140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2799 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2799  DNA polymerase B region  100 
 
 		 735 aa  1506    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0105637 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3187  DNA polymerase B, exonuclease  41.79 
 
 		 744 aa  442  9.999999999999999e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000163636 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0296  DNA polymerase B region  40.93 
 
 		 743 aa  429  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0413746  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3245  DNA polymerase II, putative  42.02 
 
 		 745 aa  426  1e-117  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2007  DNA-directed DNA polymerase B  33.6 
 
 		 788 aa  354  4e-96  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0006  DNA polymerase B region  34.07 
 
 		 811 aa  347  3e-94  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0005  DNA-directed DNA polymerase B  33.8 
 
 		 792 aa  345  1e-93  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.775002  normal  0.276245 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0006  cyclic nucleotide-binding protein  33.92 
 
 		 793 aa  343  5e-93  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0027  DNA polymerase B region  33.28 
 
 		 796 aa  343  5.999999999999999e-93  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0007  DNA polymerase B region  33.08 
 
 		 796 aa  324  4e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1412  DNA polymerase B region  34.67 
 
 		 785 aa  318  2e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0006  DNA polymerase B region  31.49 
 
 		 800 aa  312  2e-83  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0104933 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0476  DNA polymerase B, exonuclease  24.9 
 
 		 707 aa  190  5.999999999999999e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0121312  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5509  DNA-directed DNA polymerase B  29.45 
 
 		 603 aa  162  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.26262 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1342  DNA polymerase Pol2  25.65 
 
 		 781 aa  142  1.9999999999999998e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000227387  normal  0.522725 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1258  replicative DNA polymerase I  24.26 
 
 		 780 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1378  DNA polymerase Pol2  23.56 
 
 		 780 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00266736 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0530  DNA polymerase Pol2  23.6 
 
 		 781 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1320  DNA polymerase II  26.77 
 
 		 784 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.4978 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1049  DNA polymerase II  24.88 
 
 		 783 aa  129  3e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0144376 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1884  DNA polymerase II  25.92 
 
 		 786 aa  129  3e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.115615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0961  DNA polymerase II  24.68 
 
 		 785 aa  125  3e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1367  DNA polymerase Pol2  24.05 
 
 		 810 aa  120  7.999999999999999e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.815142  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0570  DNA polymerase II  26.54 
 
 		 790 aa  118  5e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0609  DNA polymerase II  26.15 
 
 		 790 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.231029  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0393  DNA polymerase II  23.57 
 
 		 794 aa  115  4.0000000000000004e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3418  DNA polymerase II  26.29 
 
 		 789 aa  113  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2947  DNA polymerase II  26.29 
 
 		 789 aa  113  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.670904 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3546  DNA polymerase II  26.29 
 
 		 789 aa  113  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2361  DNA polymerase II  27.1 
 
 		 787 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.168731  normal  0.46504 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3819  DNA polymerase II  25.62 
 
 		 788 aa  112  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00062  DNA polymerase II  24.44 
 
 		 783 aa  112  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00061  hypothetical protein  24.44 
 
 		 783 aa  112  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0109  DNA polymerase II  25.35 
 
 		 783 aa  111  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.455197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0103  DNA polymerase II  25.35 
 
 		 783 aa  111  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.249231 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0102  DNA polymerase II  25.35 
 
 		 783 aa  111  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0064  DNA polymerase II  24.66 
 
 		 783 aa  110  6e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.406876  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0062  DNA polymerase II  24.89 
 
 		 783 aa  111  6e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0283986  normal  0.967142 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3539  DNA-directed DNA polymerase  24.66 
 
 		 783 aa  110  7.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0052  DNA polymerase II  24.44 
 
 		 783 aa  110  7.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0653  DNA polymerase Pol2  22.26 
 
 		 811 aa  110  7.000000000000001e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.340246  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3597  DNA polymerase II  24.66 
 
 		 783 aa  110  7.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000326268 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0065  DNA polymerase II  24.22 
 
 		 783 aa  110  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2621  DNA polymerase II  26.77 
 
 		 787 aa  109  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00407821  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3630  DNA polymerase II  26.41 
 
 		 786 aa  109  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0104  DNA polymerase II  25.12 
 
 		 783 aa  109  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0062  DNA polymerase II  24.66 
 
 		 783 aa  108  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00931565  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3628  DNA polymerase II  25.73 
 
 		 788 aa  108  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1645  DNA polymerase II  27.69 
 
 		 789 aa  107  6e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0528782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3400  DNA polymerase II  26.75 
 
 		 788 aa  107  6e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40120  DNA polymerase II  27.41 
 
 		 787 aa  106  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01452  DNA polymerase II  25.2 
 
 		 790 aa  106  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1511  DNA polymerase II  24.57 
 
 		 794 aa  106  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000196312 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1999  DNA polymerase II  26.93 
 
 		 786 aa  105  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.449398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0731  DNA polymerase II  25.29 
 
 		 787 aa  104  6e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.13833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0607  DNA polymerase II  25.9 
 
 		 820 aa  103  8e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.427603  normal  0.519282 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4584  DNA polymerase II  26.27 
 
 		 788 aa  103  9e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.657494  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1903  DNA polymerase II  26.93 
 
 		 786 aa  103  9e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.856945 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2393  DNA polymerase II  26.89 
 
 		 786 aa  103  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3302  DNA polymerase II  26.89 
 
 		 786 aa  103  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2154  DNA polymerase II  22.1 
 
 		 783 aa  103  2e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000768017  hitchhiker  0.000641936 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0922  DNA-directed DNA polymerase  22.89 
 
 		 607 aa  101  4e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.434202  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0929  DNA polymerase II  25.53 
 
 		 816 aa  101  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.193818  normal  0.499363 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0831  DNA polymerase II  25.12 
 
 		 787 aa  101  6e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0134615  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2482  DNA polymerase II  25.71 
 
 		 795 aa  100  7e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.205655  hitchhiker  0.00219855 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3734  DNA polymerase II  25.54 
 
 		 787 aa  99.4  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4655  DNA polymerase II  25.13 
 
 		 791 aa  99.8  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.230041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3572  DNA polymerase II  25.75 
 
 		 786 aa  99  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.252391 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1250  DNA polymerase II  25.41 
 
 		 801 aa  98.6  4e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0167112  hitchhiker  0.000178487 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2142  DNA polymerase II  26.37 
 
 		 789 aa  97.1  9e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.249301  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02749  DNA polymerase II  26.04 
 
 		 816 aa  97.4  9e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1316  DNA-directed DNA polymerase  21.69 
 
 		 784 aa  97.4  9e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.198282  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1777  replicative DNA polymerase I  22.79 
 
 		 932 aa  95.9  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.227569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3658  DNA polymerase II  24.83 
 
 		 792 aa  95.5  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0583295  normal  0.426144 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2273  DNA polymerase II  24.09 
 
 		 818 aa  93.2  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1688  replicative DNA polymerase I  21.91 
 
 		 910 aa  92.8  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2629  DNA polymerase II  24.93 
 
 		 792 aa  92.8  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.085046  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2210  DNA polymerase II  22.63 
 
 		 782 aa  92.4  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.40989 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2428  DNA polymerase II  25.44 
 
 		 821 aa  92  4e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.124227  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003097  DNA polymerase II  25.99 
 
 		 787 aa  90.9  8e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000122511  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2655  DNA polymerase II  25.53 
 
 		 799 aa  90.5  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.697172  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5258  DNA polymerase II  25.47 
 
 		 791 aa  90.1  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.946105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1653  DNA polymerase II  24.32 
 
 		 809 aa  89.7  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.112928  normal  0.0896662 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3234  DNA polymerase II  24.73 
 
 		 788 aa  89  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.642975 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0081  DNA polymerase I-like  26.23 
 
 		 311 aa  88.6  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2724  DNA polymerase II  23.82 
 
 		 809 aa  88.6  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000453184  hitchhiker  0.0000581945 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5084  DNA polymerase II  24.47 
 
 		 788 aa  88.6  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1397  DNA polymerase Pol2  23.59 
 
 		 941 aa  88.6  4e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.61356  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1630  DNA polymerase II  24.32 
 
 		 809 aa  88.6  4e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00018706  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1619  DNA polymerase II  24.32 
 
 		 809 aa  88.6  4e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000233393  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3085  DNA polymerase II  24.46 
 
 		 807 aa  88.2  5e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000404512  hitchhiker  0.0000370941 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_54677  DNA polymerase delta  23.26 
 
 		 1087 aa  87  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2469  DNA polymerase II  24.79 
 
 		 810 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00196726  hitchhiker  0.000569309 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2537  DNA polymerase II  25 
 
 		 810 aa  85.5  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.132688  unclonable  0.0000408112 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2629  DNA polymerase II  24.26 
 
 		 810 aa  85.9  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0639534  hitchhiker  0.0000529366 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1820  DNA polymerase II  24.63 
 
 		 808 aa  85.1  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3002  DNA polymerase II  24.13 
 
 		 793 aa  85.1  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.789945  normal  0.339701 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5012  DNA polymerase II  24.13 
 
 		 794 aa  85.1  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5848  DNA polymerase II  24.13 
 
 		 794 aa  85.1  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.595461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0298  DNA polymerase I  23.11 
 
 		 835 aa  85.1  0.000000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.131674  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>