More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2836 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2836  signal recognition particle protein  100 
 
 		 447 aa  895    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.533211  decreased coverage  0.000777787 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2888  signal recognition particle protein  53.21 
 
 		 518 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.403346 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1804  signal recognition particle protein  54.23 
 
 		 512 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0197886  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2141  signal recognition particle protein  52.94 
 
 		 508 aa  464  1e-129  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2872  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  52.88 
 
 		 452 aa  457  1e-127  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107321  hitchhiker  0.00000141752 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0642  signal recognition particle protein  52.65 
 
 		 452 aa  451  1.0000000000000001e-126  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0127185  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3764  signal recognition particle protein  51.77 
 
 		 449 aa  451  1e-125  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000380679  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1100  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  51.54 
 
 		 512 aa  449  1e-125  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2449  signal recognition particle protein  51.14 
 
 		 463 aa  449  1e-125  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000152943  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1713  signal recognition particle protein  51.52 
 
 		 446 aa  448  1e-125  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000859311  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1099  signal recognition particle protein  53.36 
 
 		 453 aa  449  1e-125  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000944997  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0967  signal recognition particle protein  51.29 
 
 		 443 aa  446  1.0000000000000001e-124  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000109658  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3304  signal recognition particle protein  51.72 
 
 		 492 aa  445  1.0000000000000001e-124  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1062  signal recognition particle protein  53.06 
 
 		 457 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0147174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4622  signal recognition particle protein  51.14 
 
 		 449 aa  447  1.0000000000000001e-124  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000364274  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1624  signal recognition particle, subunit FFH/SRP54  50.99 
 
 		 467 aa  443  1e-123  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.170579  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3091  signal recognition particle protein  53.16 
 
 		 453 aa  441  1e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.113189  normal  0.0737969 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0559  signal recognition particle protein  50.99 
 
 		 461 aa  445  1e-123  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000306608  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1498  signal recognition particle protein  52.34 
 
 		 448 aa  444  1e-123  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.225316  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2893  signal recognition particle protein  53.16 
 
 		 453 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0469323  normal  0.518118 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3005  signal recognition particle protein  53.16 
 
 		 453 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.242955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07290  signal recognition particle protein  51.81 
 
 		 444 aa  438  9.999999999999999e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.3957e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2497  signal recognition particle protein  51.04 
 
 		 449 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000243009  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2823  signal recognition particle protein  53.16 
 
 		 453 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00851471  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2873  signal recognition particle protein  53.16 
 
 		 453 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.110714  normal  0.0858138 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2762  signal recognition particle protein  52.93 
 
 		 453 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00925068  normal  0.0680462 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3035  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  50.22 
 
 		 454 aa  440  9.999999999999999e-123  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.296692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1667  signal recognition particle protein  51.02 
 
 		 444 aa  440  9.999999999999999e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000671364  hitchhiker  0.00227852 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3761  signal recognition particle protein  50.93 
 
 		 453 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000277324  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2891  signal recognition particle protein  53.16 
 
 		 453 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0766211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1351  signal recognition particle protein  49.01 
 
 		 479 aa  439  9.999999999999999e-123  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0023431  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0770  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  51.69 
 
 		 446 aa  438  9.999999999999999e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000241723  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2310  signal recognition particle protein  51.64 
 
 		 443 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0985246  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1450  signal recognition particle protein  51.62 
 
 		 443 aa  441  9.999999999999999e-123  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02499  Signal Recognition Particle (SRP) component with 4.5S RNA (ffs)  52.93 
 
 		 453 aa  438  1e-121  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0363313  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1064  signal recognition particle protein  52.93 
 
 		 453 aa  438  1e-121  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000203805  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1228  signal recognition particle protein  50.59 
 
 		 433 aa  435  1e-121  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000301134  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3494  signal recognition particle protein  51.95 
 
 		 453 aa  436  1e-121  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.28336e-32 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3432  signal recognition particle protein  51.95 
 
 		 453 aa  436  1e-121  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000327935  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1073  signal recognition particle protein  52.93 
 
 		 453 aa  438  1e-121  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0286434  normal  0.0192406 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2769  signal recognition particle protein  52.93 
 
 		 453 aa  438  1e-121  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000211534  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2999  signal recognition particle protein  52.93 
 
 		 453 aa  438  1e-121  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000534435  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2894  signal recognition particle protein  52.93 
 
 		 453 aa  438  1e-121  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000003333  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1196  signal recognition particle protein  49.88 
 
 		 449 aa  436  1e-121  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0364721  normal  0.124331 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02463  hypothetical protein  52.93 
 
 		 453 aa  438  1e-121  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0259356  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1253  signal recognition particle protein  52.4 
 
 		 457 aa  435  1e-121  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000049947  hitchhiker  0.0000752283 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1227  signal recognition particle protein  50.59 
 
 		 433 aa  435  1e-121  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121808  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3849  signal recognition particle protein  52.93 
 
 		 453 aa  438  1e-121  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000605639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1417  signal recognition particle protein  51.73 
 
 		 445 aa  438  1e-121  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.0000000188375  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01690  signal recognition particle protein  52.13 
 
 		 478 aa  436  1e-121  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00271283  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3944  signal recognition particle protein  50.12 
 
 		 449 aa  432  1e-120  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000995401  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3887  signal recognition particle protein  50.12 
 
 		 449 aa  432  1e-120  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000347799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3586  signal recognition particle protein  50.12 
 
 		 449 aa  432  1e-120  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116729  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3604  signal recognition particle protein  50.12 
 
 		 449 aa  432  1e-120  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000432061  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1048  signal recognition particle protein  52.62 
 
 		 457 aa  432  1e-120  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000196553  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1978  signal recognition particle protein  51.06 
 
 		 469 aa  433  1e-120  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1299  signal recognition particle protein  50.12 
 
 		 449 aa  432  1e-120  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000157828  unclonable  2.8199000000000005e-25 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0884  signal recognition particle protein  52.29 
 
 		 453 aa  432  1e-120  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.138728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2225  signal recognition particle protein  49.67 
 
 		 451 aa  432  1e-120  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000252662  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1027  signal recognition particle protein  50.11 
 
 		 450 aa  434  1e-120  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.588339  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0966  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  50.47 
 
 		 447 aa  432  1e-120  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000570112  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2861  signal recognition particle protein  51.43 
 
 		 453 aa  432  1e-120  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2056  signal recognition particle protein  51.75 
 
 		 446 aa  434  1e-120  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000690531  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3230  signal recognition particle protein  52.29 
 
 		 453 aa  432  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0218227  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3859  signal recognition particle protein  50.12 
 
 		 449 aa  432  1e-120  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8952e-61 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3893  signal recognition particle protein  50.12 
 
 		 449 aa  432  1e-120  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1286  signal recognition particle protein  50.11 
 
 		 444 aa  432  1e-120  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.524326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2996  signal recognition particle protein  53.66 
 
 		 454 aa  432  1e-120  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000641047  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3038  signal recognition particle protein  53.66 
 
 		 454 aa  432  1e-120  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000193458  normal  0.986059 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1356  signal recognition particle protein  52.97 
 
 		 457 aa  429  1e-119  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3696  signal recognition particle protein  49.88 
 
 		 449 aa  431  1e-119  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000361017  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1087  signal recognition particle protein  51.06 
 
 		 446 aa  429  1e-119  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000240128  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3668  signal recognition particle protein  50.12 
 
 		 449 aa  430  1e-119  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000016406  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3983  signal recognition particle protein  49.88 
 
 		 449 aa  431  1e-119  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000408298  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3365  signal recognition particle protein  52.06 
 
 		 453 aa  431  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.089536  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2839  signal recognition particle protein  53.2 
 
 		 457 aa  431  1e-119  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000124707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2921  signal recognition particle protein  53.2 
 
 		 457 aa  431  1e-119  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000450795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2671  signal recognition particle protein  50.82 
 
 		 450 aa  430  1e-119  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000192246  unclonable  0.0000000276763 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2921  signal recognition particle protein  51.42 
 
 		 457 aa  430  1e-119  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00726192  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0845  signal recognition particle protein  52.52 
 
 		 453 aa  431  1e-119  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3018  signal recognition particle protein  53.2 
 
 		 457 aa  431  1e-119  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000039159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0888  signal recognition particle protein  52.05 
 
 		 457 aa  429  1e-119  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000142989  normal  0.373446 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4073  signal recognition particle protein  51.35 
 
 		 463 aa  428  1e-118  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.66452  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1158  signal recognition particle protein  51.63 
 
 		 457 aa  425  1e-118  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000642448  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0467  hypothetical protein  50.22 
 
 		 458 aa  425  1e-118  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0709  signal recognition particle protein  50.36 
 
 		 448 aa  426  1e-118  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000338232  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1123  signal recognition particle protein  52.52 
 
 		 453 aa  427  1e-118  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.279052  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1862  signal recognition particle protein  51.99 
 
 		 444 aa  427  1e-118  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000295764  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0785  Signal recognition particle GTPase  48.4 
 
 		 476 aa  426  1e-118  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000113263  unclonable  1.02574e-27 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39570  signal recognition particle protein  49.89 
 
 		 458 aa  426  1e-118  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.224172  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1115  signal recognition particle protein  49.89 
 
 		 445 aa  422  1e-117  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.814901 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0443  hypothetical protein  49.78 
 
 		 458 aa  422  1e-117  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0067  signal recognition particle protein  48.07 
 
 		 446 aa  421  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2261  Signal recognition particle protein  49.89 
 
 		 452 aa  424  1e-117  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.161738  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0851  signal recognition particle protein  52.46 
 
 		 453 aa  423  1e-117  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000129048  hitchhiker  0.0000234744 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0522  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  48.02 
 
 		 450 aa  422  1e-117  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.823996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1368  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  49.88 
 
 		 447 aa  420  1e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018858  normal  0.195447 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0990  signal recognition particle protein  51.83 
 
 		 453 aa  420  1e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00945365  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0655  signal recognition particle protein  51.39 
 
 		 452 aa  419  1e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000216081  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3204  signal recognition particle protein  52.06 
 
 		 453 aa  421  1e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.0069181  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>