95.5  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.227339 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34700  putative beta lactamase  32.26 
 
 
391 aa  95.1  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00182422  normal  0.248771 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3027  alkaline D-peptidase  32.97 
 
 
388 aa  94.7  6e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  30 
 
 
453 aa  94.7  6e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2755  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  33.33 
 
 
388 aa  94.7  7e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0494186  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1905  beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins  30.15 
 
 
389 aa  94.7  7e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.0068252  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2294  penicillin-binding protein, putative  25.26 
 
 
434 aa  94.4  8e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.272122  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3064  alkaline D-peptidase  32.97 
 
 
388 aa  94.4  9e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0312865  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2579  penicillin-binding protein, putative  25.94 
 
 
483 aa  92.8  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0220569  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.51 
 
 
392 aa  93.2  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4689  beta-lactamase  33.01 
 
 
374 aa  92.8  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0791767  normal  0.116144 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0294  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  32.28 
 
 
834 aa  92.8  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00108534  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2576  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  28.71 
 
 
389 aa  93.2  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.145811 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1357  beta-lactamase  29.13 
 
 
378 aa  93.2  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2152  beta-lactamase  30.34 
 
 
409 aa  92.8  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.129133 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2824  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  32.97 
 
 
388 aa  93.2  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.130693  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3069  alkaline D-peptidase  32.24 
 
 
388 aa  92  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0417304  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3018  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.76 
 
 
389 aa  92  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.470862  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  28.3 
 
 
477 aa  92  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  34.47 
 
 
356 aa  91.7  5e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2400  penicillin-binding protein  31.09 
 
 
481 aa  91.3  6e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443561  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2575  penicillin-binding protein  31.09 
 
 
481 aa  91.3  6e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3702  beta-lactamase  28.9 
 
 
430 aa  91.7  6e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2587  putative penicillin-binding protein  31.09 
 
 
463 aa  91.3  7e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35213e-17 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  28.97 
 
 
559 aa  90.9  8e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4262  beta-lactamase  31.42 
 
 
695 aa  90.5  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2968  beta-lactamase  30.1 
 
 
462 aa  90.5  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2316  penicillin-binding protein  31.61 
 
 
481 aa  90.1  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181197  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2778  beta-lactamase  26.36 
 
 
380 aa  89.4  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.701087  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0814  beta-lactamase  28.48 
 
 
422 aa  90.1  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2468  beta-lactamase  24.37 
 
 
498 aa  89.7  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00176956  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2516  beta-lactamase  24.37 
 
 
498 aa  89.7  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000422279  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2353  penicillin-binding protein  30.57 
 
 
481 aa  89.4  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000218323  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2415  beta-lactamase  28.35 
 
 
442 aa  89  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0834226  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2051  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  26 
 
 
385 aa  89.4  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.319079  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3032  beta-lactamase  28.24 
 
 
507 aa  88.6  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.436003 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1783  cyclic peptide transporter  26.42 
 
 
1055 aa  88.6  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2544  putative penicillin-binding protein  31.61 
 
 
483 aa  88.6  5e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>