104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2736 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2736  beta strand repeat-containing protein  100 
 
 		 1882 aa  3504    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.883139  normal  0.0228341 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0779  hypothetical protein  31.22 
 
 		 1881 aa  202  3e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3756  Outer membrane autotransporter barrel  32.19 
 
 		 3506 aa  187  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2348  outer membrane autotransporter  35.35 
 
 		 1971 aa  182  4.999999999999999e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.714224  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2810  outer membrane autotransporter  33.96 
 
 		 2578 aa  181  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4858  outer membrane autotransporter  32.13 
 
 		 2906 aa  173  3e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3534  beta strand repeat-containing protein  33.02 
 
 		 2642 aa  166  4.0000000000000004e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2454  ShdA  34.08 
 
 		 3322 aa  158  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0854  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.08 
 
 		 3629 aa  157  1e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0758  outer membrane autotransporter barrel  32.87 
 
 		 2396 aa  148  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291921 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1722  beta strand repeat-containing protein  31.63 
 
 		 1530 aa  143  3e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.885692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00711  YapH protein  32.75 
 
 		 2711 aa  141  1e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0184521  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1148  outer membrane autotransporter  32.77 
 
 		 3420 aa  130  3e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1053  outer membrane autotransporter  32.62 
 
 		 3415 aa  130  3e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4933  outer membrane autotransporter  32.37 
 
 		 2346 aa  120  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348524  unclonable  0.000124828 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5354  outer membrane autotransporter  32.37 
 
 		 2365 aa  121  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0199943  normal  0.02642 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1774  serine protease  33.29 
 
 		 1508 aa  117  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.903556  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1672  beta strand repeat-containing protein  31.97 
 
 		 3391 aa  116  4.0000000000000004e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848841 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1857  outer membrane autotransporter barrel domain protein  37.36 
 
 		 1322 aa  116  5e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000638249 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1566  Outer membrane autotransporter barrel  31.86 
 
 		 1119 aa  114  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0173  outer membrane autotransporter  37.01 
 
 		 1113 aa  111  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0108054  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  37.09 
 
 		 1741 aa  108  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6464  outer membrane autotransporter  37.48 
 
 		 1459 aa  107  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6171  outer membrane autotransporter  38.35 
 
 		 1458 aa  107  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4881  outer membrane autotransporter  34.35 
 
 		 2366 aa  106  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.312195  decreased coverage  0.00000000166918 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4722  outer membrane autotransporter  36.2 
 
 		 2003 aa  105  9e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3532  outer membrane autotransporter  49.17 
 
 		 1571 aa  103  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4855  outer membrane autotransporter  52.88 
 
 		 1861 aa  94.7  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2013  outer membrane autotransporter  52.68 
 
 		 1593 aa  93.2  4e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1881  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.94 
 
 		 1532 aa  93.2  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1554  autotransporter-associated beta strand repeat protein  37.55 
 
 		 2363 aa  89.7  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.623464 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2662  ShdA  29.48 
 
 		 2057 aa  89  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.285141  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2875  outer membrane autotransporter barrel domain protein  35.41 
 
 		 1848 aa  87.8  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.189813 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0586  outer membrane autotransporter  47.37 
 
 		 2926 aa  81.6  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0206  outer membrane autotransporter barrel domain protein  37.15 
 
 		 1285 aa  81.6  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0891162 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2767  outer membrane autotransporter  36.87 
 
 		 1108 aa  80.1  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0585  beta strand repeat-containing protein  30.5 
 
 		 852 aa  78.6  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.184792  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2325  outer membrane autotransporter  34.53 
 
 		 1782 aa  78.2  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0522858  hitchhiker  0.00737544 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4364  outer membrane autotransporter  52.75 
 
 		 2371 aa  77.8  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00430062 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4066  outer membrane autotransporter barrel domain protein  46.32 
 
 		 1081 aa  77.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.392825  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4115  outer membrane autotransporter  33.49 
 
 		 3954 aa  75.5  0.000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1053  filamentous haemagglutinin-like protein  36.07 
 
 		 1447 aa  75.1  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0559145  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0152  outermembrane transporter  52.03 
 
 		 861 aa  75.1  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.0000458443  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6355  outer membrane autotransporter  36.73 
 
 		 4238 aa  73.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.51084 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6533  Outer membrane autotransporter barrel  35.48 
 
 		 3822 aa  73.6  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4035  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase Dut  31.83 
 
 		 994 aa  73.2  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.565458 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3411  Outer membrane autotransporter barrel  48.18 
 
 		 1130 aa  72.4  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3929  outer membrane autotransporter barrel domain protein  35.29 
 
 		 1011 aa  70.5  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4307  outer membrane autotransporter  40.37 
 
 		 1099 aa  70.1  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157591  hitchhiker  0.00000542564 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0137  outer membrane autotransporter  48.42 
 
 		 1519 aa  69.3  0.0000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6767  outer membrane autotransporter  32.4 
 
 		 4238 aa  68.9  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  30.49 
 
 		 3089 aa  68.2  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1690  beta strand repeat-containing protein  30.69 
 
 		 1632 aa  68.2  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.638042 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0336  Outer membrane autotransporter barrel  38.16 
 
 		 995 aa  68.2  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2009  autotransporter-associated beta strand repeat protein  30.32 
 
 		 1806 aa  67  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.979207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2201  serine protease  38.3 
 
 		 641 aa  67  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5200  autotransporter, putative  37.5 
 
 		 986 aa  66.6  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0480  outer membrane autotransporter barrel domain protein  36.08 
 
 		 1029 aa  64.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.876293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1975  Outer membrane autotransporter  31.15 
 
 		 1111 aa  61.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1537  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.12 
 
 		 3152 aa  61.2  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1723  outer membrane autotransporter barrel domain protein  37.27 
 
 		 1953 aa  60.8  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0576481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0082  beta strand repeat-containing protein  28.31 
 
 		 1300 aa  57  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420525 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4985  Outer membrane autotransporter barrel  34.31 
 
 		 1093 aa  57  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.68858  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3175  outer membrane autotransporter  34.31 
 
 		 1093 aa  57  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0115385 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6125  beta strand repeat-containing protein  28.99 
 
 		 1325 aa  56.6  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2115  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.82 
 
 		 1694 aa  56.2  0.000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0846995  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1283  outer membrane autotransporter barrel domain protein  41.94 
 
 		 3015 aa  55.8  0.000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2512  Outer membrane autotransporter barrel  32.54 
 
 		 1019 aa  55.8  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.150059 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3087  Outer membrane autotransporter barrel  31.12 
 
 		 2407 aa  55.1  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0033  autotransporter-associated beta strand repeat protein  41.07 
 
 		 348 aa  54.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.354567 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  41.74 
 
 		 1357 aa  53.9  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241851  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2876  outer membrane autotransporter  37.28 
 
 		 1550 aa  53.5  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0725  Outer membrane autotransporter barrel  25.13 
 
 		 3504 aa  53.1  0.00005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1117  beta strand repeat-containing protein  43.16 
 
 		 422 aa  52.8  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03531  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1165 aa  52.4  0.00009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.1665  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03479  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1165 aa  52.4  0.00009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.112471  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2173  Outer membrane autotransporter barrel  35 
 
 		 1180 aa  51.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.193519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6465  beta strand repeat-containing protein  37.96 
 
 		 653 aa  52  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.696651  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6700  beta strand repeat-containing protein  37.96 
 
 		 653 aa  52  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.162952 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2528  adhesin  25.98 
 
 		 1252 aa  51.6  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1258  beta strand repeat-containing protein  36.42 
 
 		 550 aa  51.6  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.305666  normal  0.49742 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0131  lipoprotein  34.29 
 
 		 657 aa  51.2  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2208  beta strand repeat-containing protein  29.74 
 
 		 1869 aa  50.8  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.848116  normal  0.0253068 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3853  outer membrane autotransporter barrel domain protein  39.29 
 
 		 1055 aa  50.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.229574  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3319  autotransporter-associated beta strand repeat protein  43.04 
 
 		 634 aa  51.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.631506  normal  0.371955 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6306  beta strand repeat-containing protein  37.04 
 
 		 653 aa  50.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.662487 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3367  adhesin  25.84 
 
 		 1234 aa  50.4  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2817  outer membrane autotransporter  39.73 
 
 		 950 aa  49.7  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0264  beta strand repeat-containing protein  40 
 
 		 860 aa  49.7  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6344  beta strand repeat-containing protein  38.89 
 
 		 652 aa  49.3  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4232  beta strand repeat-containing protein  35.98 
 
 		 1446 aa  49.3  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.819177  normal  0.109622 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6047  beta strand repeat-containing protein  37.96 
 
 		 652 aa  49.3  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.649226 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2957  beta strand repeat-containing protein  35.59 
 
 		 683 aa  49.3  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.280909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0743  outer membrane autotransporter  45.31 
 
 		 4312 aa  48.9  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5838  outer membrane autotransporter barrel domain protein  36.21 
 
 		 1227 aa  48.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0673  putative autotransporter protein  43.75 
 
 		 4391 aa  47.8  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3733  Outer membrane autotransporter barrel  44.93 
 
 		 1038 aa  47  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418268  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1031  outer membrane autotransporter  38.01 
 
 		 1172 aa  47  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0914454  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1055  filamentous haemagglutinin-like protein  33.47 
 
 		 1451 aa  46.6  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0430168  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3082  outer membrane autotransporter  28.73 
 
 		 1164 aa  46.6  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184876  normal  0.275156 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>