163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2930 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_2930  Ferritin Dps family protein  100 
 
 
156 aa  311  1.9999999999999998e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00884055  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0062  Ferritin and Dps  40 
 
 
142 aa  97.4  7e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00686559 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2621  Ferritin Dps family protein  42.97 
 
 
149 aa  92  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.301078  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0415  Ferritin Dps family protein  38.28 
 
 
142 aa  86.3  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.366327 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1087  hypothetical protein  39.53 
 
 
146 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0914  hypothetical protein  39.53 
 
 
146 aa  79  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000508997  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0897  hypothetical protein  39.53 
 
 
146 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.911937  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0929  hypothetical protein  38.76 
 
 
146 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0993  hypothetical protein  38.76 
 
 
146 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1069  hypothetical protein  38.76 
 
 
146 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64861e-38 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0011  Ferritin Dps family protein  32.81 
 
 
138 aa  75.1  0.0000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1034  hypothetical protein  38.76 
 
 
146 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4269  hypothetical protein  38.76 
 
 
146 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.552451  hitchhiker  0.0034156 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1160  hypothetical protein  38.76 
 
 
146 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0904  Ferritin Dps family protein  38.76 
 
 
146 aa  73.9  0.0000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0131  Ferritin and Dps  34.27 
 
 
164 aa  68.6  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3021  Ferritin Dps family protein  34.69 
 
 
191 aa  68.6  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.331122 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4448  Ferritin and Dps  34.48 
 
 
180 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1509  Ferritin Dps family protein  34.51 
 
 
181 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.55793  normal  0.936849 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4906  bacterioferritin, putative  34.51 
 
 
179 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0567  Ferritin and Dps  34.69 
 
 
176 aa  65.1  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.8657  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4913  Ferritin Dps family protein  33.8 
 
 
176 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000032437 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4648  Ferritin Dps family protein  33.8 
 
 
176 aa  64.3  0.0000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.732955  normal  0.0579106 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5724  ferritin Dps family protein  34.81 
 
 
181 aa  63.9  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0602256  normal  0.927599 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4856  bacterioferritin, putative  33.8 
 
 
168 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.192046  hitchhiker  0.00133905 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4734  Ferritin, Dps family protein  33.8 
 
 
176 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000711152 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1702  Ferritin Dps family protein  35.42 
 
 
196 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.766547 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0139  Ferritin Dps family protein  36.11 
 
 
185 aa  62  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3513  Ferritin, Dps family protein  33.8 
 
 
181 aa  62  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2836  Ferritin Dps family protein  33.8 
 
 
181 aa  62  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.596859  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3866  Ferritin, Dps family protein  34.03 
 
 
184 aa  60.8  0.000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0888  Ferritin Dps family protein  33.33 
 
 
194 aa  60.5  0.000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.505389 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0147  Ferritin Dps family protein  35.42 
 
 
185 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64520  putative bacterioferritin  33.33 
 
 
177 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5602  putative bacterioferritin  33.33 
 
 
177 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0105  bacterioferritin  30.23 
 
 
155 aa  58.9  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000327193  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4114  Ferritin Dps family protein  31.03 
 
 
186 aa  58.5  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6426  Ferritin Dps family protein  31.62 
 
 
174 aa  58.9  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.714636  normal  0.449726 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02642  bacterioferritin  31.21 
 
 
186 aa  58.5  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2233  putative bacterioferritin (cytochrome b1)  34.97 
 
 
192 aa  58.2  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.305727  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0482  bacterioferritin  29.5 
 
 
155 aa  57.8  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000422336 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0465  bacterioferritin  29.5 
 
 
155 aa  57.4  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.541924  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2776  bacterioferritin  29.1 
 
 
158 aa  56.2  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000706514  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2901  rubrerythrin:Ferritin and Dps  31.94 
 
 
187 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.778034  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0895  Ferritin Dps family protein  30.71 
 
 
187 aa  56.2  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.743965 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0906  Ferritin, Dps family protein  26.85 
 
 
164 aa  55.5  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000158924  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0882  bacterioferritin  28.12 
 
 
168 aa  53.9  0.0000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.525786  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1082  bacterioferritin  26.87 
 
 
157 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3489  Ferritin Dps family protein  34.07 
 
 
181 aa  52.4  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4523  bacterioferritin  26.9 
 
 
158 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477419  normal  0.0580159 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1123  bacterioferritin  26.87 
 
 
157 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1908  bacterioferritin  28.06 
 
 
155 aa  52.4  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000155674  hitchhiker  0.0000000236672 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0133  bacterioferritin  26.81 
 
 
179 aa  52  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000103829  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3474  bacterioferritin  30.66 
 
 
161 aa  52  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0487726  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3707  bacterioferritin  24.44 
 
 
156 aa  51.2  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.437251  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002302  bacterioferritin  26.12 
 
 
158 aa  51.2  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.215823  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0104  Ferritin Dps family protein  30.87 
 
 
167 aa  51.2  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3349  bacterioferritin  28.47 
 
 
156 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.381889  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04013  bacterioferritin  25.93 
 
 
156 aa  50.8  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4330  bacterioferritin  25.37 
 
 
157 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.439778  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0346  bacterioferritin  29.23 
 
 
153 aa  50.8  0.000008  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.934014  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2432  bacterioferritin  26.67 
 
 
157 aa  50.4  0.000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00217295  normal  0.283401 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2663  Ferritin and Dps  33.11 
 
 
257 aa  50.4  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1760  Ferritin and Dps  28.26 
 
 
171 aa  49.7  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2657  Ferritin Dps family protein  34.72 
 
 
190 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.454229  normal  0.6432 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00052  bacterioferritin  25.37 
 
 
172 aa  50.1  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1111  bacterioferritin  25.37 
 
 
157 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0762  bacterioferritin  27.07 
 
 
154 aa  49.7  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1706  Ferritin Dps family protein  30.22 
 
 
167 aa  49.3  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2674  Ferritin, Dps family protein  26.28 
 
 
164 aa  49.7  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00193061  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2529  bacterioferritin subunit 1  27.34 
 
 
156 aa  49.3  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0457  bacterioferritin  27.56 
 
 
158 aa  49.7  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1402  Ferritin, Dps family protein  29.5 
 
 
182 aa  49.7  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3917  bacterioferritin  26.81 
 
 
157 aa  49.3  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.15009e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0171  Ferritin Dps family protein  34.27 
 
 
182 aa  48.5  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0048  bacterioferritin  25.17 
 
 
159 aa  48.5  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.985932 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0443  bacterioferritin  26.77 
 
 
158 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.0000427198  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0092  Ferritin Dps family protein  27.66 
 
 
164 aa  48.5  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.523921  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2087  Ferritin Dps family protein  24.65 
 
 
169 aa  48.5  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2517  Ferritin Dps family protein  30.22 
 
 
167 aa  48.1  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.239409 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1628  Ferritin Dps family protein  33.54 
 
 
181 aa  48.1  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0195  bacterioferritin  24.63 
 
 
158 aa  47.8  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0582  bacterioferritin  26.81 
 
 
157 aa  47.8  0.00005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000092678  normal  0.252272 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0281  bacterioferritin  26.81 
 
 
157 aa  47.8  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000088272  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0066  Ferritin Dps family protein  26.32 
 
 
179 aa  47.4  0.00008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2196  Ferritin Dps family protein  24.82 
 
 
164 aa  47.4  0.00008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.717028  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1247  bacterioferritin  26.67 
 
 
158 aa  47  0.0001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14050  bacterioferritin  27.59 
 
 
156 aa  46.6  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18670  bacterioferritin  25 
 
 
158 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.290552 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1374  bacterioferritin  26.67 
 
 
158 aa  46.2  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0599882  normal  0.159407 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1616  bacterioferritin  25 
 
 
158 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4546  bacterioferritin  28.68 
 
 
154 aa  46.2  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000556598  hitchhiker  0.00490625 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2579  bacterioferritin  26.36 
 
 
162 aa  45.8  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0971213 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1167  bacterioferritin, subunit 1  27.4 
 
 
161 aa  45.4  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.370359  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0582  bacterioferritin  25.17 
 
 
164 aa  45.4  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0017201  normal  0.223999 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1979  bacterioferritin  33.8 
 
 
164 aa  45.4  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0085  Ferritin Dps family protein  34.78 
 
 
165 aa  45.4  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3607  bacterioferritin  27.4 
 
 
155 aa  45.4  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.300979  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0293  Ferritin Dps family protein  25.55 
 
 
179 aa  44.7  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1675  Ferritin, Dps family protein  25 
 
 
179 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>