More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3156 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_3156  permease  100 
 
 
887 aa  1747    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.76534 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1814  permease  36.23 
 
 
809 aa  416  1e-114  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.736977 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1852  permease  35.24 
 
 
869 aa  415  1e-114  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.155469  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1368  permease  34.47 
 
 
814 aa  394  1e-108  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.654458 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3887  ABC efflux pump, inner membrane subunit  35.11 
 
 
807 aa  389  1e-107  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0368  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.8 
 
 
816 aa  378  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1894  permease  34.47 
 
 
802 aa  376  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.180891 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0418  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.54 
 
 
807 aa  371  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0396229 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0616  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.55 
 
 
862 aa  371  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2047  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.38 
 
 
882 aa  372  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4528  ABC efflux pump, inner membrane subunit  34.3 
 
 
809 aa  369  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.697087 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4284  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.89 
 
 
871 aa  365  2e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3350  permease  34.46 
 
 
816 aa  363  9e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.156293  normal  0.62653 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0289  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.33 
 
 
805 aa  358  1.9999999999999998e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1890  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.66 
 
 
883 aa  356  8.999999999999999e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.911566  normal  0.0476843 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3500  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.21 
 
 
823 aa  355  2e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3155  hypothetical protein  35.57 
 
 
931 aa  355  2e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1855  permease  33 
 
 
865 aa  352  2e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0754  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.37 
 
 
878 aa  352  2e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.535392  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1995  permease  32.61 
 
 
821 aa  348  3e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.70072  normal  0.177853 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4159  permease  33.33 
 
 
804 aa  346  1e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.437191 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1893  permease  34.13 
 
 
805 aa  342  2e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.628552  normal  0.326735 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0297  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.61 
 
 
813 aa  339  9.999999999999999e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3459  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.7 
 
 
817 aa  338  2.9999999999999997e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0129037 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1933  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.15 
 
 
805 aa  337  7e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3471  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.04 
 
 
893 aa  336  1e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440617  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1856  permease  32 
 
 
887 aa  333  8e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1875  permease  33.25 
 
 
796 aa  331  4e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1897  permease  33.41 
 
 
831 aa  328  3e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4627  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.45 
 
 
915 aa  327  5e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.618125 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1828  permease  35.21 
 
 
803 aa  326  9e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.762234 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3461  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.24 
 
 
919 aa  325  3e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00119144  decreased coverage  0.00373054 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0618  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.73 
 
 
822 aa  320  1e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1829  permease  30.68 
 
 
797 aa  318  2e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1874  permease  34.3 
 
 
800 aa  317  4e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.219896  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1892  permease  30.92 
 
 
798 aa  313  5.999999999999999e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.723684  normal  0.478639 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0369  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.32 
 
 
855 aa  312  2e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.476838 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1887  permease  31.3 
 
 
809 aa  312  2e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.556655  normal  0.69487 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1993  permease  34.36 
 
 
808 aa  311  5e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.483054  normal  0.18288 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1285  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.83 
 
 
913 aa  306  9.000000000000001e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1876  permease  31.45 
 
 
804 aa  306  1.0000000000000001e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1827  permease  31.33 
 
 
805 aa  305  2.0000000000000002e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.360396  normal  0.426274 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1888  permease  31 
 
 
810 aa  305  3.0000000000000004e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.712719 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0101  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.35 
 
 
808 aa  301  2e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.965673 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1890  permease  30.95 
 
 
845 aa  301  3e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.485646 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3647  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.04 
 
 
821 aa  296  1e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.737099  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1869  permease  33.1 
 
 
811 aa  296  1e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1898  permease  31.64 
 
 
808 aa  295  2e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1896  permease  33.41 
 
 
810 aa  293  1e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1708  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.11 
 
 
888 aa  291  3e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.232779 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1885  permease  33.14 
 
 
843 aa  291  4e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.47484  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1883  permease  32.26 
 
 
808 aa  289  1e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.142413  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0619  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.6 
 
 
810 aa  287  5.999999999999999e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1906  permease  33.25 
 
 
806 aa  286  1.0000000000000001e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3609  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.91 
 
 
849 aa  280  7e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.123947 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3604  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.13 
 
 
884 aa  279  2e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.729467  normal  0.137279 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0341  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.17 
 
 
874 aa  276  9e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4395  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31 
 
 
879 aa  275  2.0000000000000002e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3041  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.63 
 
 
844 aa  275  3e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0235871  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1889  permease  30.46 
 
 
803 aa  269  2e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2896  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.23 
 
 
846 aa  269  2e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4572  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.57 
 
 
812 aa  268  2.9999999999999995e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.443646  normal  0.637392 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0371  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.8 
 
 
805 aa  268  4e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1681  permease  31.68 
 
 
819 aa  268  4e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.715398 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1878  permease  30.31 
 
 
817 aa  268  4e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.159783  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1088  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.43 
 
 
880 aa  266  1e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0674976 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0370  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.6 
 
 
805 aa  265  2e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.701449 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0984  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.27 
 
 
817 aa  262  3e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  unclonable  0.0000176456 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1895  permease  31.7 
 
 
835 aa  258  4e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.88407 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1873  permease  29.6 
 
 
803 aa  257  8e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3591  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.57 
 
 
820 aa  256  1.0000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171313  normal  0.56936 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1899  permease  31.71 
 
 
848 aa  238  5.0000000000000005e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1877  permease  30.42 
 
 
808 aa  231  4e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0021  permease  31.29 
 
 
861 aa  231  7e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0686049  normal  0.167334 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1886  permease  29.19 
 
 
844 aa  219  1e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0096  protein of unknown function DUF214  25.35 
 
 
813 aa  215  2.9999999999999995e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0307  peptide ABC transporter permease  25.62 
 
 
810 aa  204  5e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.341925  normal  0.050461 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0776  putative permease  24.91 
 
 
807 aa  199  2.0000000000000003e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0081  protein of unknown function DUF214  26.09 
 
 
810 aa  197  1e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.484332  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2120  putative ABC transporter, permease protein  23.89 
 
 
809 aa  177  9e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.5337  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3350  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.14 
 
 
828 aa  164  7e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0760  permease  35.28 
 
 
819 aa  133  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.21573  normal  0.423972 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5675  protein of unknown function DUF214  26.03 
 
 
789 aa  130  8.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.279033 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0947  protein of unknown function DUF214  23.27 
 
 
805 aa  130  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163703  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0939  protein of unknown function DUF214  23.78 
 
 
770 aa  124  6e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.709248 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4591  protein of unknown function DUF214  23.7 
 
 
795 aa  124  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.597016  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0603  protein of unknown function DUF214  24.68 
 
 
809 aa  123  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.237353 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4624  protein of unknown function DUF214  24.54 
 
 
811 aa  122  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.41173 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0931  protein of unknown function DUF214  24.46 
 
 
804 aa  117  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0140  protein of unknown function DUF214  24.01 
 
 
816 aa  116  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4630  protein of unknown function DUF214  26.82 
 
 
816 aa  115  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0928  protein of unknown function DUF214  24.52 
 
 
800 aa  115  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0936  protein of unknown function DUF214  23.67 
 
 
793 aa  115  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146106  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4628  protein of unknown function DUF214  23.1 
 
 
795 aa  114  6e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2247  protein of unknown function DUF214  22.37 
 
 
805 aa  114  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1120  protein of unknown function DUF214  24.54 
 
 
811 aa  111  7.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00406203  normal  0.905875 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4617  protein of unknown function DUF214  23.28 
 
 
792 aa  110  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.214222 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7257  protein of unknown function DUF214  25.74 
 
 
798 aa  109  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.506744  normal  0.498638 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4593  protein of unknown function DUF214  23.8 
 
 
805 aa  108  6e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2978  protein of unknown function DUF214  21.25 
 
 
788 aa  108  6e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.163424 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>