More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2480 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_2480  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 
112 aa  219  1e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.312055  normal  0.888078 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2477  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 
112 aa  172  2e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.698113  normal  0.567778 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2478  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 
112 aa  171  3e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.464409  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0939  nitrogen regulatory protein P-II, putative  70.54 
 
 
112 aa  168  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2479  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 
112 aa  167  3e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.494885  normal  0.880519 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2044  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 
112 aa  167  4e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0302  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 
112 aa  164  4e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4397  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 
112 aa  163  8e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.467345 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0171  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 
112 aa  163  9e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.138781  normal  0.605066 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3366  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 
112 aa  162  1e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0523  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 
112 aa  162  1e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278087  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3942  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 
112 aa  162  2e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0472  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 
112 aa  162  2e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0782781  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0808  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 
112 aa  162  2e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0899844  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4248  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 
112 aa  162  2e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.415508  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0694  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 
112 aa  162  2e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.804518  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3314  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 
112 aa  161  3e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.258343  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3163  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 
112 aa  161  4e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.105283  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4381  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 
117 aa  160  5e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.647425  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0120  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 
112 aa  160  5e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0723912 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4404  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 
117 aa  160  5e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.795902  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0195  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 
112 aa  160  5e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.863029 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3119  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 
112 aa  160  7e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0878953  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0163  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 
112 aa  159  8e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.814781 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0181  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 
112 aa  159  8e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.153981  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2937  nitrogen regulatory protein P-II 1  68.75 
 
 
112 aa  159  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2720  nitrogen regulatory protein P-II 1  68.75 
 
 
112 aa  159  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1115  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 
112 aa  159  9e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2706  nitrogen regulatory protein P-II 1  68.75 
 
 
112 aa  159  9e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2918  nitrogen regulatory protein P-II 1  68.75 
 
 
112 aa  159  9e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.94675  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3787  nitrogen regulatory protein P-II 1  68.75 
 
 
112 aa  159  9e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2803  nitrogen regulatory protein P-II 1  68.75 
 
 
112 aa  159  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2824  nitrogen regulatory protein P-II 1  68.75 
 
 
112 aa  159  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2762  nitrogen regulatory protein P-II 1  68.75 
 
 
112 aa  159  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2706  nitrogen regulatory protein P-II 1  68.75 
 
 
112 aa  159  9e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02445  regulatory protein P-II for glutamine synthetase  68.75 
 
 
112 aa  159  9e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02409  hypothetical protein  68.75 
 
 
112 aa  159  9e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1124  nitrogen regulatory protein P-II 1  68.75 
 
 
112 aa  159  9e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2838  nitrogen regulatory protein P-II 1  68.75 
 
 
112 aa  159  9e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2345  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  63.39 
 
 
112 aa  159  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.782832  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0156  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 
112 aa  159  1e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0641  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 
112 aa  159  1e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.252116  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1183  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 
112 aa  159  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.14961e-05 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2905  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 
112 aa  158  2e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2271  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 
112 aa  159  2e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1762  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 
112 aa  158  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.975423  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3058  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 
112 aa  158  2e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12933  nitrogen regulatory protein P-II glnB  61.61 
 
 
112 aa  159  2e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.30403e-36  normal  0.258229 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3656  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 
112 aa  158  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1085  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 
112 aa  159  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.260987  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3013  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 
112 aa  159  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00180505  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1090  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 
112 aa  159  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0228645  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0233  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 
112 aa  158  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1584  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 
112 aa  159  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.138814  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0234  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 
112 aa  158  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000834653  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1243  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 
112 aa  159  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.50478  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3078  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 
112 aa  159  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  4.264e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1960  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 
112 aa  158  2e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0883  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 
112 aa  159  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0742  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 
112 aa  159  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0306564  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1680  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 
112 aa  158  3e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  8.92392e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3119  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 
112 aa  158  3e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2085  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  66.96 
 
 
112 aa  158  3e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4874  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 
112 aa  158  3e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2456  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 
112 aa  157  4e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00114582  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1836  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 
112 aa  157  4e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0337137  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2411  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 
112 aa  157  4e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122032  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2415  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 
112 aa  157  4e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.194654  hitchhiker  0.00652052 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0879  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 
112 aa  157  4e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5738  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 
112 aa  157  4e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14101  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2321  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 
112 aa  157  4e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0286658  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1799  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 
112 aa  157  4e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.534869  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4461  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 
112 aa  157  4e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.188449  normal  0.905473 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2361  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 
112 aa  157  5e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1181  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 
112 aa  157  5e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  6.88194e-07 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3038  nitrogen regulatory protein P-II 1  67.86 
 
 
112 aa  157  5e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.196983  normal  0.293626 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2711  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 
112 aa  157  5e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  6.34529e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0198  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 
112 aa  157  5e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.485304 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0217  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 
112 aa  157  5e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  3.68327e-06 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0342  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  65.18 
 
 
112 aa  157  6e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1879  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 
112 aa  157  6e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  2.57329e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1217  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 
112 aa  157  6e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.967639 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1118  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 
112 aa  156  7e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0218  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 
112 aa  156  7e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.601689  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5933  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 
112 aa  156  8e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7409  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 
112 aa  156  8e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.394693  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3161  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 
112 aa  156  8e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0791702  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2899  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 
112 aa  156  9e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0172484 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0846  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 
112 aa  156  9e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124556  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1130  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 
112 aa  156  9e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6587  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 
112 aa  156  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.490351 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3395  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 
112 aa  156  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0626  nitrogen regulatory protein  66.96 
 
 
112 aa  156  1e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1710  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 
133 aa  155  1e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.619022  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0642  nitrogen regulatory protein  66.96 
 
 
112 aa  156  1e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1074  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 
112 aa  155  1e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2590  nitrogen regulatory protein P-II  68.87 
 
 
112 aa  155  1e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0800  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 
112 aa  156  1e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0433  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 
112 aa  155  1e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0037358  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2036  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 
112 aa  156  1e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.504448  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>