More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2837 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2837  response regulator receiver protein  100 
 
 		 122 aa  246  1e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000598352 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2832  response regulator receiver protein  47.9 
 
 		 248 aa  119  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.220444  hitchhiker  0.00935314 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0283  response regulator receiver protein  38.14 
 
 		 129 aa  84.7  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0718  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 128 aa  82.4  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.887374  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0193  response regulator receiver protein  34.19 
 
 		 127 aa  81.6  0.000000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00528064  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0736  response regulator receiver  34.75 
 
 		 131 aa  81.3  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1672  response regulator receiver domain-containing protein  33.33 
 
 		 124 aa  80.9  0.000000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.494239  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1339  response regulator receiver protein  35.04 
 
 		 126 aa  80.5  0.000000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.336226  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0476  response regulator receiver protein  35.04 
 
 		 133 aa  80.5  0.000000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0171  response regulator receiver protein  36.44 
 
 		 131 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.566468  normal  0.360629 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2968  response regulator receiver protein  35.59 
 
 		 131 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000715649 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02869  chemotaxis protein CheY  35.9 
 
 		 131 aa  80.1  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0269936  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2845  response regulator receiver protein  36.44 
 
 		 131 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114942  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1861  response regulator receiver protein  34.19 
 
 		 126 aa  79.3  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3029  response regulator receiver protein  35.04 
 
 		 127 aa  79.3  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0188  response regulator receiver protein  36.44 
 
 		 131 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0175  response regulator receiver protein  36.44 
 
 		 131 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.327239  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0262  response regulator receiver protein  36.44 
 
 		 131 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.587938  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0244  response regulator receiver protein  36.44 
 
 		 131 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.998065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2918  response regulator receiver protein  35.04 
 
 		 127 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.67374  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3209  chemotaxis protein CheY  35.04 
 
 		 127 aa  79  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4072  chemotaxis receiver protein  33.88 
 
 		 129 aa  78.6  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.338014  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2289  chemotaxis protein CheY  35.9 
 
 		 122 aa  79  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3050  response regulator receiver protein  35.04 
 
 		 127 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.217098 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3364  response regulator receiver protein  36.44 
 
 		 131 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0159122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1455  response regulator receiver protein  35.04 
 
 		 123 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.293422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2908  response regulator receiver protein  35.04 
 
 		 127 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1300  response regulator receiver protein  35.04 
 
 		 127 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1367  response regulator receiver protein  35.04 
 
 		 127 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.769538  normal  0.49981 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1360  response regulator receiver protein  35.04 
 
 		 127 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.174372  normal  0.090944 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2979  chemotaxis regulatory protein CheY  35.59 
 
 		 129 aa  78.2  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3048  response regulator receiver protein  35.9 
 
 		 127 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0702091 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1344  response regulator receiver  35.04 
 
 		 127 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.80307  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1200  response regulator receiver protein  35.04 
 
 		 123 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0192421  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2558  response regulator receiver protein  35.04 
 
 		 127 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.87788  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1379  response regulator receiver protein  35.9 
 
 		 135 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.415787  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1384  response regulator receiver protein  35.9 
 
 		 127 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0134523  normal  0.274763 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0302  response regulator receiver protein  33.88 
 
 		 129 aa  78.2  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00186383  normal  0.501704 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0334  response regulator receiver protein  33.88 
 
 		 129 aa  78.2  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.238286 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3108  response regulator receiver domain-containing protein  36.45 
 
 		 120 aa  77.8  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0443  lipoprotein  34.19 
 
 		 121 aa  77.8  0.00000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.81181  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2279  response regulator receiver protein  35.04 
 
 		 127 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0135574  normal  0.58639 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1636  response regulator receiver protein  35.9 
 
 		 127 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.394594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002833  chemotaxis regulator CheY  34.19 
 
 		 126 aa  77.4  0.00000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000239201  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1980  chemotaxis protein CheY  35.04 
 
 		 124 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.26082  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1527  response regulator receiver protein  35.9 
 
 		 128 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.400069  normal  0.607345 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1653  chemotaxis protein CheY  34.19 
 
 		 130 aa  77.4  0.00000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000247542  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3909  response regulator receiver protein  35.9 
 
 		 128 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.947385  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4340  response regulator receiver protein  35.9 
 
 		 124 aa  77.4  0.00000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365217  normal  0.448557 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1929  response regulator receiver domain-containing protein  35.34 
 
 		 132 aa  77  0.00000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03143  hypothetical protein  34.19 
 
 		 130 aa  77.4  0.00000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3309  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.17 
 
 		 900 aa  76.6  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.269875  normal  0.342346 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1520  chemotaxis protein CheY  35.04 
 
 		 127 aa  76.3  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1261  chemotaxis protein CheY  33.05 
 
 		 130 aa  76.6  0.0000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0812291  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1517  response regulator receiver protein  34.19 
 
 		 129 aa  76.6  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1545  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 129 aa  76.3  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2010  response regulator receiver protein  31.62 
 
 		 126 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3666  response regulator receiver protein  35.9 
 
 		 128 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0547467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0603  chemotaxis protein CheY  33.05 
 
 		 130 aa  76.6  0.0000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1136  chemotaxis protein CheY  33.05 
 
 		 130 aa  76.6  0.0000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3123  chemotaxis protein CheY  34.75 
 
 		 131 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.774714  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1176  response regulator receiver protein  34.19 
 
 		 126 aa  75.9  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149241  normal  0.34315 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2852  chemotaxis protein CheY  34.75 
 
 		 131 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3436  response regulator receiver  34.19 
 
 		 128 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.169643  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1614  response regulator receiver domain-containing protein  34.48 
 
 		 131 aa  75.9  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0470902 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0070  chemotaxis protein CheY  35.04 
 
 		 188 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3930  chemotaxis protein CheY  34.75 
 
 		 131 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3223  response regulator receiver protein  33.62 
 
 		 132 aa  76.3  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197956  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1198  putative chemotaxis protein CheY-like protein  33.62 
 
 		 139 aa  75.5  0.0000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3176  hypothetical protein  34.75 
 
 		 131 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0125  response regulator receiver domain-containing protein  34.75 
 
 		 131 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3808  response regulator receiver protein  34.75 
 
 		 131 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0986  response regulator receiver protein  34.19 
 
 		 131 aa  75.5  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491936 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3849  chemotaxis protein CheY  34.75 
 
 		 131 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1312  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 455 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.502008  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4151  response regulator receiver protein  35.04 
 
 		 132 aa  75.5  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.541325  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3428  chemotaxis protein CheY  34.75 
 
 		 131 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0930  response regulator receiver protein  32.76 
 
 		 130 aa  75.9  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000284085  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1690  chemotaxis protein CheY  34.75 
 
 		 131 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1860  response regulator receiver protein  33.05 
 
 		 129 aa  75.5  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1763  response regulator receiver  32.48 
 
 		 121 aa  75.1  0.0000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5001  response regulator receiver protein  35.9 
 
 		 127 aa  75.1  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3467  response regulator receiver protein  30.51 
 
 		 126 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0239  response regulator receiver protein  33.06 
 
 		 129 aa  74.7  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.82609  normal  0.256114 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3564  response regulator receiver protein  38.89 
 
 		 122 aa  74.7  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0923704 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2163  response regulator receiver domain-containing protein  34.19 
 
 		 128 aa  74.7  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4282  stage 0 sporulation protein A  34.45 
 
 		 276 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1259  chemotaxis protein CheY  32.2 
 
 		 125 aa  74.7  0.0000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.529849  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27950  Response regulator CheY  33.9 
 
 		 148 aa  74.7  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00952762  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3265  response regulator receiver protein  37.96 
 
 		 122 aa  74.7  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.571434  normal  0.349593 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1758  chemotaxis regulatory protein CheY  33.9 
 
 		 129 aa  74.3  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.505823  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3520  chemotaxis regulatory protein CheY  33.9 
 
 		 129 aa  74.3  0.0000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.387623 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3353  response regulator receiver domain-containing protein  32.23 
 
 		 225 aa  74.3  0.0000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000371413  normal  0.100473 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2018  response regulator receiver domain-containing protein  35.9 
 
 		 129 aa  74.3  0.0000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1646  chemotaxis regulatory protein CheY  33.9 
 
 		 129 aa  74.3  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0241  response regulator receiver protein  35 
 
 		 309 aa  74.3  0.0000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4023  sporulation transcriptional activator Spo0A  34.45 
 
 		 288 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0869765  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1564  response regulator receiver domain-containing protein  34.19 
 
 		 127 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0533474  normal  0.0475001 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4301  stage 0 sporulation protein A  34.45 
 
 		 276 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.794835  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0160  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 126 aa  73.9  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>