239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3065 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  100 
 
 		 14944 aa  29740    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2327  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  27.23 
 
 		 12684 aa  1100    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.614505 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2049  hypothetical protein  25.7 
 
 		 14609 aa  205  3.9999999999999996e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2451  Fibronectin type III domain protein  32.16 
 
 		 1219 aa  176  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2680  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  51.19 
 
 		 1206 aa  167  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.117789 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1146  hypothetical protein  33.72 
 
 		 1504 aa  165  6e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0316  PA14  30.23 
 
 		 644 aa  147  9.999999999999999e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.914268  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1799  Fibronectin type III domain protein  29.65 
 
 		 1096 aa  139  5e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3011  LamG domain-containing protein  30.66 
 
 		 4761 aa  130  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0312  hypothetical protein  38.02 
 
 		 3563 aa  130  3e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61904 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2448  PA14 domain protein  32.18 
 
 		 1141 aa  124  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2328  fibronectin, type III domain-containing protein  27.86 
 
 		 675 aa  123  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000140812  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2778  PA14 domain protein  45.65 
 
 		 978 aa  124  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0854  immunoglobulin I-set domain-containing protein  45.98 
 
 		 1607 aa  119  4.0000000000000004e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0638  PKD domain-containing protein  25.97 
 
 		 1285 aa  119  6e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0521  PA14 domain protein  36.5 
 
 		 841 aa  116  3e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.387199  hitchhiker  0.000185661 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1945  fibronectin type III domain-containing protein  27.81 
 
 		 1047 aa  115  5e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.771273  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1092  PA14 domain protein  42.03 
 
 		 613 aa  115  9.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2403  PA14 domain protein  30.73 
 
 		 1172 aa  111  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2184  immunoglobulin I-set domain-containing protein  48.68 
 
 		 1507 aa  108  6e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03856  glucan 1,4-beta-glucosidase  38.73 
 
 		 904 aa  107  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0370  Galactose oxidase  37.2 
 
 		 918 aa  106  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  28.1 
 
 		 1152 aa  103  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2042  glycoside hydrolase family 3 protein  39.84 
 
 		 886 aa  103  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.198368  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3233  hypothetical protein  36.65 
 
 		 4465 aa  99.8  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.226873 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1268  PA14 domain-containing protein  39.02 
 
 		 578 aa  99.8  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.29777 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2327  fibronectin, type III domain-containing protein  32 
 
 		 482 aa  98.2  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00610541  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4791  PA14 domain protein  51.55 
 
 		 2252 aa  97.1  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.45455  normal  0.215304 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0938  hypothetical protein  37.55 
 
 		 1969 aa  94  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2445  fibronectin, type III domain-containing protein  28.4 
 
 		 499 aa  92.8  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.628775  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1687  PA14 domain-containing protein  37.33 
 
 		 584 aa  92.4  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000321103 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  24.93 
 
 		 2096 aa  90.9  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2750  YD repeat protein  29.37 
 
 		 2447 aa  90.9  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0313  immunoglobulin I-set domain-containing protein  50 
 
 		 887 aa  87.8  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.488254  normal  0.343901 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4152  glycoside hydrolase family protein  36.81 
 
 		 831 aa  87.4  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.198899  normal  0.318604 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1540  chitinase  25.23 
 
 		 846 aa  87.4  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.987868  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  41.5 
 
 		 2042 aa  87.8  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3244  Immunoglobulin I-set domain protein  38.27 
 
 		 532 aa  86.7  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000478897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4643  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 		 361 aa  86.7  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000815983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2467  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.6 
 
 		 1064 aa  85.9  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  34.23 
 
 		 1130 aa  85.9  0.00000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5804  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  42.95 
 
 		 1394 aa  85.9  0.00000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.512223  normal  0.443028 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6292  PA14 domain protein  33 
 
 		 1314 aa  85.5  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.237878 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1798  Fibronectin type III domain protein  30.66 
 
 		 827 aa  84.3  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0948  YD repeat protein  33.33 
 
 		 2215 aa  84  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.784395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0496  Immunoglobulin I-set domain protein  51.19 
 
 		 1550 aa  83.6  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179971  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03258  chitinase  27.16 
 
 		 846 aa  81.6  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04803  hypothetical protein  55.56 
 
 		 441 aa  80.1  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.576008  normal  0.151498 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0992  putative Vgr-related protein  37.97 
 
 		 979 aa  80.1  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3982  glycosyl hydrolase family chitinase  30.98 
 
 		 1146 aa  80.1  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0019  PA14 domain protein  43.33 
 
 		 2392 aa  80.1  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000236303 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0757  endochitinase ChiA  22.98 
 
 		 846 aa  77.4  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1618  immunoglobulin I-set domain-containing protein  38.36 
 
 		 540 aa  77.8  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.490097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1217  glycoside hydrolase family 3 protein  30.3 
 
 		 966 aa  77  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000342609  normal  0.287325 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3324  carbohydrate-binding family 6 protein  46.39 
 
 		 972 aa  77  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0749  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.6 
 
 		 587 aa  77  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0852  immunoglobulin I-set domain-containing protein  32.97 
 
 		 1176 aa  77  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  35.98 
 
 		 1292 aa  76.6  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  48.19 
 
 		 1132 aa  75.9  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0284  LVIVD repeat-containing protein  28.98 
 
 		 882 aa  75.1  0.00000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.635237  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1515  glycoside hydrolase family 9  34.43 
 
 		 1100 aa  74.7  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5889  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  36.9 
 
 		 859 aa  75.1  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.622586 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002720  chitinase  26.52 
 
 		 848 aa  74.7  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.548595  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1690  hypothetical protein  32.2 
 
 		 2713 aa  75.1  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2419  Beta-glucosidase  31.58 
 
 		 849 aa  74.3  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.326586  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0431  Pectate lyase/Amb allergen  31.61 
 
 		 527 aa  72.4  0.0000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.471187  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3093  PA14 domain protein  36.73 
 
 		 569 aa  72.4  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  31.3 
 
 		 1293 aa  71.6  0.0000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2223  peptidase-like protein  31.88 
 
 		 343 aa  71.6  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3704  PA14 domain protein  40 
 
 		 2334 aa  71.2  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.205023 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3221  glycoside hydrolase family protein  31.82 
 
 		 995 aa  71.2  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179721 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2157  fibronectin, type III domain-containing protein  34.78 
 
 		 1141 aa  71.6  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.445714  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1621  PA14 domain-containing protein  39.84 
 
 		 654 aa  71.6  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.459309  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1948  hypothetical protein  25.51 
 
 		 713 aa  70.9  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2485  Protein of unknown function DUF1588  30.36 
 
 		 778 aa  70.5  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.474006  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4612  immunoglobulin I-set domain-containing protein  42.27 
 
 		 714 aa  70.5  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.830673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0432  Fibronectin type III domain protein  45.74 
 
 		 340 aa  70.5  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1860  glycoside hydrolase family 18  28.53 
 
 		 1127 aa  70.5  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.686097  hitchhiker  0.0000000988456 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0264  Fibronectin type III domain protein  48.39 
 
 		 480 aa  70.1  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.375315  normal  0.632573 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2366  Htaa domain protein  28.93 
 
 		 1127 aa  69.3  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.527032  normal  0.0458127 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2005  Beta-glucosidase  28.87 
 
 		 882 aa  68.9  0.000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.346494  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2491  glycoside hydrolase family 18  28.53 
 
 		 1127 aa  68.9  0.000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1999  immunoglobulin I-set domain-containing protein  50 
 
 		 1362 aa  68.9  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.354516  normal  0.677634 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3153  Beta-glucosidase  33.58 
 
 		 913 aa  68.6  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.139372  normal  0.15667 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2484  glycoside hydrolase family protein  29.48 
 
 		 1127 aa  68.6  0.000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.1184  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0241  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  23.06 
 
 		 1143 aa  68.6  0.000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000382571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01638  glucan 1,4-beta-glucosidase  31.65 
 
 		 889 aa  68.6  0.000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4610  glycoside hydrolase family protein  38.32 
 
 		 721 aa  67.8  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0740  fibronectin, type III domain-containing protein  42.71 
 
 		 409 aa  68.2  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.128234  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1929  Beta-glucosidase  28.87 
 
 		 882 aa  67.4  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3318  beta-glucosidase  32.12 
 
 		 913 aa  66.6  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00176622  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2604  glycoside hydrolase family protein  27.43 
 
 		 1127 aa  67  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0488265  hitchhiker  0.00483231 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4349  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  33.33 
 
 		 1236 aa  66.2  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.165187 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2399  hypothetical protein  25.6 
 
 		 1406 aa  66.2  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1287  periplasmic copper-binding  28.34 
 
 		 831 aa  66.6  0.00000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0939  hypothetical protein  46.34 
 
 		 1976 aa  66.2  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0134792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05607  hypothetical protein  31.29 
 
 		 962 aa  66.2  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2563  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  33.94 
 
 		 336 aa  65.9  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.23893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1073  fibronectin type III domain-containing protein  45.54 
 
 		 9585 aa  65.5  0.00000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3739  outer membrane adhesin like proteiin  24.66 
 
 		 4231 aa  65.5  0.00000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>