More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3000 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3000  alanine--glyoxylate transaminase  100 
 
 		 362 aa  755    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123854 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3260  phosphoserine aminotransferase, putative  53.93 
 
 		 357 aa  392  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0451268  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0866  alanine--glyoxylate transaminase  55.79 
 
 		 357 aa  385  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0177068  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0736  aminotransferase class V  53.35 
 
 		 356 aa  378  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0751  aminotransferase class V  53.35 
 
 		 356 aa  377  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000622725 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3173  aminotransferase, class V  51.27 
 
 		 357 aa  371  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000995852  normal  0.606873 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3345  Alanine--glyoxylate transaminase  51.28 
 
 		 355 aa  359  5e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000754514  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2772  aminotransferase  51.33 
 
 		 358 aa  350  2e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.22169e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0063  aminotransferase, class V  43.79 
 
 		 358 aa  288  7e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0060  aminotransferase, class V  44.07 
 
 		 358 aa  288  9e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.138135  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0703  Alanine--glyoxylate transaminase  43.4 
 
 		 357 aa  276  4e-73  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1420  aminotransferase class V  39.54 
 
 		 360 aa  249  5e-65  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1876  aminotransferase class V  35.9 
 
 		 373 aa  223  4.9999999999999996e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.544025  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1378  Serine--pyruvate transaminase  34.83 
 
 		 382 aa  222  7e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0059  aminotransferase class V  35.33 
 
 		 370 aa  222  8e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1389  alanine--glyoxylate transaminase  35.47 
 
 		 382 aa  219  6e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0519  alanine--glyoxylate transaminase  35.2 
 
 		 382 aa  218  2e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00351  soluble hydrogenase small subunit  34.08 
 
 		 385 aa  216  4e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2626  Alanine--glyoxylate transaminase  34.19 
 
 		 375 aa  215  9.999999999999999e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.506979  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1088  Alanine--glyoxylate transaminase  33.33 
 
 		 370 aa  214  9.999999999999999e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1361  soluble hydrogenase small subunit  33.8 
 
 		 384 aa  214  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00331  soluble hydrogenase small subunit  33.8 
 
 		 384 aa  214  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0009  aminotransferase class V  36.42 
 
 		 383 aa  213  5.999999999999999e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1247  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  34.08 
 
 		 382 aa  212  9e-54  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.465201  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2080  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  33.9 
 
 		 383 aa  211  2e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00351015  normal  0.87954 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4341  aminotransferase class V  36.97 
 
 		 382 aa  209  5e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.182025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0040  aminotransferase class V  34.48 
 
 		 385 aa  204  2e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0119169  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00341  soluble hydrogenase small subunit  31.68 
 
 		 387 aa  204  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0575  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  33.99 
 
 		 362 aa  204  2e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2692  aminotransferase class V  33.05 
 
 		 370 aa  204  2e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.221383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0011  aminotransferase, class V  34.92 
 
 		 384 aa  204  3e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000196245  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0008  serine--glyoxylate transaminase  32.94 
 
 		 383 aa  203  4e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0160251  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2460  Serine--glyoxylate transaminase  36.02 
 
 		 379 aa  203  4e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0600  soluble hydrogenase, tritium exchange subunit  33.99 
 
 		 362 aa  202  7e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00706485  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1188  aminotransferase class V  34.22 
 
 		 383 aa  201  9.999999999999999e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.26379  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1323  alanine--glyoxylate transaminase  33.98 
 
 		 387 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0013  aminotransferase, class V  33.62 
 
 		 385 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141675  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_540  aminotransferase, class V  33.99 
 
 		 362 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0499245  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3167  Serine--glyoxylate transaminase  33.53 
 
 		 385 aa  200  3e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0155  Serine--glyoxylate transaminase  34.57 
 
 		 380 aa  199  5e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3803  aminotransferase class V  31.65 
 
 		 384 aa  199  7e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1351  aminotransferase class V  32.85 
 
 		 363 aa  199  7.999999999999999e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3486  aminotransferase class V  31.37 
 
 		 382 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0035  soluble hydrogenase small subunit  31.13 
 
 		 387 aa  198  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0191  Serine--glyoxylate transaminase  33.89 
 
 		 382 aa  198  1.0000000000000001e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.746637 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0945  Serine--pyruvate transaminase  33.23 
 
 		 386 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0754728  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2630  aminotransferase class V  31.37 
 
 		 382 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0019  Serine--glyoxylate transaminase  33.61 
 
 		 388 aa  198  2.0000000000000003e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000322298  hitchhiker  0.00000185369 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00341  soluble hydrogenase small subunit  31.13 
 
 		 387 aa  197  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2307  alanine--glyoxylate transaminase  32.77 
 
 		 360 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2300  Serine--glyoxylate transaminase  34.58 
 
 		 379 aa  196  5.000000000000001e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000212673  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00341  soluble hydrogenase small subunit  30.85 
 
 		 387 aa  195  9e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00431  soluble hydrogenase small subunit  33.8 
 
 		 382 aa  195  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0217  Serine--glyoxylate transaminase  33.82 
 
 		 379 aa  193  3e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0044  soluble hydrogenase small subunit  32.96 
 
 		 382 aa  192  9e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2994  alanine-glyoxylate aminotransferase  33.88 
 
 		 395 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0514  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  33.33 
 
 		 380 aa  189  4e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0106  aminotransferase, class V  32.78 
 
 		 379 aa  189  5e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0781  aminotransferase, class V  37.33 
 
 		 381 aa  189  7e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.329422  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2475  Serine--glyoxylate transaminase  34.44 
 
 		 377 aa  189  9e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1383  aminotransferase, class V  32.84 
 
 		 384 aa  188  1e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000831703  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1714  aminotransferase class V  33.7 
 
 		 396 aa  188  1e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.280776 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0040  soluble hydrogenase small subunit  32.96 
 
 		 397 aa  187  2e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0111  aminotransferase, class V  33.13 
 
 		 380 aa  187  3e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3093  aminotransferase class V  33.51 
 
 		 396 aa  186  4e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1429  aminotransferase class V  33.13 
 
 		 384 aa  186  4e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.126435  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3194  aminotransferase class V  33.51 
 
 		 396 aa  186  4e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1731  Serine--pyruvate transaminase  32.26 
 
 		 381 aa  186  6e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.186952 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2126  aminotransferase class V  31.48 
 
 		 386 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000896436  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11530  L-aspartate aminotransferase;phosphoserine aminotransferase  32.2 
 
 		 384 aa  184  1.0000000000000001e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000426602  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0053  aminotransferase, class V  36.75 
 
 		 376 aa  185  1.0000000000000001e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2405  aminotransferase class V  32.74 
 
 		 395 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.134118 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1895  Serine--pyruvate transaminase  33.06 
 
 		 393 aa  182  8.000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1795  Serine--glyoxylate transaminase  33.43 
 
 		 402 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.758509  normal  0.307754 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0923  aminotransferase, class V  32.79 
 
 		 401 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000440044  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3277  Serine--pyruvate transaminase  33.15 
 
 		 376 aa  180  4e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1504  aminotransferase class V  33.14 
 
 		 379 aa  179  4.999999999999999e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2693  aminotransferase class V  31.85 
 
 		 381 aa  179  4.999999999999999e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00390195  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4570  Serine--glyoxylate transaminase  32.13 
 
 		 391 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0189325 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3670  aminotransferase class V  33.24 
 
 		 402 aa  179  8e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.569732 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0103  class V aminotransferase  29.41 
 
 		 382 aa  178  2e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2131  aminotransferase class V  32.85 
 
 		 402 aa  177  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.404443 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4200  aminotransferase class V  32.13 
 
 		 391 aa  178  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.357141 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1747  aminotransferase class V  32.85 
 
 		 402 aa  177  2e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.223279 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1388  serine-glyoxylate aminotransferase  32.7 
 
 		 391 aa  177  3e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0056  aminotransferase, class V  33.06 
 
 		 376 aa  177  3e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0208  hypothetical protein  33.43 
 
 		 387 aa  176  5e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1862  aminotransferase class V  33.82 
 
 		 401 aa  176  5e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2489  putative serine--glyoxylate aminotransferase  33.72 
 
 		 400 aa  176  5e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0981  aminotransferase, class V  32.43 
 
 		 391 aa  176  6e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2413  aminotransferase, class V  30.71 
 
 		 415 aa  175  9.999999999999999e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0849168 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4253  Serine--glyoxylate transaminase  32.32 
 
 		 406 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2957  aminotransferase class V  32.42 
 
 		 392 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.351742 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0418  Alanine--glyoxylate transaminase  32.87 
 
 		 375 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0836  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  31.18 
 
 		 400 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.259424  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3052  Serine--glyoxylate transaminase  32.43 
 
 		 413 aa  172  7.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160259 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4717  Serine--glyoxylate transaminase  31.86 
 
 		 391 aa  172  9e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00393654 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1715  aminotransferase class V  31.64 
 
 		 389 aa  170  3e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5929  Serine--glyoxylate transaminase  32.95 
 
 		 421 aa  170  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.293616  normal  0.115656 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0602  Serine--glyoxylate transaminase  30.68 
 
 		 394 aa  169  5e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>