40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2645 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_2645  hypothetical protein  100 
 
 
259 aa  521  1e-147  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.15753  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0725  hypothetical protein  26.61 
 
 
274 aa  59.3  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2307  hypothetical protein  27.64 
 
 
306 aa  55.8  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.112792  normal  0.0871647 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2062  hypothetical protein  35.19 
 
 
268 aa  55.5  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.380263  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3092  hypothetical protein  25.88 
 
 
275 aa  52.8  0.000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00006748  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3555  hypothetical protein  24.39 
 
 
274 aa  51.2  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0880  hypothetical protein  25.88 
 
 
275 aa  51.2  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00269663  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0843  hypothetical protein  25.88 
 
 
275 aa  51.2  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00287209  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4236  peptidase M14 carboxypeptidase A  32.38 
 
 
497 aa  50.1  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0580382  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3749  hypothetical protein  24.41 
 
 
275 aa  49.7  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0933  hypothetical protein  27.31 
 
 
275 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000499395  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1519  peptidase M14, carboxypeptidase A  33.02 
 
 
398 aa  48.5  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2526  hypothetical protein  23.96 
 
 
274 aa  48.5  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.294176  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3428  hypothetical protein  27.31 
 
 
275 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0296042  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3075  hypothetical protein  27.19 
 
 
275 aa  48.1  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000680371  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0908  hypothetical protein  27.31 
 
 
275 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.144126  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2827  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.43 
 
 
341 aa  48.1  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0942  hypothetical protein  26.85 
 
 
275 aa  47.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.878381  normal  0.502951 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2804  peptidase M14, carboxypeptidase A  32.91 
 
 
384 aa  47.8  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.463732  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1198  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.77 
 
 
606 aa  47.4  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2610  peptidase M14, carboxypeptidase A  30.77 
 
 
606 aa  47.4  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.163339 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2589  hypothetical protein  27.1 
 
 
392 aa  46.6  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0393538  normal  0.0858047 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02465  hypothetical protein  30.11 
 
 
334 aa  46.6  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0353746  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0232  zinc carboxypeptidase, putative  31.03 
 
 
821 aa  46.2  0.0006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2901  peptidase M14, carboxypeptidase A  31.21 
 
 
585 aa  45.8  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.55349  normal  0.0629312 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4756  peptidase M14, carboxypeptidase A  38.75 
 
 
506 aa  45.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3576  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  37.5 
 
 
311 aa  45.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107365  normal  0.907125 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0725  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  33.78 
 
 
326 aa  43.9  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.330277  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3253  peptidase M14 carboxypeptidase A  45.28 
 
 
393 aa  44.3  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.310529  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2765  Zn-dependent enzyme, member of deacylase/carboxypeptidase family protein  26.24 
 
 
309 aa  44.3  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0043  peptidase M14, carboxypeptidase A  39.73 
 
 
315 aa  44.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2731  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.57 
 
 
338 aa  44.3  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.291294  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1797  peptidase M14, carboxypeptidase A  34.88 
 
 
618 aa  43.9  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.158 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1751  peptidase M14, carboxypeptidase A  39.44 
 
 
304 aa  43.5  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1792  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase family protein  24.66 
 
 
342 aa  43.1  0.004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0385  succinylglutamate desuccinylase/Aspartoacylase family protein  24.66 
 
 
342 aa  43.1  0.004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.58536  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2263  hypothetical protein  24.63 
 
 
306 aa  42.7  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1204  peptidase M14, carboxypeptidase A  35.94 
 
 
262 aa  42.7  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.670707  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1906  hypothetical protein  29.63 
 
 
351 aa  42  0.009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2401  zinc carboxypeptidase-related protein  27.04 
 
 
306 aa  42  0.01  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.859636  normal  0.574501 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>