42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2676 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2676  UvrB/UvrC protein  100 
 
 		 170 aa  352  1e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.712915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0057  UvrB/UvrC protein  40.24 
 
 		 178 aa  122  2e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00323429  normal  0.240627 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2742  UvrB/UvrC protein  39.88 
 
 		 173 aa  122  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0144  UvrB/UvrC protein  36.63 
 
 		 175 aa  115  3e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0833  UvrB/UvrC protein  35.93 
 
 		 171 aa  115  3e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000420974  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0074  UvrB/UvrC protein  36.87 
 
 		 182 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0417571  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1827  UvrB/UvrC protein  35.5 
 
 		 170 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000280692  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0100  hypothetical protein  34.64 
 
 		 182 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00596962  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0325  UvrB/UvrC protein  40.27 
 
 		 162 aa  109  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00358864  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0074  UvrB/UvrC protein  36.09 
 
 		 182 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.525038  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0089  hypothetical protein  32.58 
 
 		 182 aa  104  7e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.84577e-49 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0078  hypothetical protein  32.77 
 
 		 182 aa  104  7e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0792443  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0075  nucleotide excision repair protein  32.58 
 
 		 182 aa  104  7e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.452997  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0079  hypothetical protein  32.77 
 
 		 182 aa  104  7e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1791  UvrB/UvrC protein  37.18 
 
 		 168 aa  103  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261454  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5226  hypothetical protein  34.83 
 
 		 182 aa  103  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000128201  hitchhiker  4.7433e-20 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0076  UvrB/UvrC protein  32.58 
 
 		 182 aa  103  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.247563  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1950  UvrB/UvrC protein  38.04 
 
 		 177 aa  103  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0127215  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0079  hypothetical protein  32.58 
 
 		 182 aa  102  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.148772  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0109  hypothetical protein  32.58 
 
 		 182 aa  101  6e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000454963  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0081  UvrB/UvrC protein  32.57 
 
 		 182 aa  100  7e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00231542  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0178  UvrB/UvrC protein  35.15 
 
 		 170 aa  100  9e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0179  UvrB/UvrC protein  33.95 
 
 		 167 aa  100  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00850  UvrB/UvrC protein  35.76 
 
 		 170 aa  95.1  4e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.038021  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0077  UvrB/UvrC protein  32.18 
 
 		 182 aa  93.6  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0160  UvrB/UvrC protein  31.45 
 
 		 169 aa  92  4e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3463  UvrB/UvrC protein  33.14 
 
 		 173 aa  90.9  7e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000125325  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0762  UvrB/UvrC protein  32.35 
 
 		 173 aa  85.9  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0331206  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0253  UvrB/UvrC protein  31.52 
 
 		 174 aa  84.3  6e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.552848 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1084  Uncharacterized protein with conserved CXXC pairs-like protein  26.54 
 
 		 182 aa  81.6  0.000000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.944063  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0387  UvrB/UvrC protein  30.82 
 
 		 165 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000814074  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2369  hypothetical protein  30.12 
 
 		 169 aa  72  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000515373  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1482  UvrB/UvrC protein  25.48 
 
 		 145 aa  62  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.051637  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1404  UvrB/UvrC protein  26.75 
 
 		 159 aa  59.7  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0559  hypothetical protein  31.58 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0545  hypothetical protein  31.58 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0163  UvrB/UvrC domain-containing protein  29.82 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2439  hypothetical protein  26.01 
 
 		 175 aa  53.1  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0125  uncharacterized protein with conserved CXXC pairs  22.34 
 
 		 193 aa  51.6  0.000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.587234  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2753  hypothetical protein  26.29 
 
 		 178 aa  51.2  0.000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.105534  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2038  UVR domain-containing protein  23.75 
 
 		 165 aa  50.4  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0047  hypothetical protein  26.51 
 
 		 177 aa  49.3  0.00003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0283317  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>